抗体筛选与体外表征
从免疫供体中分离出能广谱中和SARS-CoV-2变体的单克隆抗体8-9D。
通过FACS分选RBD特异性记忆B细胞,获得118个单克隆抗体,并鉴定出8-9D具有广谱中和活性。通过BLI测定其与不同RBD的结合亲和力,并通过竞争实验判断其阻断ACE2结合的能力。
A lung-selective delivery of mRNA encoding broadly neutralizing antibody against SARS-CoV-2 infection.
包含体外中和实验、结构生物学(冷冻电镜)、体内小鼠模型(K18-hACE2)验证,以及LNP递送系统表征,多个独立证据层级。
HEK293T细胞 Vero细胞 K18-hACE2转基因小鼠 C57BL/6小鼠
8-9D mRNA的LNP制剂(Lung-LNPs vs Liver-LNPs) 小鼠品系(K18-hACE2)和性别(雌性) SARS-CoV-2攻击剂量与毒株(Beta、Omicron BA.2,2×10^4 TCID50) 给药剂量(5μg mRNA)和时间(攻击前24小时) 病毒载量检测(qRT-PCR)和组织病理学评估
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从免疫供体中分离出能广谱中和SARS-CoV-2变体的单克隆抗体8-9D。
通过FACS分选RBD特异性记忆B细胞,获得118个单克隆抗体,并鉴定出8-9D具有广谱中和活性。通过BLI测定其与不同RBD的结合亲和力,并通过竞争实验判断其阻断ACE2结合的能力。
阐明8-9D广谱中和活性的结构基础。
通过冷冻电镜解析了8-9D Fab与Omicron BA.5刺突蛋白复合物的结构,分析了表位特征、氢键网络以及与ACE2结合位点的重叠情况。
构建能特异性地将mRNA递送到肺部的LNP系统,并验证其器官选择性。
合成了可电离脂质和靶向脂质,制备了Lung-LNPs和Liver-LNPs,并测试了负载荧光素酶或eGFP mRNA后的粒径、电荷、稳定性以及在体内的分布。
验证8-9D mRNA在体外细胞和体内小鼠中的表达,并评估其引起的免疫反应。
在HEK293T细胞中验证了8-9D mRNA的表达,并通过Western blot和免疫荧光检测。在C57BL/6小鼠中注射LNP包裹的mRNA后,检测了血清、BALF、肺和肝脏中的抗体水平,并分析了细胞因子水平和肺内免疫细胞浸润。
评估肺选择性递送8-9D mRNA对SARS-CoV-2感染的预防和治疗效果。
使用K18-hACE2转基因小鼠,在感染前或感染后24小时静脉注射LNP包裹的8-9D mRNA,然后进行SARS-CoV-2攻击,检测病毒载量和肺部病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抗体筛选 | Ficoll密度梯度分离液 | GE Healthcare | 17144002 |
| 胎牛血清 | Hyclone | SH30084.03 | |
| 二甲基亚砜 | Sigma | D2650-100ML | |
| 假病毒中和试验 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | 11668-019 |
| Bright-Lite荧光素酶检测系统 | Vazyme | DD1204 | |
| 活病毒中和试验 | Vero细胞 | ATCC | CCL-81 |
| 抗体筛选 | 泛B细胞分离试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-101-638 |
| 生物素化的SARS-CoV-2刺突蛋白RBD | Acro Biosystems | SPD-C82E9 | |
| Human TruStain FcX Fc受体阻断剂 | Biolegend | 422302 | |
| 抗CD19-FITC抗体 | Biolegend | 363008 | |
| 抗CD3-Pacific Blue抗体 | Biolegend | 300431 | |
| 抗CD8-Pacific Blue抗体 | Biolegend | 301023 | |
| 抗CD14-Pacific Blue抗体 | Biolegend | 325616 | |
| 抗CD27-PerCP/Cyanine5.5抗体 | Biolegend | 356408 | |
| 链霉亲和素-APC | Biolegend | 405207 | |
| 链霉亲和素-PE | Biolegend | 405203 | |
| RNase抑制剂 | New England Biolabs | M0314L | |
| 抗体克隆 | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4368813 |
| 抗体表达 | HEK293F细胞 | Thermo Fisher Scientific | R79007 |
| 蛋白G琼脂糖珠柱 | Solarbio | R8300 | |
| BLI | 链霉亲和素生物传感器 | Molecular Devices | 18-5019 |
| PBS缓冲液 | Gibco | C10010500BT | |
| 人ACE2受体 | Sino Biological | 10108 | |
| 蛋白A生物传感器 | Octet | MSPP-185012 | |
| 蛋白表达与纯化 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 24765 |
| 木瓜蛋白酶 | Sigma | P3125 | |
| Superose 6 10/300凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- | |
| 甘油 | Sigma | G5516 | |
| 冷冻电镜 | Quantifoil碳膜微栅 | Quantifoil | -- |
| Vitrobot Mark IV | Thermo Fisher | -- | |
| Titan Krios电子显微镜 | FEI Company | -- | |
| mRNA合成 | ScriptCap Cap 1加帽系统 | CELLSCRIPT | C-SCCS1710 |
| DNase I | Takara | -- | |
| SDS-PAGE和Western blot | TransIT-mRNA转染试剂 | Mirus Bio | MIR-2250 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 31985062 | |
| 抗Flag标签兔单抗(HRP) | Proteintech | HRP-66008 | |
| 抗V5标签小鼠单抗 | GenScript | A01733 | |
| 脂质合成 | 油酸 | 文中未明确说明 | -- |
| LNP递送 | D-荧光素 | Yeasen | 40901ES01 |
| ELISA | HRP标记的抗人IgG | Invitrogen | A18817 |
| LNP表征 | Zetasizer Nano-ZS90粒度仪 | Malvern Instruments | -- |
| Hitachi HT-7700透射电镜 | Hitachi | -- | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料eFluor 780 | eBioscience | 65-0865-14 |
| 抗EpCAM抗体 | Biolegend | 118214 | |
| 抗CD45抗体 | Biolegend | 157605 | |
| 抗CD31抗体 | Biolegend | 102409 | |
| 细胞因子检测 | LEGENDplex多因子检测试剂盒 | Biolegend | 740446 |
| 免疫细胞分析 | LIVE/DEAD Ghost染料UV 450 | Tonbo Biosciences | 13-0868-T500 |
| 抗CD45-AF700抗体 | Invitrogen | 56-0451-82 | |
| 抗CD11c-AF488抗体 | Biolegend | 117313 | |
| 抗CD11b-Pacific Blue抗体 | Biolegend | 101223 | |
| 抗CD24-PE/Cyanine7抗体 | Elabscience | E-AB-F1179UH | |
| 抗CD64-PE抗体 | Elabscience | E-AB-F1186UD | |
| 抗I-A/I-E-AF647抗体 | Biolegend | 107618 | |
| 免疫荧光 | 抗Flag标签兔单抗 | Proteintech | 80010-1-RR |
| 抗V5标签小鼠单抗 | Invitrogen | 37-7500 | |
| Alexa Fluor 488标记的抗小鼠IgG(H+L) | Invitrogen | A-11001 | |
| Alexa Fluor 594标记的抗兔IgG(H+L) | Invitrogen | A-21207 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 临床化学分析 | Idexx VetTest 8008生化分析仪 | Idexx Laboratories | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism统计软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| LNP制备与表征 | Lung-LNPs和Liver-LNPs的脂质组成,mRNA与脂质的比例(40:1),水相与乙醇比例(3:1),粒径与zeta电位 阅读提示:参见Methods中'Lipid nanoparticle preparation'和'LNPs characterization',以及图3d-h |
| 抗体中和活性评估 | 假病毒中和试验中的起始抗体浓度和稀释倍数,活病毒中和试验中的病毒株和TCID50,细胞类型和培养条件 阅读提示:参见Methods中'Pseudovirus neutralization assay'和'Live SARS-CoV-2 neutralization',图1e-h |
| 体内表达与分布 | 小鼠品系和体重(C57BL/6,20-22g),mRNA剂量(5μg),给药途径(静脉注射),检测时间点(24h、2h、6h等) 阅读提示:参见Methods中'Luciferase or eGFP mRNA delivery',图3i-m |
| 小鼠保护实验 | K18-hACE2小鼠的年龄和性别(雌性,4-6周),攻击病毒株和剂量(Beta或Omicron BA.2,2x10^4 TCID50),给药时间(预防组攻击前24h,治疗组感染后24h),剂量(5μg),安乐死时间(感染后4天) 阅读提示:参见Methods中'SARS-CoV-2 challenge',图5a-f |