诱导肌成纤维细胞分化
使用TGF-β处理人肺成纤维细胞建立肌成纤维细胞分化模型。
用5 ng/mL TGF-β1处理MRC-5细胞48小时,诱导肌成纤维细胞分化,并通过western blot检测α-SMA表达。
Mitochondrial folate pathway regulates myofibroblast differentiation and silica-induced pulmonary fibrosis.
包含体外细胞实验和体内小鼠模型,并进行了功能验证(siRNA敲低/过表达)和机制验证(氧化应激),但缺乏患者样本的功能验证。
TGF-β处理的人肺成纤维细胞MRC-5 二氧化硅诱导的肺纤维化小鼠模型 矽肺患者血浆样本 小鼠肺组织样本
TGF-β1处理浓度5 ng/mL及处理时间48小时 siRNA敲低MTHFD2或SLC25A32后肌成纤维细胞标志物表达 过表达MTHFD2或SLC25A32后肌成纤维细胞标志物表达 叶酸补充剂量(5-mTHF 50 μM)及处理时间12小时 小鼠模型中二氧化硅的剂量(50 mg/mL,100 μL)及处理时间4周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
使用TGF-β处理人肺成纤维细胞建立肌成纤维细胞分化模型。
用5 ng/mL TGF-β1处理MRC-5细胞48小时,诱导肌成纤维细胞分化,并通过western blot检测α-SMA表达。
系统鉴定肌成纤维细胞分化中差异表达的蛋白质,特别是线粒体相关蛋白。
通过TMT标记的定量质谱分析TGF-β处理与对照细胞的蛋白质组,识别线粒体叶酸代谢相关蛋白的差异表达。
验证MTHFD2和SLC25A32在肌成纤维细胞分化中的表达变化。
通过RT-qPCR和免疫荧光检测TGF-β处理细胞中MTHFD2和SLC25A32的表达水平。
探索MTHFD2和SLC25A32对肌成纤维细胞分化的调控作用。
通过siRNA敲低或质粒过表达MTHFD2和SLC25A32,检测肌成纤维细胞标志物FN1、COL1A1和α-SMA的表达变化。
检测叶酸补充是否抑制TGF-β诱导的氧化应激。
用5-mTHF预处理细胞,检测ROS水平(DCF和MitoSOX Red)、H2O2和MDA浓度。
评估叶酸补充对二氧化硅诱导肺纤维化的治疗作用。
在二氧化硅诱导的肺纤维化小鼠模型中,通过饮用水补充叶酸,通过组织学染色、RT-qPCR和氧化应激指标评估纤维化程度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | 11995 |
| 胎牛血清 | Hyclone | SV30087.03 | |
| 细胞处理 | 转化生长因子-β1 | PEPROTECH | 100-21 |
| 药物处理 | 5-甲基四氢叶酸 | MedChemExpress | 31690-09-2 |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | 13778030 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000008 | |
| 动物实验 | 二氧化硅悬液 | Sigma-Aldrich | S5639 |
| 叶酸 | BBI Life Science | A610466-0025 | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0009c |
| 组织病理 | MTHFD2抗体 | Proteintech | 12270-1-AP |
| FN1抗体 | Servivebio | GB114491 | |
| COL1A1抗体 | Servivebio | GB11022-3 | |
| α-SMA抗体 | Servivebio | GB111364 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | BOSTER | AR0146 | |
| PVDF膜 | Millipore | ISEQ00010 | |
| GAPDH抗体 | CST | D16H11 | |
| FN1抗体 | Proteintech | 15613-1-AP | |
| COL1A1抗体 | Abcam | ab260043 | |
| 二抗 | CST | 7074 | |
| ECL发光试剂 | Absin | abs920 | |
| 免疫荧光 | Tom20抗体 | SCBT | sc-17764 |
| 抗DNA抗体 | Progen | 61014 | |
| 二抗 | Invitrogen | A11034 | |
| 二抗 | Invitrogen | A21236 | |
| MitoTracker-Red线粒体染料 | Invitrogen | M7512 | |
| Hoechst 33258染料 | Sigma-Aldrich | 14530 | |
| RT-qPCR | RNAiso Plus试剂 | Takara | 9109 |
| DNase | Takara | RR047A | |
| 反转录试剂盒 | Takara | RR047A | |
| TB Green Premix Ex Taq II试剂盒 | Takara | RR820A | |
| 质谱分析 | TMT标记试剂 | Thermo Fisher | 90064CH |
| 高pH反相肽分馏试剂盒 | Thermo Fisher | 84868 | |
| Q-Exactive质谱仪 | Thermo Fisher | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 | |
| H2O2检测试剂盒 | Beyotime | S0101S | |
| MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A003-4-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | 细胞系MRC-5传代范围22-36;TGF-β1浓度5 ng/mL,处理48小时;5-mTHF预处理浓度50 μM,处理12小时 阅读提示:见Methods部分Cell culture and transfection |
| 基因敲低和过表达 | siRNA浓度15 nM,转染试剂Lipofectamine RNAiMAX;过表达质粒每孔4 μg,转染试剂Lipofectamine 3000 阅读提示:见Methods部分Cell culture and transfection |
| 动物模型 | 小鼠品系C57BL/6N雄性,5-6周龄;二氧化硅浓度50 mg/mL,体积100 μL,气管内滴注;叶酸补充浓度20 μg/mL,饮用水,处理4周 阅读提示:见Methods部分Mouse model for silicosis |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA和MitoSOX Red浓度及孵育时间;H2O2和MDA检测试剂盒品牌及货号 阅读提示:见Methods部分Measurement of ROS |