检测缺氧或复氧对IDO表达和活性的影响
验证缺氧或复氧是否能上调肾小管上皮细胞中IDO的表达和活性
将原代小鼠RPTECs在缺氧条件下培养24小时,或先缺氧24小时再复氧2小时,检测IDO蛋白水平和犬尿氨酸/色氨酸比值
The Role of Indoleamine 2,3-Dioxygenase in Renal Tubular Epithelial Cells Senescence under Anoxia or Reoxygenation.
体外细胞实验明确包含IDO表达、活性、下游通路GCN2K与AhR抑制验证,及衰老相关DDR、p21/p16、SA-β-Gal、增殖和IL-6检测,但缺少动物模型
原代小鼠近端肾小管上皮细胞 原代人近端肾小管上皮细胞
细胞类型:原代小鼠或人近端肾小管上皮细胞,小鼠传代3代使用,人细胞敏感性不同 缺氧处理:小鼠细胞缺氧24小时,人细胞缺氧2小时,模拟缺血 复氧处理:缺氧后更换新鲜培养基并置于含5% CO2的37°C湿润环境,小鼠2小时,人24小时,模拟再灌注 IDO抑制剂1-MT浓度:100 μM,在缺氧开始或复氧开始时加入 AhR抑制剂CH223191浓度:3 μM,在缺氧开始或复氧开始时加入
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证缺氧或复氧是否能上调肾小管上皮细胞中IDO的表达和活性
将原代小鼠RPTECs在缺氧条件下培养24小时,或先缺氧24小时再复氧2小时,检测IDO蛋白水平和犬尿氨酸/色氨酸比值
验证缺氧或复氧是否激活IDO活性衍生的GCN2K和AhR途径
检测磷酸化GCN2K(p-GCN2K)水平和AhR转录靶标CYP1A1的表达
验证IDO是否通过DNA损伤反应影响缺氧或复氧诱导的衰老
检测磷酸化ATM(p-ATM)、磷酸化p53(p-p53)和总p53水平
验证IDO是否影响细胞周期抑制剂p21和p16以及衰老标志物SA-β-Gal的表达
检测p21和p16蛋白水平,通过组织化学评估SA-β-Gal活性
验证IDO是否影响缺氧或复氧诱导的细胞增殖抑制和IL-6产生
检测Ki-67蛋白水平和细胞培养上清中IL-6浓度
验证IDO抑制是否能减轻人肾小管上皮细胞缺氧或复氧诱导的衰老
使用原代人RPTECs,缺氧2小时或复氧24小时,检测SA-β-Gal活性
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 完全上皮细胞培养基套件 | Cell Biologics | M6621 |
| Dulbecco磷酸盐缓冲液 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore | -- | |
| 缺氧处理 | GasPak EZ厌氧罐系统(带指示剂) | BD Biosciences | 26001 |
| 药物处理 | 1-DL-甲基色氨酸 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore | -- |
| CH223191 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore | -- | |
| 蛋白质提取 | T-PER组织蛋白提取试剂 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- |
| 蛋白质定量 | Bradford法 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore | -- |
| Western blotting | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Sigma-Aldrich; Merck Millipore / Roche Diagnostics | -- |
| PVDF膜 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| LumiSensor Plus化学发光HRP底物试剂盒 | GenScript Corporation | -- | |
| Restore Western Blot剥离缓冲液 | Thermo Fisher Scientific Inc. | -- | |
| 抗小鼠IgG,HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 抗兔IgG,HRP偶联抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| Image J软件 | National Institute of Health | -- | |
| ELISA | 犬尿氨酸/色氨酸比值ELISA试剂盒 | ImmuSmol | ISE-2227 |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-EL-M0044 | |
| EnSpire多功能酶标仪 | Perkin Elmer | -- | |
| 组织化学 | 衰老相关β-半乳糖苷酶检测试剂盒 | Cell Signaling Technology | 9860 |
| Axiovert 40C倒置显微镜 | Carl Zeiss AG | -- | |
| 3MP USB2.0显微镜数码相机 | AmScope | -- | |
| 统计分析 | IBM SPSS Statistics for Windows | IBM Corp. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞类型:原代小鼠或人近端肾小管上皮细胞;培养条件:完全上皮细胞培养基;细胞密度:300,000细胞/孔(6孔板);培养时间:16小时;传代次数:第3代 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture Conditions |
| 缺氧处理 | 缺氧时间:小鼠细胞24小时,人细胞2小时;缺氧装置:GasPak EZ厌氧罐系统;氧气浓度:<1%;培养温度:37°C 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture Conditions |
| 复氧处理 | 复氧时间:小鼠细胞2小时,人细胞24小时;复氧条件:更换新鲜培养基,置于含5% CO2的37°C湿润环境;复氧前是否缺氧处理 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture Conditions |
| 药物处理 | 1-MT浓度:100 μM;CH223191浓度:3 μM;给药时机:缺氧开始时或复氧开始时 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture Conditions |
| Western blotting | 细胞裂解:T-PER试剂;蛋白上样量:10 μg;凝胶:4-12% Bis-Tris凝胶;转膜:PVDF膜;一抗孵育:4°C 16小时;二抗孵育:室温30分钟;重复次数:4次 阅读提示:Methods 2.2 Assessment of Proteins of Interest |
| IDO活性检测 | 检测指标:细胞培养上清中犬尿氨酸和色氨酸浓度;计算犬尿氨酸/色氨酸比值;重复次数:6次 阅读提示:Methods 2.3 Assessment of Tryptophan Catabolism through the Kynurenine Pathway and IL-6 Production |
| IL-6检测 | 检测方法:小鼠IL-6 ELISA试剂盒;重复次数:6次 阅读提示:Methods 2.3 Assessment of Tryptophan Catabolism through the Kynurenine Pathway and IL-6 Production |
| SA-β-Gal染色 | 染色方法:SA-β-Gal染色试剂盒;X-Gal浓度:双倍;计算阳性细胞百分比;重复次数:3次 阅读提示:Methods 2.4 Assessment of Senescence-Associated β-Galactosidase Activity |
| 统计分析 | 正态性检验:Kolmogorov-Smirnov检验;组间比较:单因素方差分析伴有Bonferroni事后检验;非正态数据:Kruskal-Wallis H检验和Mann-Whitney U检验;显著性水平:p < 0.05;结果表示:均值±SEM 阅读提示:Methods 2.5 Statistical Analysis |