验证KSHV潜伏感染增强抗氧化能力
探究KSHV潜伏感染是否赋予B淋巴瘤细胞抗氧化应激能力。
用H2O2处理KSHV阴性和阳性B淋巴瘤细胞,检测细胞增殖(24-72h)、凋亡(Annexin V/PI染色)、caspase 3活化及ROS水平。
Targeting FoxO proteins induces lytic reactivation of KSHV for treating herpesviral primary effusion lymphoma.
包含体外细胞实验(增殖、凋亡、ROS检测、裂解再激活)、shRNA敲低、体内异种移植模型及机制验证(NAC回补),多层级验证完整。
KSHV阳性B淋巴瘤细胞系(BCBL1、BC3、BCP1) KSHV阴性Burkitt淋巴瘤细胞系(BJAB、DG75) KSHV潜伏感染的BJAB细胞(BJAB-KSHV) BCBL1-Luc异种移植NOD/SCID小鼠模型
FoxO1和FoxO3在KSHV阳性细胞中的蛋白表达水平(Fig 2A) AS1842856处理浓度(0, 1, 2, 5 μM)及时间(48h, 72h) shRNA敲低FoxO1或FoxO3的效率和特异性(S1 Fig) ROS水平检测使用H2DCFDA或c-H2DCFDA染色及流式分析 NAC(0.4 mM)对ROS和KSHV裂解再激活的逆转效果
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究KSHV潜伏感染是否赋予B淋巴瘤细胞抗氧化应激能力。
用H2O2处理KSHV阴性和阳性B淋巴瘤细胞,检测细胞增殖(24-72h)、凋亡(Annexin V/PI染色)、caspase 3活化及ROS水平。
确定FoxO蛋白在KSHV阳性细胞抗氧化防御中的作用。
检测FoxO1/3表达(Western blot),用AS1842856或shRNA抑制FoxO,检测ROS水平。
检验抑制FoxO是否抑制KSHV阳性细胞增殖并诱导凋亡。
用AS1842856或shRNA处理细胞,计数活细胞(台盼蓝染色),检测凋亡(Annexin V/PI染色、c-caspase 3 Western blot)。
探究抑制FoxO是否足以触发KSHV从潜伏期到裂解周期的转换。
用AS1842856或shRNA处理PEL细胞,检测裂解基因转录(RT-qPCR)、ORFK8蛋白表达(Western blot、免疫荧光)及病毒粒子产生(qPCR)。
确定FoxO抑制诱导的KSHV裂解再激活是否由ROS介导。
使用ROS清除剂NAC处理细胞,检测ROS水平和裂解基因表达及ORFK8蛋白。
检验AS1842856在异种移植小鼠模型中抑制肿瘤起始、进展及诱导消退的效果。
用BCBL1-Luc细胞建立NOD/SCID小鼠模型,腹腔注射AS1842856或对照,通过生物发光成像监测肿瘤生长,并检测腹水中FoxO、c-caspase 3和裂解基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | ExCell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 潮霉素 | -- | -- | |
| Western blot | FoxO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 |
| FoxO3抗体 | Cell Signaling Technology | 2497 | |
| 裂解的caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| β-肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC026 | |
| ORFK8抗体 | Santa Cruz | F33P1 | |
| 免疫荧光 | 多聚赖氨酸包被玻璃盖玻片 | WHB | 12-CS-LC |
| DAPI | Solarbio | C0060 | |
| 抗淬灭封片液 | Solarbio | S2100 | |
| Alexa Fluor 488偶联的山羊抗小鼠IgG | -- | -- | |
| 细胞增殖 | AS1842856 | MCE | HY-100596 |
| 台盼蓝溶液 | Yesen | 40207ES20 | |
| 细胞凋亡 | Annexin V-PE-Cy7 | Elabscience | 2GB58JNSER |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞术 | Attune NxT流式细胞仪 | Thermo Fisher | -- |
| 慢病毒包装 | 聚乙烯亚胺 | Polysciences | 23966-2 |
| 慢病毒感染 | 聚凝胺 | -- | -- |
| BCBL1-Luc生成 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| D-荧光素 | PerkinElmer | 122799 | |
| ROS检测 | H2DCFDA | Biosharp | BL714A |
| N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- | |
| RNA提取和RT-qPCR | TRIzol试剂 | TransGen Biotech | ET111-01 |
| cDNA合成试剂盒 | TransGen Biotech | P40719 | |
| SYBR Green | TransGen Biotech | Q20310 | |
| 病毒粒子检测 | DNase I | Invitrogen | P30727 |
| 动物实验 | AS1842856 | Adooq Bioscience | A15871 |
| 2-羟丙基-β-环糊精 | MCE | HY-101103 | |
| D-荧光素 | PerkinElmer | 122799 | |
| IVIS Lumina LT系统 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | PEL细胞(BCBL1、BC3、BCP1)和BJAB、BJAB-KSHV培养于RPMI1640,MM细胞培养于DMEM;培养基补充10% FBS、青霉素/链霉素 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents |
| H2O2处理 | H2O2浓度:0, 1, 5, 10 μM;处理时间:24, 48, 72h 阅读提示:Results: KSHV latent infection enhances...; Figure 1 legend |
| FoxO抑制处理 | AS1842856浓度:0, 1, 2, 5 μM;处理时间:48h(ROS检测)或72h(增殖、凋亡、基因表达) 阅读提示:Results: FoxO inhibitor AS1842856...; Materials and methods: Cell proliferation assay, Flow cytometry detection of ROS |
| shRNA敲低 | FoxO1 shRNA靶序列:GGACATGCTCAGCAGACATCT (sh1), GCATGTTCATTGAGCGCTTAG (sh2);FoxO3 shRNA靶序列:CATGTTCAATGGGAGCTTGGA (sh1), CCACACAGAATGTTGTTGGTT (sh2);转导时长:72h 阅读提示:Materials and methods: Lentiviral shRNA knockdown; S1 Fig |
| KSHV裂解再激活检测 | 检测裂解基因(RTA, PAN RNA, ORFK8, ORF57, ORF59, ORF65)mRNA和ORFK8蛋白;阳性对照0.3 mM NaB 阅读提示:Results: Inhibition of FoxO proteins disrupts KSHV latency...; Figure 4 legend |
| ROS清除实验 | NAC浓度:0.4 mM,每日处理,共3天 阅读提示:Results: Inhibition of FoxO1 induces KSHV reactivation...; Figure 6 and 7 legends |
| 体内动物实验 | NOD/SCID小鼠(6周龄);每只腹腔注射1x107 BCBL1-Luc细胞;给药:15 mg/kg AS1842856腹腔注射,每日两次(起始实验连续14天)或每日两次4天后每日三次一周(消退实验) 阅读提示:Materials and methods: Animal experiments; Figure 8 legend |