评估NPR-C表达对冷暴露的响应
验证冷暴露是否改变NPR-C在eWAT和sWAT中的表达。
将WT小鼠置于RT或4°C环境72小时,通过qPCR、Western blot和免疫荧光检测NPR-C和UCP1表达。
Natriuretic peptide receptor-C perturbs mitochondrial respiration in white adipose tissue.
包含全身基因敲除小鼠模型、细胞敲低实验、RNA-seq、代谢表型测量及机制验证(AKT/p38通路、NPR-B依赖等)。
C57BL/6J小鼠 Npr3基因敲除小鼠 SVF诱导的白色脂肪细胞
冷暴露模型条件:8周龄雄性小鼠,4°C处理72小时 HF/HS饮食模型:4周龄雄性小鼠,D12266B饮食14周 AP-811处理:8周龄雄性小鼠,0.4 mg/kg/d腹腔注射7天 SVF细胞敲低模型:shNpr3或shNpr2转染,MOI=20,处理48小时 OCR测量:Seahorse XFe96,使用1μM寡霉素、2μM FCCP、0.5μM抗霉素A/鱼藤酮
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证冷暴露是否改变NPR-C在eWAT和sWAT中的表达。
将WT小鼠置于RT或4°C环境72小时,通过qPCR、Western blot和免疫荧光检测NPR-C和UCP1表达。
确定NPR-C缺陷是否影响体重、脂肪组织形态和产热基因表达。
比较WT和Npr3 KO小鼠的体重、组织重量、H&E染色、脂肪细胞大小,并通过qPCR、Western blot和免疫荧光检测产热相关基因和蛋白。
探究NPR-C缺陷在冷暴露下是否增强线粒体生物发生和功能。
对冷暴露后的WT和KO小鼠eWAT进行RNA-seq、qPCR、Western blot、NAD/NADH、ATP和mtDNA测量。
验证NPR-C缺陷是否改善饮食诱导的肥胖和代谢紊乱。
用HF/HS饮食喂养WT和KO小鼠14周,监测体重、组织重量、MRI脂肪含量、GTT/ITT、代谢笼和血脂水平。
确定NPR-C在体外对脂肪细胞线粒体功能的作用。
在SVF诱导的白色脂肪细胞中转染shNpr3,检测分化效率、UCP1和线粒体复合物表达、mtDNA含量、TEM和OCR。
阐明NPR-C影响线粒体功能所依赖的信号通路。
检测Npr3敲低后AKT和p38磷酸化水平,使用MK2206和SB203580抑制,并共敲低Npr2观察蛋白表达和OCR变化。
验证药理性抑制NPR-C是否模拟Npr3敲除的表型。
体外用AP-811处理SVF细胞检测信号通路;体内给WT小鼠注射AP-811一周,检测WAT重量、组织学、UCP1和线粒体复合物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| II型胶原酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| IBMX | -- | -- | |
| 胰岛素 | -- | -- | |
| 药物处理 | CL316,243 | MCE | HY-116771A |
| MK2206 | Selleck | S1078 | |
| SB203580 | MCE | HY-10256 | |
| 动物实验 | AP-811 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗NPR-C抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-515449 |
| 抗UCP1抗体 | Abcam | ab10983 | |
| Western blot | 抗NPR-B抗体 | Abclonal | A19255 |
| 抗PGC-1α抗体 | Abclonal | A19674 | |
| 抗OxPhos鸡尾酒抗体 | Invitrogen | 45-8099 | |
| 抗p-P38抗体 | CST | 4511S | |
| 抗P38抗体 | CST | 8690S | |
| 抗p-AKT抗体 | CST | 4060S | |
| 抗AKT抗体 | CST | 4691S | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | HRP-66031 | |
| ELISA | cAMP ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0056 |
| cGMP ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0083 | |
| 钙离子测定 | 钙离子测定试剂盒 | Beyotime | S1063S |
| NAD/NADH测量 | NADH检测试剂盒 | Abcam | ab65348 |
| ATP测量 | ATP含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0300 |
| NEFA测量 | NEFA测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A042-2-1 |
| 血脂测量 | 全自动生化分析仪 | Rayto Life and Analytical Science | Chemray 800 |
| 肝脏TG测量 | 甘油三酯测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Prime Script RT Master Mix试剂盒 | EZBioscience | -- | |
| qPCR | SYBR Premix Ex Taq | Vazyme | -- |
| DNA提取 | DNA提取试剂盒 | Vazyme | DC102 |
| 测序 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- |
| 荧光显微成像 | Axio Imager M2显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| 电子显微镜 | JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| OCR测量 | Seahorse XFe96分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与处理 | 小鼠品系、性别、年龄、冷暴露条件(温度、时间)、HF/HS饮食配方和持续时间、AP-811剂量和给药途径 阅读提示:见Materials and Methods中的Animals和Metabolic studies部分 |
| 细胞培养与分化 | SVF分离方法、分化诱导剂浓度、shRNA转染条件和MOI值 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell culture部分 |
| 线粒体功能检测 | OCR测量的药物浓度(oligomycin、FCCP、antimycin A/rotenone)、mtDNA检测引物和内参基因 阅读提示:见Materials and Methods中的Oxygen consumption rate measurements和Mitochondrial number detection部分 |
| 信号通路分析 | Western blot抗体信息、抑制剂浓度(MK2206、SB203580)、cAMP/cGMP/钙测量方法 阅读提示:见Materials and Methods中的Western blot和Measurement of cAMP, cGMP, and calcium levels部分 |
| 测序数据分析 | RNA-seq平台、比对参数、参考基因组版本、DEG筛选阈值 阅读提示:见Materials and Methods中的RNA-sequencing and bioinformatics analysis部分 |