检测星形胶质细胞糖自噬通量
明确脑缺血再灌注后星形胶质细胞糖自噬是否发生功能障碍。
采用电子显微镜观察糖自噬相关囊泡数量,检测溶酶体糖原水平和总糖原水平,在小鼠MCAO/R模型和人体脑组织中进行。
Dysfunction of astrocytic glycophagy exacerbates reperfusion injury in ischemic stroke.
包含人体样本、小鼠模型、原代细胞及类器官样共培养等多层级证据,并明确功能验证和机制研究。
小鼠MCAO/R模型 原代星形胶质细胞OGD/R模型 星形胶质细胞-神经元共培养体系 缺血性脑卒中患者脑组织样本
小鼠MCAO/R模型中,60分钟缺血后灌注时间点需确认 GABARAPL1过表达或敲低慢病毒MOI=100,感染48小时 低糖培养条件:2.5 mM葡萄糖孵育时间需核实 LY294002终浓度40 μM,于OGD/R后立即加入 统计检验:至少三次重复,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确脑缺血再灌注后星形胶质细胞糖自噬是否发生功能障碍。
采用电子显微镜观察糖自噬相关囊泡数量,检测溶酶体糖原水平和总糖原水平,在小鼠MCAO/R模型和人体脑组织中进行。
探索缺血再灌注后GABARAPL1下调的上游信号通路和转录因子调控。
利用反向ChIP-MS和RNA测序筛选GABARAPL1启动子相关转录因子和KEGG通路,并用Western blot验证PI3K-Akt通路及下游转录因子;使用PI3K抑制剂LY294002验证通路作用。
确定糖自噬功能障碍产生的氨基葡萄糖缺乏是否通过O-GlcNAc糖基化调节GABARAPL1转录因子核转位。
通过构建rGAA降解溶酶体糖原,测定葡萄糖和氨基葡萄糖产量;过表达GABARAPL1或敲低GAA,检测糖自噬通量、氨基葡萄糖水平、UDP-GlcNAc水平、SP1和TBP的O-GlcNAc糖基化及核转位。
评估星形胶质细胞特异性过表达GABARAPL1对缺血性脑卒中再灌注损伤的影响。
构建他莫昔芬诱导的星形胶质细胞特异性GABARAPL1过表达转基因小鼠,并进行MCAO/R操作;通过TTC染色评估梗死体积,通过行为学测试评估神经功能,并通过Golgi染色观察树突棘。
明确恢复糖自噬如何改善周围神经元的存活和功能。
使用星形胶质细胞-神经元共培养体系,检测经OGD/R处理后神经元的存活率、氧化应激指标、神经突分支;并干扰γ-GT来区分GSH和氨基葡萄糖的作用。
探索能量限制策略是否能增强星形胶质细胞糖自噬并改善卒中后恢复。
在体外OGD/R后更换低糖培养基,在体内采用低热量饮食一周,检测糖自噬通量、梗死体积和神经行为学。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11885092 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 16140071 | |
| 胰蛋白酶 | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
| 多聚-D-赖氨酸 | Sigma-Aldrich | P0296 | |
| 神经元培养 | 神经元基础培养基 | Thermo Fisher Scientific | A2477501 |
| B-27添加剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| 葡萄糖 | Thermo Fisher Scientific | A2494001 | |
| 共培养 | 悬挂式带孔膜插入物(3 μm) | Millipore | PTSP24H48 |
| 低糖培养 | 无糖DMEM | Thermo Fisher Scientific | A1443001 |
| 动物模型 | 线栓 | RWD Life Sciences | MSMC21B100PK50 |
| 免疫荧光 | DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 |
| 蔗糖 | Sigma-Aldrich | S9378 | |
| 免疫组化 | Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T8787 |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1933 | |
| TTC染色 | TTC溶液 | MP Biomedicals | 02103126-CF |
| 高尔基染色 | FD快速高尔基染色试剂盒 | FD NeuroTechnologies | PK401 |
| 代谢物检测 | 氨基葡萄糖检测试剂盒 | Megazyme | K-GAMINE |
| 葡萄糖检测试剂盒 | Abcam | ab65333 | |
| 6-磷酸葡萄糖检测试剂盒 | Abcam | ab83426 | |
| NADPH检测试剂盒 | Abcam | ab176724 | |
| GSH检测试剂盒 | Abcam | ab65322 | |
| 活性氧检测试剂盒 | Abcam | ab287839 | |
| PRPP检测试剂盒 | Novocib | K0709-04-2 | |
| UDP-GlcNAc ELISA试剂盒 | Meikebio | MK0034MA | |
| 糖原检测 | 糖原检测试剂盒 | Abcam | ab169558 |
| 溶酶体分离 | 溶酶体富集试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89839 |
| 酶活性检测 | 酸性α-葡萄糖苷酶活性检测试剂盒 | Abcam | ab252887 |
| γ-谷氨酰转肽酶活性检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K126-M | |
| 核质分离 | 核质提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| 免疫沉淀 | Pierce Co免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26149 |
| 细胞分选 | 成人脑解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-107-677 |
| 抗ACSA-2微珠试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-097-678 | |
| DNA损伤检测 | 彗星实验试剂盒 | Abcam | ab238544 |
| 反向ChIP | 反向ChIP试剂盒 | Bersin Bio | Bes5005 |
| PCR | DNA提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K182002 |
| DNA聚合酶 | Takara Bio Inc. | RR370A | |
| 超纯琼脂糖 | Thermo Fisher Scientific | 16550100 | |
| 代谢组学 | 碳酸氢铵 | Sigma-Aldrich | A6141 |
| 甲醇 | Sigma-Aldrich | 439193 | |
| 代谢通量分析 | 13C标记葡萄糖 | Sigma-Aldrich | 389374 |
| RNA测序 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596026 |
| 重组蛋白表达 | Dynabeads His标签分离和下拉试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 10104D |
| 双荧光素酶报告 | pRL-TK质粒 | Promega | E2241 |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| 细胞毒性检测 | 乳酸脱氢酶细胞毒性检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | C20301 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Sigma-Aldrich | 96992 |
| Western blot | 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2146 | |
| 药理学 | LY294002 | Sigma-Aldrich | 440202 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠MCAO/R模型 | 小鼠品系(C57BL/6J,雄性,8周龄),麻醉(1.4%异氟烷),线栓插入时间(60分钟),再灌注时间(如12小时) 阅读提示:Materials and methods 2.7 I/R model in mice |
| 原代星形胶质细胞OGD/R模型 | 新生小鼠年龄(1天),OGD持续时间(2小时),厌氧气体(5% CO2和95% N2),再氧合时间(12小时),低糖DMEM(2.5 mM葡萄糖) 阅读提示:Materials and methods 2.6 Low-glucose culture 和 2.8 In vitro I/R model |
| 星形胶质细胞-神经元共培养 | 共培养插入物孔径(3 μm),神经元来源(胚胎15-16天),培养基成分(无糖Neurobasal + 15% FBS + 2% B27 + 5.56 mM葡萄糖 + 1%谷氨酰胺),OGD时间(2小时) 阅读提示:Materials and methods 2.5 Astrocyte–neuron coculture system |
| GABARAPL1过表达/敲低 | 慢病毒MOI(100),感染时间(48小时),siRNA序列(GABARAPL1: TGGCCAGTTCTACTTCTTAAT; GAA: CAAGAACAATACCATTGTGAA; γ-GT: TCCCTCAATCATCCTGGATAA) 阅读提示:Materials and methods 2.29-2.33 |
| PI3K抑制剂处理 | LY294002浓度(40 μM),加入时间(OGD/R后立即) 阅读提示:Materials and methods 2.39 Drug |