受试者招募与分组
比较肥胖与非肥胖受试者的表观遗传和心血管参数差异。
招募356名健康受试者,根据BMI分为肥胖组和非肥胖组,收集临床和生化数据。
Adiponectin Related Vascular and Cardiac Benefits in Obesity: Is There a Role for an Epigenetically Regulated Mechanism?
该研究为观察性关联研究,包含人体样本的甲基化、miRNA及影像学检测,但缺乏功能验证或机制干预实验。
健康受试者外周血白细胞 356名健康受试者队列
受试者肥胖状态(BMI≥30 kg/m2) DNA甲基化检测方法(焦磷酸测序) 血浆脂联素水平 体脂含量(生物电阻抗分析) 心血管参数(IMT、LVMI、MPI)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较肥胖与非肥胖受试者的表观遗传和心血管参数差异。
招募356名健康受试者,根据BMI分为肥胖组和非肥胖组,收集临床和生化数据。
获取受试者的体脂含量和心血管相关指标。
进行人体测量(BMI、腰围等)、生物电阻抗分析(BIA)评估体脂;超声测量颈动脉IMT;超声心动图评估LVM、LVEF和MPI。
测量炎症标志物和脂联素水平。
使用ELISA试剂盒检测血浆脂联素、IL-6和TNF-α水平;测量空腹血糖、血脂等。
检测外周血白细胞中IL-6和NF-kB基因启动子区域的甲基化水平。
提取DNA,进行亚硫酸氢盐转化,然后使用焦磷酸测序分析特定CpG位点的甲基化百分比。
测量血浆中miRNA-21的水平。
提取总RNA,逆转录,使用实时定量PCR检测miRNA-21表达。
分析表观遗传标志物与临床参数的相关性及独立预测因素。
使用ANOVA比较组间差异,Pearson/Spearman相关分析,多元线性回归分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ELISA检测 | 人脂联素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-H6122 |
| 人IL-6 ELISA试剂盒 | Diaclone | 950.030.192 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Diaclone | 950.090.192 | |
| DNA提取 | QIAamp DNA血液迷你试剂盒 | Qiagen | 51104 |
| DNA甲基化分析 | EZ DNA甲基化试剂盒 | Zymo Research | D5001 |
| PyroMark PCR试剂盒 | Qiagen | 978703 | |
| PyroMark Q48高级CpG试剂 | Qiagen | 974022 | |
| PyroMark Q48自动制备仪 | Qiagen | -- | |
| miRNA检测 | miReasy迷你试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| QIAexpert分光光度计 | Qiagen | 1038703 | |
| TaqMan MicroRNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4366597 | |
| Rotor-Gene Q实时荧光定量PCR仪 | Qiagen | R0515102 | |
| PrimeTime基因表达预混液 | IDT | 1055772 | |
| hsa-miR21-5p引物 | Applied Biosystems | 4440887 | |
| U6 snRNA引物 | Applied Biosystems | 4427975 | |
| 细胞分离 | Ficoll-Paque PLUS密度梯度分离液 | GE Healthcare | -- |
| 超声检查 | PHILIPS iE33超声系统 | Philips | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 受试者招募 | 纳入标准:健康;排除标准:NYHA III-IV级、皮质类固醇治疗、抗肿瘤治疗等;样本量:356 阅读提示:Methods: Subjects' Enrolment |
| 人体测量 | BMI计算;腰围测量位置;血压测量方法 阅读提示:Methods: Anthropometric and Bioelectrical Impedance Analysis Measures |
| 生物电阻抗分析 | 设备型号:BIA 101 BIVA;电极放置位置;受试者体位 阅读提示:Methods: Anthropometric and Bioelectrical Impedance Analysis Measures |
| IMT测量 | 超声设备:PHILIPS iE33;测量部位:颈总动脉、分叉、颈内动脉;测量方法 阅读提示:Methods: IMT of Carotid Artery |
| 超声心动图 | 设备:Philips iE33;测量参数:LVM、LVEF、MPI;计算公式 阅读提示:Methods: Echocardiography |
| ELISA检测 | 试剂盒货号;血浆制备方法 阅读提示:Methods: Adiponectin and IL-6 and TNF-α ELISA Assay |
| DNA甲基化分析 | DNA提取试剂盒;亚硫酸氢盐转化试剂盒;焦磷酸测序仪器;引物序列;PCR条件;重复次数 阅读提示:Methods: Methylation Analysis |
| miRNA检测 | RNA提取试剂盒;逆转录试剂盒;qPCR仪器和试剂;内参基因 阅读提示:Methods: miRNA Detection |