铁死亡相关长链非编码RNA特征作为胶质瘤新型预后模型的鉴定与验证

背景：铁死亡是一种新发现的受调控的细胞死亡形式，具有独特的性质和识别功能，参与生理状况或包括癌症在内的多种疾病。然而，胶质瘤与铁死亡相关长链非编码RNA（FRLs）之间的关系仍不清楚。方法：我们从癌症基因组图谱（TCGA）和基因型组织表达（GTEx）数据库共收集了1850个样本，包括698个肿瘤样本和1152个正常样本。从FerrDb网站下载了铁死亡相关基因列表。使用R软件中的“limma”包分析差异表达的FRLs（DEFRLs）。随后，通过单变量Cox分析获得预后相关的FRLs。最后，使用Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子（LASSO）算法构建基于3个FRLs的预后模型。使用受试者工作特征（ROC）曲线分析和Kaplan-Meier（K-M）生存曲线分析评估模型的预后能力。此外，我们进一步探讨了免疫景观和体细胞突变与预后模型特征的关系。最后，我们在体外验证了LINC01426的功能。结果：我们成功构建了3-FRLs特征，并根据该特征计算的风险评分将胶质瘤患者分为高风险组和低风险组。与传统临床病理特征[年龄、性别、分级、异柠檬酸脱氢酶（IDH）状态]相比，该模型的预后准确性更稳定、更强。此外，该模型对5年总生存期具有稳定的预测能力。另外，我们发现两组在细胞免疫、许多免疫细胞（包括NK细胞、CD4+、CD8+ T细胞和巨噬细胞）的数量以及许多免疫相关基因的表达方面存在显著差异。最后，两组在体细胞突变水平上也存在显著差异，尤其是在胶质瘤预后相关基因如IDH1和ATRX中，高风险组的突变率较低，导致预后较差。最后，我们发现敲低LINC01426表达后，胶质瘤细胞的铁死亡过程被抑制。结论：提出的3-FRL特征是一种有前景的生物标志物，可预测胶质瘤患者的预后特征。