验证HMGB1对巨噬细胞胞葬作用的影响
确定细胞外HMGB1是否抑制巨噬细胞介导的凋亡细胞清除
用BALF或rHMGB1处理BMDMs,与CFSE标记的凋亡胸腺细胞共培养,通过共聚焦显微镜和流式细胞术检测胞葬作用。
Extracellular HMGB1 Impairs Macrophage-Mediated Efferocytosis by Suppressing the Rab43-Controlled Cell Surface Transport of CD91.
包含体外细胞实验(BMDMs胞葬作用、Rab43敲除、CD91运输)、体内动物模型(LPS诱导ALI小鼠模型、Rab43-cKO小鼠)及分子机制验证(免疫共沉淀、共定位)。
骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) RAW264.7细胞 LPS诱导ALI小鼠模型 髓系特异性Rab43敲除(Rab43-cKO)小鼠
rHMGB1处理浓度:2 μg/ml,处理时间:12小时 BMDMs与凋亡胸腺细胞共培养比例:1:10,共培养时间:2小时 LPS诱导ALI剂量:5 mg/kg(气管内注射) Rab43-cKO小鼠(Rab43floxp/floxp/LysMCre+/+)与对照Rab43-C小鼠(Rab43floxp/floxp/LysMCre−/−) CD91阻断抗体处理时间:1小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定细胞外HMGB1是否抑制巨噬细胞介导的凋亡细胞清除
用BALF或rHMGB1处理BMDMs,与CFSE标记的凋亡胸腺细胞共培养,通过共聚焦显微镜和流式细胞术检测胞葬作用。
探究HMGB1是否改变Rab43的表达水平
Western blot和qPCR检测rHMGB1或BALF处理后BMDMs中Rab43蛋白和mRNA水平;免疫荧光观察Rab43胞内分布。
确定Rab43缺失是否损害巨噬细胞胞葬作用
比较Rab43-cKO和Rab43-C BMDMs体外吞噬凋亡胸腺细胞的能力;在LPS诱导的ALI小鼠模型中分析体内胞葬作用和中性粒细胞比例。
探究HMGB1是否通过影响CD91的运输来抑制胞葬作用
流式检测rHMGB1处理后BMDMs细胞表面CD91水平;共聚焦显微镜观察CD91亚细胞定位及其与内质网和高尔基体标志物的共定位。
确定Rab43是否调控CD91从内质网到细胞表面的运输
流式和Western blot检测Rab43-cKO BMDMs中细胞表面和细胞质CD91水平;共聚焦观察CD91分布和与内质网、高尔基体的共定位。
确定Rab43是否直接与CD91结合以介导其运输
在RAW264.7细胞中过表达FLAG-Rab43或GFP-Rab43,通过免疫共沉淀检测Rab43与CD91的相互作用;共聚焦观察GFP-Rab43与CD91或内质网标志物的共定位。
确定Rab43缺失是否加重体内炎症和肺损伤
对Rab43-C和Rab43-cKO小鼠气管内注射LPS,检测肺组织病理学、肺水肿程度(W/D比值)、BALF蛋白浓度、炎症因子(TNF-α、IL-6)水平和凋亡中性粒细胞数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 巨噬细胞培养基,MAM | ScienCell | 1921 |
| 重组巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF) | Bioworld Technology | BK0128 | |
| Gibco® 细胞解离缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 13150016 | |
| 药物处理 | 大肠杆菌055:B5脂多糖(LPS) | Sigma-Aldrich | L2880 |
| 重组HMGB1(rHMGB1) | Sino Biological | 50913-M01H | |
| 地塞米松 | MCE | HY-14648 | |
| 流式分析 | PE膜联蛋白V凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 559763 |
| 蛋白质检测 | Pierce™ BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| M-PER™ 蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific | 78510 | |
| cOmplete™ 无EDTA蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | 04693159001 | |
| PageRuler™ 预染蛋白分子量标准 | Thermo Fisher Scientific | 26616 | |
| Immobilon 蛋白质印迹化学发光HRP底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| 膜蛋白提取 | Mem-PER™ Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89842 |
| RNA提取和qPCR | TRIzol™ 试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| GoScript™ 逆转录系统 | Promega | A2800 | |
| GoTaq qPCR预混液 | Promega | A6001 | |
| 免疫荧光 | 免疫荧光应用解决方案试剂盒 | CST | 12727 |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Coolaber | SL | |
| Cytofix/Cytoperm™ 固定/透化试剂盒 | BD Biosciences | 554714 | |
| 高尔基体染色 | 高尔基体染色试剂盒—绿色荧光 | Cytopainter | Abcam | ab139483 |
| 免疫共沉淀 | Protein A/G PLUS-琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 细胞标记 | CFDA SE细胞增殖检测与追踪试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0051 |
| 细胞膜染色 | Dil染料 | Thermo Fisher Scientific | D3911 |
| ELISA | 高迁移率族蛋白1 ELISA试剂盒 | Cloud-Clone Corp. | SEA399Mu |
| 转染 | FuGENE® HD转染试剂 | Promega | 2311 |
| 细胞分选 | 抗F4/80超纯微珠,小鼠 | Miltenyi Biotec | 130-110-443 |
| MS柱 | Miltenyi Biotec | 5190110006 | |
| Western blot分析 | 抗RAB43抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-515460 |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | CST | 4970S | |
| 抗CD91抗体 | Abcam | ab92544 | |
| Calnexin抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA3-027 | |
| 抗FLAG抗体 | CST | 14793 | |
| 抗GFP抗体 | CST | 2956 | |
| 小鼠抗兔IgG(构象特异性)(L27A9)单克隆抗体(HRP偶联) | CST | 5127 | |
| ATP1A1多克隆抗体 | Proteintech | 14418-1-AP | |
| 流式分析 | PE抗小鼠CD91抗体 | Bioss | bs-10920R-PE |
| APC抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123116 | |
| FITC抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123108 | |
| APC/Cyanine7抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123118 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠Ly-6G/Ly-6C(Gr-1)抗体 | BioLegend | 108416 | |
| 抗CD16/32抗体 | BioLegend | 101302 | |
| PerCP标记的抗小鼠/人CD11b抗体 | Elabscience | E-AB-F1081F | |
| APC抗小鼠CD11c抗体 | BioLegend | 117310 | |
| BV421抗小鼠MerTK抗体 | BD Biosciences | 747837 | |
| PE抗小鼠CD36抗体 | BioLegend | 102605 | |
| 中和实验 | 抗HMGB1中和抗体 | Arigo | ARG66714 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor® 488偶联的AffiniPure山羊抗小鼠IgG | Jackson Immunoresearch | 115-545-003 |
| Alexa Fluor® 594偶联的AffiniPure山羊抗兔IgG | Jackson Immunoresearch | 111-585-003 | |
| 免疫共沉淀 | pcDNA3.1-3xflag-Rab43质粒 | Sangon Biotech | -- |
| pcDNA3.1-GFP-Rab43质粒 | Sangon Biotech | -- | |
| 仪器 | FACSCanto™ II临床流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| 徕卡共聚焦显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 细胞培养耗材 | 培养皿 | NEST Biotechnology | 801002 |
| BALF收集 | 聚偏二氟乙烯膜 | 文中未明确说明 | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和处理 | BMDMs分离自6-8周龄Rab43-C或Rab43-cKO小鼠;培养于含10%胎牛血清和100 ng/ml M-CSF的MAM培养基中;rHMGB1处理浓度和持续时间。 阅读提示:Materials and Methods中的Isolation and Culture of Macrophages |
| 胞葬作用分析 | 凋亡胸腺细胞用1 mM地塞米松处理6小时;BMDMs与凋亡细胞比例和共培养时间。 阅读提示:Materials and Methods中的In Vitro Phagocytosis Assay |
| CD91表面表达检测 | 流式抗体浓度和孵育条件;BALF中巨噬细胞的门控策略(F4/80+CD11b+CD11c−)。 阅读提示:Materials and Methods中的Flow Cytometry Analysis of Cell Surface CD91 |
| 体内ALI模型 | LPS剂量(5 mg/kg)和给药方式(气管内注射);小鼠品系和年龄;处理时间点。 阅读提示:Materials and Methods中的Animals and ALI/ARDS Model Construction |
| 组织病理分析 | 肺组织固定、包埋和H&E染色步骤;肺损伤评分标准。 阅读提示:Materials and Methods中的Lung Histological Analysis and Lung Injury Scoring |