三维RAD16-I水凝胶培养模型建立
建立不同刚度的3D培养环境,以研究刚度对细胞的影响。
使用RAD16-I肽制备0.15%和0.5%浓度的水凝胶,将PANC-1、MiaPaCa-2等细胞包埋其中,培养6天。
Increased Stiffness Downregulates Focal Adhesion Kinase Expression in Pancreatic Cancer Cells Cultured in 3D Self-Assembling Peptide Scaffolds.
多种细胞系(PANC-1、MiaPaCa-2、BxPC-3、MCF-7、hNDF)的3D培养、WB、IF、MTT、共定位分析,以及RAD16-I与胶原功能化比较。
PANC-1细胞 MiaPaCa-2细胞 BxPC-3细胞 MCF-7细胞 hNDF细胞
RAD16-I浓度0.15%(软,约100 Pa)和0.5%(硬,约2500 Pa) 培养时间6天 细胞密度2×10^6 cells/mL Western blot重复三次(N=3) 统计使用ANOVA和Tukey检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立不同刚度的3D培养环境,以研究刚度对细胞的影响。
使用RAD16-I肽制备0.15%和0.5%浓度的水凝胶,将PANC-1、MiaPaCa-2等细胞包埋其中,培养6天。
验证细胞在3D水凝胶中的存活和增殖能力。
通过免疫荧光观察细胞形态,并使用MTT法测定细胞增殖。
检测不同刚度条件下FAK的表达和激活。
通过Western blot和免疫荧光检测pFAKY397、总FAK、β1整合素、vinculin等。
比较在天然胶原I凝胶中刚度对FAK的影响。
在胶原I凝胶中培养相同细胞,检测FAK表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Capricorn | -- |
| RPMI培养基 | Capricorn | -- | |
| 胎牛血清 | Biowest | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Biowest | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Biowest | -- | |
| 3D细胞培养 | PuraMatrix | Corning | 354250 |
| 蔗糖 | Merck | S0389 | |
| I型胶原蛋白 | Gibco | A1048301 | |
| 鼠尾胶原I | Corning | 354249 | |
| 药物处理 | GM6001 | scbt | sc-203979 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白检测试剂盒 | Serva | 39228 |
| SDS-PAGE | Tris-甘氨酸预制胶 | Thermo Fisher | XP00105BOX |
| 细胞培养 | MTT | Merck | M5655 |
| 二甲基亚砜 | Merck | D8418 | |
| 免疫荧光 | 甲醛 | abcam | ab201113 |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 曲拉通X-100 | -- | -- | |
| 抗β1整合素抗体 | abcam | ab24693 | |
| 抗pFAKY397抗体 | Invitrogen | 700255 | |
| 抗pFAKY861抗体 | Invitrogen | 44-626G | |
| 抗黏着斑蛋白抗体 | Invitrogen | 700062 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Invitrogen | 14-9869-80 | |
| A488荧光二抗 | abcam | ab150105 | |
| A647荧光二抗 | abcam | ab150079 | |
| 鬼笔环肽-TRITC | -- | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 显微镜 | Leica Thunder宽场显微镜 | Leica | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Merck | R0278 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11836153001 | |
| PVDF膜 | Merck | IPVH07850 | |
| 抗FAK抗体 | Invitrogen | AHO0502 | |
| 抗pErk1/2T202,Y204抗体 | Invitrogen | 14-9109-80 | |
| 抗Erk抗体 | Biolegend | 686902 | |
| 抗GAPDH抗体 | Biolegend | 649201 | |
| 抗兔HRP二抗 | abcam | ab6721 | |
| 抗小鼠HRP二抗 | abcam | ab6820 | |
| 抗大鼠HRP二抗 | Biolegend | 405405 | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Scientific | 34080 | |
| 成像 | ImageQuant LAS 4000 mini | GE HealthCare | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 6 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 3D细胞培养 | RAD16-I浓度(0.15%和0.5%),细胞密度(2×10^6 cells/mL),培养时间(6天) 阅读提示:Materials and Methods 2.2节 |
| 细胞活力检测 | MTT浓度(0.5 mg/mL),孵育时间(3小时) 阅读提示:Materials and Methods 2.5节 |
| 免疫荧光 | 抗体稀释比例(1:500、2:500等),孵育时间(过夜),图像分析至少5张 阅读提示:Materials and Methods 2.6节 |
| Western blot | 蛋白上样量(5 μg),抗体稀释(1:500、1:1000等),重复次数(N=3) 阅读提示:Materials and Methods 2.7节 |
| 统计分析 | 重复数(n=3,N=3),统计检验(ANOVA和Tukey) 阅读提示:Materials and Methods 2.8节 |