细胞增殖抑制实验
评估δVB对结肠癌细胞活力的影响并确定IC50。
用不同浓度δVB处理SW480、SW620和正常CCD 841 CoN细胞,CCK-8法检测增殖。
Colorectal Cancer Apoptosis Induced by Dietary δ-Valerobetaine Involves PINK1/Parkin Dependent-Mitophagy and SIRT3.
包含细胞增殖、细胞周期、凋亡、线粒体功能、线粒体自噬检测及抑制剂验证等多个独立证据层级,并进行功能验证。
SW480细胞 SW620细胞 CCD 841 CoN细胞
δVB浓度1.5 mM 处理时间0、24、48、72 h 3-MA预处理浓度5 mM 细胞系SW480和SW620 对照处理为HBSS-10 mM Hepes
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估δVB对结肠癌细胞活力的影响并确定IC50。
用不同浓度δVB处理SW480、SW620和正常CCD 841 CoN细胞,CCK-8法检测增殖。
检测δVB对细胞周期分布的影响。
流式细胞术分析PI染色细胞周期,Western blot检测细胞周期蛋白。
评估δVB诱导的凋亡。
Annexin V/PI染色流式检测凋亡,Western blot检测caspase-3、caspase-9、PARP。
检测δVB对线粒体膜电位和相关蛋白的影响。
JC-1染色检测膜电位,Western blot检测COX-IV、SIRT3、Bax、Bcl-2。
检测δVB是否诱导线粒体自噬。
使用Mitophagy Detection Kit染色观察自噬体和溶酶体共定位,Western blot检测PINK1、Parkin、LC3B。
验证线粒体自噬在凋亡中的作用。
用3-MA预处理细胞,检测凋亡和蛋白表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Eagle最小必需培养基 | ATCC | 30-2003 |
| Leibovitz L-15培养基 | Gibco | 11-415-064 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10-270-106 | |
| 药物处理 | δ-戊甜菜碱 | -- | -- |
| 细胞培养 | HBSS-10 mM Hepes | -- | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Donjindo Molecular Technologies | -- |
| 细胞周期检测 | BD Cycletest Plus DNA试剂盒 | BD Biosciences | 340242 |
| 凋亡检测 | Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Pharmigen | 556547 |
| Nucview 488和Mitoview 633凋亡检测试剂盒 | Biotium | 30062 | |
| caspase-3/7检测 | 双凋亡检测试剂盒(nucview 488 caspase-3底物和annexin V) | Biotium | 30067 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1探针 | Dojindo Molecular Technologies | MT09 |
| 蛋白裂解 | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | Bio-Rad蛋白质检测试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | Bio-Rad | -- |
| TBS 1%酪蛋白封闭液 | Bio-Rad | 1610782 | |
| 抗SIRT3抗体 | Invitrogen | PA5-86035 | |
| 抗细胞周期蛋白A2抗体 | Abcam | ab38 | |
| 抗细胞周期蛋白B1抗体 | Cell Signaling Technology | 4138 | |
| 抗细胞周期蛋白D1抗体 | Abcam | ab134175 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 9508 | |
| 抗PARP抗体 | Abcam | ab194586 | |
| 抗Parkin抗体 | Abcam | ab77924 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-AB-15522 | |
| 抗COX-IV抗体 | Invitrogen | MA5-15078 | |
| 抗BAX抗体 | Biorbyt | orb216030 | |
| 抗LC3B抗体 | Abcam | ab192890 | |
| 抗PINK1抗体 | Applied Biological Materials Inc. | Y403614 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-AB-20036 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| HRP标记二抗 | ImmunoReagents Inc. | NC | |
| Excellent化学发光底物试剂盒 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-IR-R301 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 线粒体自噬检测 | 线粒体自噬检测试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | MD01 |
| 线粒体自噬染料 | -- | -- | |
| 溶酶体染料 | -- | -- | |
| DAPI | Sigma Aldrich | -- | |
| 显微镜 | EVOS FL细胞成像系统 | Thermo Scientific | -- |
| LSM 700共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 流式细胞术 | BD Accuri™ C6 | BD | -- |
| 药物处理 | 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | M9281 |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系、培养基、δVB浓度、处理时间、3-MA浓度 阅读提示:4.1 Cell Culture and Treatments |
| 增殖检测 | 细胞接种密度、处理浓度、检测试剂盒 阅读提示:4.2 Proliferation Assay |
| 细胞周期分析 | 细胞接种密度、染色试剂盒 阅读提示:4.3 Cell Cycle Evaluation |
| 凋亡检测 | 染色试剂盒、孵育时间、检测仪器 阅读提示:4.4 Apoptotic Cell Death Detection |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1浓度、孵育时间 阅读提示:4.6 Mitochondrial Membrane Potential Determination |
| 线粒体自噬检测 | 染料浓度、染色时间、固定和透化条件 阅读提示:4.8 Mitophagy Detection |
| 抑制剂处理 | 3-MA浓度、预处理时间 阅读提示:4.1 Cell Culture and Treatments |