模型建立与表型鉴定
建立OVX-BMMSCs衰老模型,并验证其衰老表型特征。
从Sham和OVX大鼠骨髓中分离BMMSCs,通过流式细胞术鉴定表面标记物(CD44、CD90阳性和CD31、CD45阴性),检测衰老相关表型(SA-β-gal、γH2AX、集落形成能力、衰老相关基因表达)。
Genistein mitigates senescence of bone marrow mesenchymal stem cells via ERRα-mediated mitochondrial biogenesis and mitophagy in ovariectomized rats.
包含体外细胞实验(OVX-BMMSCs模型)、体内动物实验(OVX大鼠模型)及分子机制验证(ERRα敲低、线粒体功能检测)。
去卵巢大鼠骨髓间充质干细胞(OVX-BMMSCs) 去卵巢(OVX)大鼠模型
细胞来源:12周龄雌性Sprague-Dawley大鼠,OVX或Sham手术后16周分离BMMSCs 金雀异黄酮浓度:体外实验使用10^-2 μM和1 μM;体内灌胃剂量为50 mg/kg体重,每日一次 ERRα敲低:siRNA转染,终浓度100 nM,转染48小时后加药处理 线粒体自噬抑制:Baf-A1处理 动物分组:Sham+VEH、Sham+GEN、OVX+VEH、OVX+GEN,每组15只大鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立OVX-BMMSCs衰老模型,并验证其衰老表型特征。
从Sham和OVX大鼠骨髓中分离BMMSCs,通过流式细胞术鉴定表面标记物(CD44、CD90阳性和CD31、CD45阴性),检测衰老相关表型(SA-β-gal、γH2AX、集落形成能力、衰老相关基因表达)。
检测OVX-BMMSCs中ROS水平、线粒体超氧化物、膜电位和ATP变化。
使用DCFDA探针检测ROS,MitoSOX检测线粒体超氧化物,JC-1检测膜电位,ATP检测试剂盒定量ATP含量。
验证金雀异黄酮对OVX-BMMSCs线粒体生物发生和自噬的影响。
通过Western blot检测CoxIV、TOM20、PGC1α、LC3B、P62表达,RT-qPCR检测PGC1α、Tfam、Nrf1、Tfb2m mRNA,TEM观察线粒体形态,MTG/LTR共染色评估自噬。
预测金雀异黄酮在PMOP中的潜在靶蛋白。
利用网络药理学构建药物-靶点网络,进行GO和KEGG富集分析,并通过分子对接评估金雀异黄酮与ERRα的结合。
验证ERRα是否是金雀异黄酮发挥抗衰老和线粒体保护作用所必需的。
通过siRNA敲低ERRα,检测衰老标志物、线粒体生物发生、线粒体呼吸、ROS、膜电位、ATP和线粒体自噬的变化。
评估金雀异黄酮对OVX大鼠骨丢失和氧化损伤的保护作用。
OVX手术8周后给予金雀异黄酮或溶剂处理8周,检测血清MDA、micro-CT骨参数、三点弯曲力学测试、组织学染色及p16INK4a、SIRT3、PGC1α表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 金雀异黄酮 | Sigma-Aldrich | -- |
| N-乙酰半胱氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | Cell Signaling Technology (CST) | -- | |
| 流式分析 | CD45-FITC抗体 | Elabscience | E-AB-F1227C |
| CD31-FITC抗体 | Abcam | ab33858 | |
| CD90-FITC抗体 | Elabscience | E-AB-F1226C | |
| CD44-FITC抗体 | Elabscience | E-AB-F1225C | |
| 小鼠IgG1-FITC同型对照 | Elabscience | E-AB-F09792C | |
| 小鼠IgG2a-FITC同型对照 | Elabscience | E-AB-F09802C | |
| CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman | -- | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| 酶标仪(ELx800) | BioTek Instruments | -- | |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Sigma | -- |
| 衰老染色 | β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | 抗γH2AX抗体 | CST | -- |
| 抗Parkin抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗TOM20抗体 | Abcam | ab186735 | |
| 荧光二抗 | Abcam | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 尼康荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| mtDNA拷贝数检测 | DNeasy血液和组织DNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| ROS检测 | DCFDA荧光探针 | Beyotime | -- |
| FACSCalibur流式细胞仪 | Beckman | -- | |
| 线粒体超氧化物检测 | MitoSOX Red线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | -- |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Abcam | ab83355 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1试剂盒 | Beyotime | -- |
| 耗氧率测定 | Seahorse XFe96分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent | -- | |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 电镜样本制备 | 醋酸铀 | -- | -- |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| 电镜观察 | 透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 线粒体自噬检测 | MitoTracker Green线粒体绿色荧光探针 | Invitrogen | -- |
| LysoTracker Red溶酶体红色荧光探针 | Invitrogen | -- | |
| 活细胞成像 | 激光共聚焦扫描显微镜(TCS SP8) | Leica Microsystems | -- |
| 线粒体功能染色 | MitoTracker Red CMXRos线粒体红色荧光探针 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| cDNA合成 | 逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- |
| qPCR | SYBR Green PCR预混液 | TaKaRa | -- |
| 罗氏Light Cycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗p21CIP1抗体 | Abcam | ab109199 | |
| 抗PGC1α抗体 | Abcam | ab106814 | |
| 抗LC3B抗体 | Abcam | ab192890 | |
| 抗P62抗体 | Abcam | ab56416 | |
| 抗p53抗体 | CST | 2524 | |
| 抗CoxIV抗体 | CST | 4850 | |
| 抗β-actin抗体 | CST | 8457 | |
| 抗SIRT3抗体 | Invitrogen | PA5-96406 | |
| HRP标记二抗 | CST | -- | |
| 分子对接 | Schrodinger Maestro软件 | Schrodinger | -- |
| 动物实验 | 金雀异黄酮(灌胃) | Sigma-Aldrich | -- |
| 血清MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| Micro-CT | 显微CT系统(μCT-80) | Scanco Medical | -- |
| 组织学分析 | EDTA | -- | -- |
| 免疫组化 | 抗p16INK4a抗体 | Invitrogen | -- |
| DAB显色试剂盒 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗SIRT3抗体 | Invitrogen | -- |
| 抗PGC1α抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗LepR抗体 | Invitrogen | -- | |
| FITC标记的山羊抗兔二抗 | Abcam | -- | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Invitrogen | -- | |
| 激光共聚焦显微镜(Zeiss LSM710) | Carl Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与模型建立 | 大鼠品系(Sprague-Dawley)、年龄(12周)、OVX手术时间(16周后取材)、OVX组培养基无酚红 阅读提示:见Materials and methods 2.1节 |
| 药物处理 | 金雀异黄酮浓度(体外10^-2 μM和1 μM;体内50 mg/kg)、处理时间(体外3天,体内8周)、给药方式(灌胃) 阅读提示:见Results 3.1节和Methods 2.19节 |
| ERRα敲低 | siRNA序列、浓度(100 nM)、转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX)、转染时间(48小时) 阅读提示:见Methods 2.3节 |
| 线粒体功能检测 | OCR测量细节(海马分析仪、细胞密度、药物浓度)、JC-1红绿比、ATP检测方法 阅读提示:见Methods 2.11和2.12节 |
| 动物实验分组和处理 | 动物数量(每组15)、术后给药开始时间(8周后)和持续时间(8周)、饲料低植物雌激素含量 阅读提示:见Methods 2.19节 |
| 组织学分析 | 脱钙时间(8周)、切片厚度(5 μm)、随机视野数(3个)、每组样本量(9个) 阅读提示:见Methods 2.23节 |