构建CPVA犬模型及电生理检测
建立环肺静脉消融后长期模型并评估心电生理改变
将10只比格犬随机分为CPVA组和假手术组,术后观察6个月,进行电生理检查检测AERP和房颤诱导性。
Multiomics analysis of canine myocardium after circumferential pulmonary vein ablation: Effect of neuropeptide Y on long-term reinduction of atrial fibrillation.
包含犬CPVA模型、电生理检测、转录组与蛋白质组、组织学验证及体外细胞实验,但缺乏体内干预实验,主要机制验证仅限于体外。
比格犬环肺静脉消融模型 原代大鼠心房肌细胞 原代大鼠心脏成纤维细胞
CPVA组犬心房AERP在6个月时从117ms缩短至92ms CPVA组纤维化相关蛋白Fibronectin1、Collagen III、FAP、Vimentin、α-SMA表达升高及Masson和天狼星红染色胶原面积增加 NPY浓度梯度处理原代心房肌细胞,CCK-8确定150nM最佳,流式检测凋亡及Western blot检测Bcl2/Bax
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立环肺静脉消融后长期模型并评估心电生理改变
将10只比格犬随机分为CPVA组和假手术组,术后观察6个月,进行电生理检查检测AERP和房颤诱导性。
筛选CPVA后差异表达基因和蛋白及富集通路
提取靶心房组织RNA进行RNA-seq,蛋白质进行TMT标记LC-MS/MS,鉴定DEGs和DEPs,并进行GO和KEGG富集分析。
验证CPVA后心房组织纤维化程度及NPY变化
Western blot和qRT-PCR检测NPY表达,Western blot检测纤维化相关蛋白,Masson和天狼星红染色评估纤维化程度。
探究NPY对原代心房肌细胞凋亡和成纤维细胞活化的影响
分离原代大鼠心房肌细胞和成纤维细胞,用不同浓度NPY处理,通过CCK-8、流式细胞术、Western blot和免疫荧光检测凋亡和纤维化指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Magen | R4801-02 |
| RNA质量检测 | Nanodrop分光光度计 | ThermoFisher | ND-2000 |
| RNA完整性检测 | Agilent 4150生物分析仪 | Agilent Technologies Inc. | -- |
| 蛋白组学 | 高pH反相肽分馏试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| Empore SPE C18小柱 | Sigma | -- | |
| 心肌细胞分离 | 无EDTA胰蛋白酶 | Solarbio | -- |
| 心肌细胞培养 | 溴脱氧尿苷 | Sigma | -- |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Elabscience | -- |
| 药物处理 | 神经肽Y | MCE | HY-P0198A |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Yeasen Biotechnology | -- |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗淬灭剂 | Servicebio | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 磷酸酶抑制剂 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Beyotime Biotechnology | -- | |
| β-肌动蛋白抗体 | CST | 3700 | |
| NPY抗体 | CST | 11976 | |
| 纤连蛋白1抗体 | Abcam | ab268020 | |
| III型胶原抗体 | Proteintech | 22734-1-AP | |
| 成纤维细胞活化蛋白抗体 | Abcam | ab314456 | |
| 波形蛋白抗体 | Abcam | ab92547 | |
| α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Proteintech | 55135-1-AP | |
| Bcl2抗体 | Proteintech | 26593-1-AP | |
| Bax抗体 | CST | 2772 | |
| I型胶原抗体 | Abcam | ab260043 | |
| 转化生长因子β1抗体 | Abcam | ab215715 | |
| 磷酸化Akt Ser473抗体 | CST | 4060 | |
| Akt抗体 | CST | 4691 | |
| qRT-PCR | 逆转录试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 实时定量PCR试剂盒 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CPVA模型构建 | 犬种、体重、分组(CPVA组和对照组各5只)、手术方式(右第四肋间开胸)、消融导管(7Fr,4mm尖端)、消融终点(左PV根部连续消融线)、术后观察时间(6个月) 阅读提示:Methods 2.2节及图1A、B |
| 电生理检测 | AERP测定方法(S1-S2程序刺激,基础周期350ms,S2耦联间期200ms,步长5ms)、AF诱导定义(快速不规则心房律持续>10s)、电极位置(左心房游离壁、高位左房、左心耳) 阅读提示:Methods 2.3节及图1C、E、F、G |
| 转录组和蛋白质组分析 | RNA提取方法(TRIzol)、建库方法(mRNA富集、片段化、cDNA合成、末端修复、PCR富集)、测序平台、差异表达阈值(DEGs:|log2FC|≥1,校正p<0.05;DEPs:|log2FC|≥0.26,p<0.05) 阅读提示:Methods 2.4-2.7节,补充材料Table S1、S2 |
| 原代细胞实验 | SD大鼠年龄(1-3天)、组织消化方法(0.08%无EDTA胰蛋白酶、0.08%胶原酶II)、NPY浓度(0、1、10、50、100、150、200、250、300 nM)、处理时间(48h)、CCK-8检测波长(450nm)、凋亡检测(Annexin V-FITC/PI)、Western blot检测靶蛋白 阅读提示:Methods 2.9-2.13节,图4 |