人体VAT中性粒细胞丰度检测
确定肥胖个体VAT中中性粒细胞是否增多及其与代谢指标的相关性。
纳入96名受试者(肥胖82名,瘦14名),通过流式细胞术检测SVF中CD45+细胞中中性粒细胞比例,并分析其与HOMA-IR及脂肪细胞炎症因子表达的相关性。
Obesity-associated microbiomes instigate visceral adipose tissue inflammation by recruitment of distinct neutrophils.
包含人体样本(VAT、血液)、小鼠模型(微生物组耗竭+粪便灌胃)、转录组分析、中性粒细胞耗竭功能验证及多组学数据,具有多层次证据。
人内脏脂肪组织(VAT) 人外周血中性粒细胞 小鼠微生物组耗竭+人粪便灌胃模型
VAT中性粒细胞百分比(CD45+细胞中) HFD或正常饮食的5天处理时间 粪便供体肥胖状态(BMI) αLy6G抗体中性粒细胞耗竭(1 g/kg,3次注射) 小鼠品系:C57BL/6(8周龄,雄性)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定肥胖个体VAT中中性粒细胞是否增多及其与代谢指标的相关性。
纳入96名受试者(肥胖82名,瘦14名),通过流式细胞术检测SVF中CD45+细胞中中性粒细胞比例,并分析其与HOMA-IR及脂肪细胞炎症因子表达的相关性。
验证VAT中是否存在细菌及其与肥胖的关联,并推测细菌来源。
在无菌条件下收集手术VAT样本(肥胖10例,瘦7例),扩增16S rRNA基因进行测序,并通过SourceTracker分析细菌来源。
在体内验证肥胖供体微生物组和高脂饮食是否决定VAT中性粒细胞增多。
用广谱抗生素和抗真菌药耗竭小鼠固有菌群,然后灌胃肥胖供体(n=4)或瘦供体(n=3)粪便或生理盐水,给予HFD或正常饮食5天,检测VAT中性粒细胞和细菌载荷。
确定中性粒细胞在VAT炎症进展中的因果作用。
在灌胃和HFD开始前后给予小鼠αLy6G抗体(1g/kg)3次,检测中性粒细胞、T细胞变化及胰岛素敏感性。
揭示VAT中性粒细胞的特异性表达谱,并建立可应用于bulk数据的特征工具。
从同一受试者分离PB和VAT中性粒细胞进行转录组测序,与公开数据集比较,利用CIBERSORT建立VIN特征,并应用于GTEx和TCGA数据。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脂肪组织处理 | 胶原酶缓冲液 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 外周血中性粒细胞分离 | Ficoll分离液 | -- | -- |
| 葡聚糖 | -- | -- | |
| RNA提取 | Quick-RNA提取试剂盒 | Zymo Research | -- |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料eFluor 506 | eBioscience | 65-0866-14 |
| 血浆标志物检测 | 胰岛素ELISA试剂盒 | EMD Millipore | EZHI-14K |
| 脂联素ELISA试剂盒 | EMD Millipore | EZHADP-61K | |
| 瘦素ELISA试剂盒 | EMD Millipore | EZHL-80SK | |
| LPS ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-E09945h | |
| 连蛋白ELISA试剂盒 | Cusabio | CSB-EQ027649HU | |
| LBP ELISA试剂盒 | R&D Systems | DY870-05 | |
| 葡萄糖测定试剂盒 | Stanbio Laboratory | REF#1070-125 | |
| 16S测序 | AllPrep DNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| QIAseq文库制备试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| MiSeq v3试剂盒 | Illumina | -- | |
| PowerLyzer 24组织破碎仪 | -- | -- | |
| KAPA HiFi聚合酶 | -- | -- | |
| AC600 PCR操作柜 | AirClean Systems | -- | |
| 人类体重增加协议 | 人连蛋白ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H5560 |
| 小鼠实验 | 抗生素混合物 | MilliporeSigma | -- |
| 抗真菌药 | MilliporeSigma | A2942 | |
| 高脂饮食(D12492) | Research Diets | D12492 | |
| 小鼠中性粒细胞耗竭 | 体内抗小鼠Ly6G抗体 | Bio X cell | BE0075-1 |
| 小鼠流式 | ACK裂解缓冲液 | Biolegend | 420302 |
| 转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | 00-5523-00 | |
| 可固定活力染料Zombie yellow | Biolegend | 423104 | |
| 小鼠组织消化 | IV型胶原酶 | ThermoFisher | 17104019 |
| 脱氧核糖核酸酶I | MilliporeSigma | 10104159001 | |
| 小鼠流式 | 抗CD16/32抗体 | BD | 553141 |
| Cytofix固定缓冲液 | BD | 554655 | |
| 基因表达分析 | Zymo Research RNA提取试剂盒 | Zymo Research | R2052 |
| BIOLINE cDNA合成试剂盒 | BIOLINE | BIO65053 | |
| BIOLINE SensiFAST SYBR预混液 | BIOLINE | BIO-98020 | |
| 流式细胞仪 | BD FACSAria III细胞分选仪 | BD | -- |
| BD LSRII流式细胞仪 | BD | -- | |
| Cytek Aurora流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| BD LSR Fortessa流式细胞仪 | BD | -- | |
| 组织学 | 蔡司Axio Observer正置显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人体VAT中性粒细胞检测 | VAT样本收集在手术时、肠道操作前;流式细胞术分析SVF中CD45+细胞的中性粒细胞比例。 阅读提示:Methods: 'Human subjects study design', 'Adipose tissue processing', 'Human blood and VAT flow cytometry and sorting' |
| VAT细菌16S测序 | 样本无菌收集,立即冻存;DNA提取使用AllPrep试剂盒,V3-V4引物扩增,MiSeq测序。 阅读提示:Methods: 'Bacterial Amplicon (16S) sequencing and analysis' |
| 小鼠模型 | C57BL/6雄性8周龄,广谱抗生素+抗真菌处理4天,灌胃200μl粪便悬浮液,HFD或正常饮食5天。 阅读提示:Methods: 'Mouse experiments' |
| 中性粒细胞耗竭实验 | αLy6G抗体(1g/kg)腹腔注射,于-1、1、2天给药;检测血糖和ITT。 阅读提示:Methods: 'Mouse experiments', 'Mouse insulin tolerance test (ITT)' |
| 转录组分析 | PB和VAT中性粒细胞分离方法(Ficoll/流式分选),RNA提取和测序流程。 阅读提示:Methods: 'Neutrophil isolation', 'Expression analysis and comparison to other neutrophil activation types' |