Epg5敲除小鼠模型建立与表型分析
验证Epg5敲除是否导致雌性小鼠生育力低下和卵巢功能异常。
Epg5敲除小鼠与野生型对照进行交配实验,记录产仔数和窝仔数;收集不同年龄(8周、16周)卵巢,测量大小、重量,进行H&E染色和卵泡计数。
Epg5 deficiency leads to primary ovarian insufficiency due to WT1 accumulation in mouse granulosa cells.
该研究包含体内小鼠模型、体外细胞实验、单细胞RNA测序、功能验证和机制验证等多个独立证据层级,实验完整度较高。
Epg5基因敲除小鼠(C57/BL6背景,回交至ICR背景) 小鼠原代颗粒细胞 HEK293T细胞 小鼠卵巢组织
Epg5敲除雌性小鼠与已知生育力雄性小鼠交配6个月,记录产仔数(n=5每组) 卵巢形态学分析:8周和16周龄卵巢大小、重量、卵泡计数(H&E染色) 自噬流检测:LC3-II和SQSTM1蛋白水平(免疫印迹),LC3和SQSTM1斑点共定位(免疫荧光) WT1蛋白水平检测:免疫印迹和免疫荧光,以及CHX追踪实验(3-MA处理HEK293T细胞) GC分化相关基因表达检测:免疫印迹检测FSHR、HSD3B1、CYP11A1、CYP19A1,以及siRNA介导的Wt1敲低挽救实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Epg5敲除是否导致雌性小鼠生育力低下和卵巢功能异常。
Epg5敲除小鼠与野生型对照进行交配实验,记录产仔数和窝仔数;收集不同年龄(8周、16周)卵巢,测量大小、重量,进行H&E染色和卵泡计数。
判断Epg5敲除导致的生育力低下是否由卵母细胞发育缺陷引起。
对Epg5敲除和对照小鼠进行超数排卵,统计MII卵母细胞数量;分离GV卵母细胞进行体外成熟培养,统计PB1排出率和MII率;进行体外受精(IVF)评估胚胎发育率。
探讨Epg5敲除对颗粒细胞增殖、衰老和凋亡的影响。
通过SA-β-gal染色检测颗粒细胞衰老;通过TUNEL和cleaved CASP3免疫荧光检测凋亡;通过PCNA免疫荧光检测增殖;通过γ-H2AX免疫荧光检测DNA损伤。
确认Epg5敲除是否导致卵巢和颗粒细胞自噬流受阻。
通过免疫印迹检测卵巢和颗粒细胞中LC3-II和SQSTM1蛋白水平;通过免疫荧光观察LC3和SQSTM1斑点;通过活细胞成像追踪GFP-LC3与Lysotracker的共定位。
在转录组水平揭示Epg5敲除对颗粒细胞分化基因表达的影响。
分离6周龄Epg5敲除和对照小鼠卵巢的单细胞悬液,进行scRNA-seq,聚类分析细胞类型,鉴定颗粒细胞亚群,比较差异表达基因并进行GO富集和SCENIC调控网络分析。
验证WT1是否通过自噬途径降解,以及Epg5敲除是否导致WT1积累。
通过免疫荧光和免疫印迹检测WT1蛋白水平;在HEK293T细胞中过表达WT1,用3-MA抑制自噬,进行CHX追踪实验;通过免疫共沉淀检测WT1与SQSTM1等自噬受体的相互作用;通过免疫荧光观察WT1和SQSTM1的共定位。
验证WT1积累是否导致类固醇生成基因下调,以及敲低WT1能否逆转这一效应。
通过免疫印迹检测eCG/PMSG处理的Epg5敲除和对照卵巢中FSHR、HSD3B1、CYP11A1、CYP19A1蛋白水平;分离培养颗粒细胞,用CQ抑制自噬,检测相关蛋白变化;在Epg5敲除GC中通过siRNA敲低WT1,检测类固醇生成基因表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 单细胞悬液制备 | 胰蛋白酶 | Solarbio | 8049-47-6 |
| 胶原酶VI | Thermo | 17104019 | |
| 脱氧核糖核酸酶 | Macklin | 9003-98-9 | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8010 | |
| RNA测序 | Chromium单细胞3' GEM、文库与凝胶珠试剂盒v3 | 10× Genomics | -- |
| Chromium单细胞控制器 | 10× Genomics | -- | |
| HiSeq X Ten测序平台 | Illumina | -- | |
| TruSeq链式mRNA LT样品制备试剂盒 | Illumina | RS-122-2101 | |
| 超数排卵 | 马绒毛膜促性腺激素/孕马血清促性腺激素 | Ningbo Second Hormone Company | 110254564 |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Ningbo Second Hormone Company | 110251281 | |
| IVF | KSOM培养基 | Millipore | MR-121-D |
| 组织学分析 | Permount封片剂 | Solarbio | G8590 |
| 颗粒细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | 11330032 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L300015 | |
| 靶向Wt1的siRNA | Thermo Fisher Scientific | 4392420 | |
| 氯喹 | Sigma | C6628 | |
| 活细胞成像 | 溶酶体红色荧光探针 | Beyotime | C1046 |
| 玻底培养皿 | NEST | 801001 | |
| 倒置荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| 免疫荧光 | OCT包埋剂 | Tissue-Tek | -- |
| Triton X-100 | Elabscience | E-IR-R122 | |
| DAPI | -- | -- | |
| SP8显微镜 | Leica | -- | |
| LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 免疫组化 | HRP标记二抗 | Zhong Shan Jin Qiao | ZB-2306 |
| DAB显色试剂 | Zhong Shan Jin Qiao | ZLI-9017 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| NP-40 | Thermo Fisher Scientific | 85124 | |
| 十二烷基硫酸钠 | Solarbio | S8010 | |
| 脱氧胆酸钠 | Sigma-Aldrich | 30970-100G | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693116001 | |
| PVDF膜 | Sigma-Aldrich | P2938-1ROL | |
| ODYSSEY Sa红外成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A-琼脂糖 | GE Healthcare | 17-1279-03 |
| TUNEL | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche Diagnostics | 11684795910 |
| 抗体 | WT1抗体 (ab89901) | Abcam | -- |
| PCNA抗体 (ab29) | Abcam | -- | |
| DDX4抗体 (ab27591) | Abcam | -- | |
| FOXL2抗体 (ab5096) | Abcam | -- | |
| MKI67/Ki67抗体 (ab15580) | Abcam | -- | |
| FOS/c-FOS抗体 (ab222699) | Abcam | -- | |
| JUN/c-JUN抗体 (ab40766) | Abcam | -- | |
| FOXO1抗体 (ab179450) | Abcam | -- | |
| γ-H2AX抗体 (05-636) | Milipore | -- | |
| CASP3抗体 (9662S) | Cell Signaling Technology | -- | |
| LC3抗体 (4599S) | Cell Signaling Technology | -- | |
| SQSTM1抗体 (5114) | Cell Signaling Technology | -- | |
| HSD3B1抗体 (SC-30820) | Santa Cruz Biotechnology | -- | |
| CYP11A1抗体 (13363-1-AP) | Proteintech | -- | |
| BCLAF1抗体 (67860-1-Ig) | Proteintech | -- | |
| ATF4抗体 (28657-1-AP) | Proteintech | -- | |
| GAPDH抗体 (AC002) | ABclonal | -- | |
| TUBA抗体 (AC012) | ABclonal | -- | |
| ACTB抗体 (AC026) | ABclonal | -- | |
| FITC标记二抗 | Zhong Shan Jin Qiao | ZF-0311 | |
| TRITC标记二抗 | Zhong Shan Jin Qiao | ZF-0313 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Epg5敲除小鼠的背景(C57/BL6回交至ICR背景10代),小鼠年龄(8周、16周等),每组样本量 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Mice' 部分以及图例1、S2 |
| 生育力测试 | 交配持续时间(6个月),雌鼠年龄(7-8周),雄鼠生育力确认,对照组和敲除组各5只 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Superovulation and fertility testing' 部分及图1d,e |
| 超数排卵与卵母细胞收集 | eCG/PMSG剂量(10 IU),hCG剂量(10 IU),注射时间间隔(44-48小时),收集时间(hCG后16小时) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Superovulation and fertility testing' 部分及图2a |
| 颗粒细胞分离与培养 | 小鼠年龄(5-6周),培养基(DMEM/F12),血清浓度(5% FBS),抗生素(1%青霉素-链霉素),培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Primary GCs isolation, culture, transfection and knockdown' 部分 |
| 自噬抑制 | CQ浓度(50 μM),处理时间(48小时);3-MA浓度和处理时间(文中未明确说明) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Primary GCs isolation, culture, transfection and knockdown' 部分及图6h |
| RNA测序 | 小鼠年龄(6周),单细胞悬液制备酶消化条件(2 mL 胰蛋白酶、1 mL 胶原酶VI、100 μL DNase,37°C孵育20分钟),测序平台(10× Genomics Chromium,HiSeq X Ten) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Single-cell suspension preparation' 和 'RNA-sequencing and analysis' 部分 |
| 蛋白质印迹 | 裂解液成分(RIPA buffer),抗体稀释比例(未明确),蛋白上样量(未明确) 阅读提示:Materials and Methods 中的 'Western blot analysis' 部分及相应图例 |