亨廷顿病小鼠模型中多聚核糖体结构的进行性改变与核糖体停滞缓解因子的激活

Progressive alterations in polysomal architecture and activation of ribosome stalling relief factors in a mouse model of Huntington's disease.

作者信息Eva Martin-Solana, Irene Diaz-Lopez, Yamina Mohamedi, Ivan Ventoso, Jose-Jesus Fernandez, Maria Rosario Fernandez-Fernandez
PMID38565397
发布时间2024-06-01
DOI10.1016/j.nbd.2024.106488

实验完整度

研究结合三维电子断层扫描、qRT-PCR、Western blot和polysome profiling等多种技术,并包含体内模型和细胞转染验证,功能验证与机制验证均有覆盖。

主要模型

zQ175敲入小鼠模型 HEK293T细胞

重点核对

使用zQ175杂合小鼠及野生型对照,涵盖2、8、10、11月龄(部分实验用12或15月龄),需验证年龄匹配和基因型。 不同实验使用的动物数量不一:ET每组约3-4只,qPCR每组8只,WB每组7只,polysome分析每组4只,需核对具体信息。 细胞转染实验使用HEK293T细胞,质粒浓度为1或3 μg/孔,需验证转染效率和GFP蛋白表达水平。 关键检测指标包括多聚核糖体结构、eIF5A1/eIF5A2/羟腐胺修饰eIF5A1表达、40S/80S比率和polysome分布。

摘要

鉴于神经元高度极化的形态和功能单一性,神经元需要精确的蛋白质合成时空控制。蛋白质翻译的改变已被牵涉到多种神经系统和神经退行性疾病的发生和发展中,包括亨廷顿病(HD)。在本研究中,我们检测了来自zQ175敲入亨廷顿病小鼠模型纹状体组织中天然脑环境下多聚核糖体的结构。我们对不同年龄的HD模型和相应对照的高压冷冻和冷冻置换纹状体组织进行了三维电子断层扫描。电子断层扫描结果显示,小鼠模型中多聚核糖体结构逐渐重塑为更紧密的结构,这种效应与HD相关症状的出现和进展相吻合。异常的多聚核糖体结构与核糖体停滞现象相符。事实上,我们还检测到在zQ175模型中纹状体停滞缓解因子EIF5A2表达增加,以及eIF5A1、eIF5A2和羟腐胺修饰的eIF5A1(eIF5A1的活性形式)的积累增加。多聚核糖体沉降梯度显示,在zQ175模型纹状体样本中,40S核糖体亚基的相对积累和多聚核糖体分布存在差异。这些发现表明,蛋白质合成机制结构的变化可能构成与HD相关的翻译改变的基础,为理解疾病进展开辟了新途径。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
亨廷顿病是否伴随神经元内蛋白质合成机制的结构改变,这些改变是否与核糖体停滞相关?
核心机制
mHTT表达导致多聚核糖体结构紧密化,可能通过引发核糖体停滞,从而激活eIF5A停滞缓解因子,导致蛋白质合成机制功能异常。
主要证据
通过电子断层扫描显示zQ175小鼠纹状体多聚核糖体逐渐紧密化;qRT-PCR和Western blot证明eIF5A2表达及eIF5A1、eIF5A2和羟腐胺修饰eIF5A1水平升高;polysome梯度显示游离40S增加,且细胞转染实验证实病理长度CAG重复足以诱导类似现象。
研究意义
这些发现首次揭示了HD中蛋白合成机器结构的改变,为理解HD的发病机制提供了新视角。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

电子断层扫描分析多聚核糖体结构

在天然脑环境中检测纹状体神经元中多聚核糖体的三维结构及其随年龄和基因型的变化。

使用高压冷冻和冷冻置换技术处理纹状体组织,通过电子断层扫描获取300 nm厚切片的倾斜系列,利用IMOD软件重建三维结构,并通过Laplacian of Gaussian算法自动识别核糖体,结合Ripley's K函数进行空间分布分析。

2

qRT-PCR检测停滞相关基因表达

验证zQ175小鼠纹状体中核糖体停滞相关因子(EIF5A1、EIF5A2、DHPS、DOHH)的表达是否改变。

收集12月龄zQ175杂合小鼠和野生型对照的纹状体样本,提取RNA,反转录后使用SYBR Green进行qRT-PCR,以YWHAZ为内参,分析mRNA相对表达量。

3

Western blot检测eIF5A蛋白积累

验证zQ175小鼠纹状体中eIF5A1、eIF5A2及羟腐胺修饰eIF5A1的蛋白水平。

收集15月龄zQ175杂合小鼠和野生型对照的纹状体组织,裂解后通过SDS-PAGE和Western blot检测eIF5A1、eIF5A2和羟腐胺修饰eIF5A1的积累,以总蛋白染色(Revert 700)作为上样对照。

4

多聚核糖体沉降梯度分析

分析zQ175小鼠纹状体中核糖体亚基和多聚核糖体的分布变化。

将9月龄小鼠纹状体组织(每基因型4只混合)匀浆后在蔗糖密度梯度(10-50%)中离心,连续监测254 nm吸光度,收集分部并进行Western blot检测RPS6和RPL7。

5

细胞转染验证mHTT效果

验证表达病理长度CAG重复的mHTT片段是否足以诱导多聚核糖体结构和40S亚基积累的类似改变。

在HEK293T细胞中转染pEGFP-Q23(23CAG)或pEGFP-Q74(74CAG)质粒,共转染pCMV-NP作为转染对照,转移后18小时或24小时分别进行Western blot和多聚核糖体沉降梯度分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
Stoelting组织切片机Stoelting Co.--
Leica EMPACT2Leica--
Leica AFS2 EM FSPLeica--
Leica Ultracut EM-UC6超薄切片机Leica--
JEOL JEM-1011电子显微镜JEOL--
Thermo Fisher Scientific Talos ArcticaThermo Fisher Scientific--
FEI Tecnai G2FEI--
胶体金(10 nm)Electron Microscopy Sciences--
Maxwell 16 LEV RNA组织提取试剂盒PromegaAS1280
iScript cDNA合成试剂盒Bio-Rad170-8891
Sso Fast EvaGreen SupermixBio-Rad172-5204
ValidPrime试剂盒TATAA BiocenterA105S10
抗eIF5A1抗体MerckSAB1402762
抗eIF5A2抗体Proteintech17069-1-AP
抗羟腐胺抗体MerckABS1064-I
抗RPS6抗体ElabscienceE-AB-32813
抗RPL7抗体ElabscienceE-AB-32805
抗羟腐胺抗体Creative BiolabsPABL-202
DMEM培养基SigmaD6429
非必需氨基酸SigmaM7145
两性霉素BGibco15290018
青霉素-链霉素SigmaP4333
庆大霉素SigmaG1397
RNA酶抑制剂New England BiolabsM0307S
Revert 700总蛋白染色LI-COR926-11021
IRDye 680RDLi-Cor925-68071
IRDye 800CWLi-Cor925-32210
AffiniPure山羊抗兔IgGJackson ImmunoResearch111-035-003
pEGFP-Q23质粒Addgene40261
pEGFP-Q74质粒Addgene40262
抗GFP抗体GenetexGTX113617
Clarity Western ECL底物Bio-Rad1705061
Odyssey Fc成像系统Li-Cor--
ChemiDoc Touch成像系统Bio-Rad--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
电子断层扫描样品制备
高压冷冻参数(如压力、冷却速度)、冷冻置换介质和温度程序、切片厚度、用于标记的金颗粒大小和浓度
阅读提示:材料与方法2.2和2.4,参考文献[21]
电子断层扫描成像
倾斜系列采集参数(倾斜范围、角度增量、像素尺寸)、使用的显微镜类型(Talos Arctica或Tecnai G2)及其像素尺寸
阅读提示:材料与方法2.4
qRT-PCR
RNA提取方法、逆转录条件、引物序列、内参基因选择(YWHAZ)、qPCR循环参数、样本量及统计方法
阅读提示:材料与方法2.6,表1和表2
Western blot
组织裂解缓冲液、上样量、抗体浓度和来源、膜类型和封闭条件、内参选择(总蛋白染色)
阅读提示:材料与方法2.9
多聚核糖体分析
组织采集和混合方式、匀浆条件(次数、缓冲液)、蔗糖梯度浓度和离心参数、检测波长、分级体积、核糖体蛋白检测方法
阅读提示:材料与方法2.8
细胞转染
细胞系、培养条件、转染试剂和用量、质粒浓度(1或3 μg)、转染时间(18或24小时)、转染效率评估
阅读提示:材料与方法2.7