肠道菌群来源的乙酸通过保护气道紧密连接减轻流感感染引起的肺损伤

Gut microbiota-derived acetate attenuates lung injury induced by influenza infection via protecting airway tight junctions.

作者信息Lei Hu, Li Sun, Chun Yang, Da-Wei Zhang, Yuan-Yuan Wei, Ming-Ming Yang, Hui-Mei Wu, Guang-He Fei
PMID38879538
发布时间2024-06-15
DOI10.1186/s12967-024-05376-4

实验完整度

高

包含临床样本分析、16S rRNA测序、小鼠体内模型(GM耗竭、FMT、乙酸干预)、细胞体外模型(HBE细胞)及机制验证(GPR43敲低、AMPK抑制),多层级证据验证功能与机制。

主要模型

C57BL/6J小鼠流感感染模型 人支气管上皮细胞(HBE) IAV患者及匹配对照人群

重点核对

流感病毒:H3N2(A/Anhui/1/2017),感染剂量100 PFU(50 μl PBS),鼻内接种 GM耗竭:广谱抗生素混合物(氨苄青霉素1 g/l、甲硝唑1 g/l、新霉素1 g/l、万古霉素0.5 g/l)饮水3周 FMT:供体粪便悬液(0.125 g/ml)100 μl灌胃,连续3天 乙酸处理:饮水中100或200 mM,感染前1周开始 GPR43敲低:shRNA慢病毒感染HBE细胞,MOI 20

摘要

背景:肠道菌群(GM)被认为是呼吸道甲型流感病毒(IAV)感染时常伴随的胃肠道症状的重要调节因子,提示肠-肺轴参与宿主对IAV的反应。IAV主要破坏气道上皮紧密连接(TJs),从而导致急性呼吸窘迫综合征。已知GM及其代谢产物具有抗流感作用,但其在IAV诱导的气道上皮完整性中的作用尚不清楚。方法:建立了IAV感染小鼠模型。使用16S rRNA基因测序分析GM,并测定短链脂肪酸(SCFAs)水平。进行GM耗竭和粪菌移植(FMT)以验证GM在IAV感染中的作用。进行配对喂养实验以揭示IAV诱导的GM失调是否归因于食物摄入减少。此外,人支气管上皮(HBE)细胞在有无乙酸的情况下与IAV共培养。通过旁细胞通透性和跨上皮电阻(TEER)分析TJs功能。在转染G蛋白偶联受体43(GPR43)短发夹RNA(shRNA)的HBE细胞中评估乙酸如何影响TJs完整性的机制。结果:IAV感染小鼠表现出产乙酸菌(Bacteroides、Bifidobacterium和Akkermansia)相对丰度降低,肠道和血清中乙酸水平降低。这些变化部分由食物消费减少(由于厌食)引起。GM耗竭加剧了IAV诱导的肺部炎症损伤,而FMT则恢复了损伤。IAV感染抑制了TJs(occludin、ZO-1)的表达,导致气道上皮屏障功能破坏,表现为TEER降低和通透性增加。乙酸预处理激活GPR43,部分恢复IAV诱导的气道上皮屏障功能,并降低炎性细胞因子水平(TNF-α、IL-6和IL-1β)。在转染GPR43 shRNA的HBE细胞中,乙酸的这种保护作用消失。乙酸和GPR43以AMP活化蛋白激酶(AMPK)依赖性方式改善TJs。结论:总之,我们的结果表明GM通过调节GPR43-AMPK信号通路保护气道TJs免受IAV诱导的肺损伤。因此,改善GM失调可能成为IAV感染患者的潜在治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
肠道菌群及其代谢产物是否通过影响气道上皮紧密连接来调节甲型流感病毒引起的肺损伤?
核心机制
肠道菌群来源的乙酸通过激活GPR43受体,进而磷酸化AMPK,保护气道紧密连接(occludin和ZO-1)的表达和功能,减轻IAV诱导的肺损伤。
主要证据
IAV感染小鼠及患者中产乙酸菌丰度和乙酸水平降低;GM耗竭加剧、FMT转移肺损伤;乙酸干预提高TJs表达、降低通透性和炎症因子;GPR43敲低或AMPK抑制消除乙酸保护效应。
研究意义
改善肠道菌群失调可能成为IAV感染患者的潜在治疗靶点,乙酸可能作为治疗IAV感染所致急性肺损伤的重要制剂。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立IAV感染模型并分析菌群变化

验证IAV感染是否改变肠道菌群组成和SCFAs水平。

C57BL/6J小鼠鼻内感染H3N2病毒,收集粪便和血清进行16S rRNA测序,测定SCFAs含量。

2

GM耗竭和FMT验证菌群因果作用

证实肠道菌群在IAV感染中的因果作用。

使用广谱抗生素清除小鼠GM,随后进行FMT移植MOCK或H3N2小鼠粪便,观察肺损伤严重程度和乙酸水平。

3

乙酸干预体内实验

评估乙酸对IAV感染小鼠肺损伤和气道紧密连接的保护作用。

感染前1周给予小鼠饮水中乙酸(100或200 mM)或对照,感染后评估组织病理、细胞因子、通透性和紧密连接蛋白表达。

4

体外细胞模型验证乙酸的直接作用

确定乙酸对支气管上皮细胞紧密连接的保护作用是否直接。

HBE细胞感染H3N2,并用不同浓度乙酸处理,检测TEER、通透性、紧密连接蛋白表达。

5

机制验证:GPR43-AMPK通路

验证GPR43和AMPK是否介导乙酸的保护作用。

使用shRNA敲低HBE细胞GPR43,或使用AMPK抑制剂Compound C,检测紧密连接功能和信号蛋白磷酸化。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
基因组DNA提取试剂盒Omega Bio-TekM5636-02
TRIzol试剂Ambion15596-018
cDNA合成试剂盒Yeasen Biotech11201ES08
RIPA裂解液----
β-肌动蛋白抗体Abcamab227387
ZO-1抗体InvitrogenZO1-1A12
Occludin抗体Abcamab216327
GPR43抗体Santa Cruzsc-293202
AMPK抗体Cell Signaling Technology5832
p-AMPK抗体Cell Signaling Technology2535
增强化学发光试剂Epizyme Biomedical TechnologySQ201
抗小鼠IgG H&L (Alexa Fluor 594)----
抗兔IgG H&L (Alexa Fluor 488)----
Transwell小室Corning3460
上皮组织电压欧姆表 (EVOM2)World Precision Instruments--
FITC-葡聚糖Sigma-Aldrich46944
乙酸Sigma-AldrichS2889
Compound C----
小鼠TNF-α ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-M3063
小鼠IL-6 ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-M0044c
小鼠IL-1β ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-M0037c
GraphPad Prism 8.0.2----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本收集
IAV患者和对照的样本量、匹配条件(年龄、性别、BMI)
阅读提示:Methods: Human study design
病毒扩增和感染
病毒株(H3N2 A/Anhui/1/2017)、扩增方法(鸡胚和MDCK细胞)、剂量(100 PFU)和给药途径(鼻内)
阅读提示:Methods: Virus strains and cells; Animal model
GM耗竭模型
抗生素种类和浓度、处理时间(3周)、停药后感染时间(3天)
阅读提示:Methods: Animal model; Results: Fig. 2
FMT实验
粪便制备浓度(0.125 g/ml PBS)、灌胃体积(100 μl)、次数(连续3天)、分析时间点(48h)
阅读提示:Methods: Animal model; Results: Fig. 3
乙酸干预
乙酸浓度(100, 200 mM)、给药方式(饮水)、持续时间(感染前1周)
阅读提示:Methods: Animal model; Results: Fig. 4
细胞实验
HBE细胞培养条件、感染复数(MOI=4)、处理时间(24h)、乙酸浓度(10 mM)
阅读提示:Methods: Virus strains and cells; Results: Fig. 6
屏障功能检测
TEER测量设备和方法、FITC-dextran浓度(1 mg/ml)、孵育时间(2h)
阅读提示:Methods: TEER; Permeability assay
GPR43敲低
shRNA序列、慢病毒MOI(20)、感染时间(3天)
阅读提示:Methods: Lentiviral infection; Results: Fig. 7