临床组织样本分析
检测ST3Gal IV在宫颈癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
使用商业组织芯片(75例宫颈癌和5例正常组织)进行免疫组化染色,评估ST3Gal IV表达,并用Pearson卡方检验分析其与病理分级等参数的相关性。
ST3Gal IV Mediates the Growth and Proliferation of Cervical Cancer Cells In Vitro and In Vivo Via the Notch/p21/CDKs Pathway.
包含组织芯片IHC分析、细胞系过表达模型、体外功能实验(CCK-8、克隆形成、EdU、流式)、体内裸鼠成瘤模型及Western blot机制验证。
宫颈癌组织芯片(75例) HeLa细胞 SiHa细胞 裸鼠皮下异种移植瘤模型
ST3Gal IV过表达载体pcDNA3.1/ST3Gal IV及对照载体转染HeLa和SiHa细胞 G418筛选浓度:HeLa细胞600 μg/ml,SiHa细胞800 μg/ml 细胞种植密度:CCK-8实验4×10³细胞/孔,克隆形成实验1×10³细胞/孔 裸鼠皮下注射细胞数:2×10⁷细胞/只 DAPT(Notch抑制剂)处理ST3Gal IV过表达细胞及mock细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测ST3Gal IV在宫颈癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
使用商业组织芯片(75例宫颈癌和5例正常组织)进行免疫组化染色,评估ST3Gal IV表达,并用Pearson卡方检验分析其与病理分级等参数的相关性。
建立ST3Gal IV稳定过表达的宫颈癌细胞系,以研究其功能。
使用Lipofectamine 2000将pcDNA3.1/ST3Gal IV载体或对照载体转染至HeLa和SiHa细胞,通过G418筛选稳定克隆,并通过RT-PCR、Western blot和Lectin blot确认过表达效果。
分析ST3Gal IV过表达对宫颈癌细胞系N-聚糖谱的影响,以验证其酶活性改变。
提取细胞膜蛋白,纯化N-聚糖,进行全甲基化处理,然后通过MALDI-TOF/TOF MS分析,比较HeLa、HeLa/ST3Gal IV、SiHa和SiHa/ST3Gal IV细胞的N-聚糖图谱。
评估ST3Gal IV过表达对宫颈癌细胞增殖和克隆形成能力的影响。
通过CCK-8实验、细胞克隆形成实验和EdU实验检测ST3Gal IV过表达对HeLa和SiHa细胞增殖和DNA合成的影响。
检测ST3Gal IV过表达对细胞周期分布及Notch/p21/CDKs信号通路蛋白表达的影响。
通过流式细胞术分析细胞周期分布,通过Western blot检测Notch通路组分(Jagged1、Notch1、Hes1、Hey1)、p21、p53及细胞周期蛋白(Cyclin D1、Cyclin E1、CDK2、CDK4)的表达水平。
验证ST3Gal IV是否通过Notch信号通路调节增殖相关蛋白的表达。
用Notch抑制剂DAPT处理ST3Gal IV过表达细胞和mock细胞,通过Western blot检测Notch/p21/CDKs信号通路相关蛋白表达的变化。
在体内验证ST3Gal IV过表达对宫颈癌细胞致瘤性的影响。
将ST3Gal IV过表达或对照载体的HeLa细胞皮下注射至裸鼠,定期测量肿瘤体积和重量,并通过IHC和Western blot检测肿瘤组织中相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | -- | |
| 细胞转染 | pcDNA3.1/ST3Gal IV 载体 | -- | -- |
| 脂质体2000 | Invitrogen | -- | |
| G418 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Life Technologies | -- |
| PrimeScript RT 试剂盒 | Takara | -- | |
| qPCR 预混液 | Takara | -- | |
| ST3Gal IV 引物 | GenePharma | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Pall Corporation | -- | |
| ST3Gal IV抗体 | Proteintech | 13546-1-AP | |
| Jagged1抗体 | Elabscience | ENK5401 | |
| Notch1抗体 | Proteintech | 20687-1-AP | |
| Hes1抗体 | Elabscience | EAP2709 | |
| Hey1抗体 | Proteintech | 19929-1-AP | |
| p21抗体 | Bioworld | BS6501 | |
| p53抗体 | Bioworld | BS3156 | |
| Cyclin D1抗体 | Affinity Biosciences | DF6386 | |
| Cyclin E1抗体 | Bioworld | BZ00342 | |
| CDK2抗体 | Bioworld | BS1050 | |
| CDK4抗体 | Bioworld | BS6462 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Advansta | -- | |
| Lectin blot | 马鞍树凝集素II | Vector Laboratories | B-1265 |
| 生物素标记的黑接骨木凝集素 | Vector Laboratories | -- | |
| N-聚糖纯化 | CelLytic MEM 蛋白提取试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 二硫苏糖醇 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 肽N-糖苷酶F | Takara | -- | |
| Oasis MCX 固相萃取柱 | Waters | -- | |
| 质谱分析 | 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 | Bruker Daltonik | -- |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂 | -- | -- |
| 流式细胞术 | 核糖核酸酶 | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- | |
| EdU实验 | EdU试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 动物实验 | 裸鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 免疫组化 | 组织芯片类型、病例数(75例宫颈癌,5例正常)、IHC评分系统(German评分)、cut-off值(4)、抗体浓度(1:80)、染色方法 阅读提示:Materials and Methods: Immunohistochemistry; Results: ST3Gal IV Expression Is Negatively Related to the Malignant Degree of Cervical Cancer Tissues; Figure 1 legend |
| 稳定细胞系构建 | 细胞系(HeLa、SiHa)、转染载体(pcDNA3.1/ST3Gal IV)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、G418筛选浓度(HeLa 600μg/ml,SiHa 800μg/ml)、筛选时间(48h后) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Transfection; Results: Establishment of Stable ST3Gal IV-Upregulated Cervical Cancer Cell Lines |
| 体外增殖实验 | CCK-8细胞密度(4×10³/孔)、克隆形成细胞密度(1×10³/孔)、培养时间(2周)、EdU实验细胞培养时间(12h)、重复次数(至少3次) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Survival Assays by Cell Counting Kit-8 and Cell Colony Formation Assay; EdU Assay; Results: ST3Gal IV Overexpression Inhibits the Proliferation and Colony Formation Ability |
| 细胞周期分析 | 细胞固定方法(70%酒精,4℃过夜)、PI染色浓度(50 μg/ml)、RNase浓度(50 μg/ml)、孵育条件(4℃暗处30分钟)、流式细胞仪型号(FACSCalibur) 阅读提示:Materials and Methods: Flow Cytometry; Results: Upregulation of ST3Gal IV Blocks Cell Cycle in S Phase |
| 蛋白表达检测 | 蛋白提取方法、BCA定量、SDS-PAGE浓度(10%)、PVDF膜封闭条件(5%脱脂牛奶,室温2h)、一抗浓度及孵育条件(4℃ overnight)、二抗浓度(1:10000)及孵育时间(2h)、ECL显色 阅读提示:Materials and Methods: Western Blot Assay; Figure 5, 6 legends |
| N-聚糖分析 | 膜蛋白提取试剂盒(CelLytic MEM)、蛋白还原条件(DTT,56℃, 30min)、烷基化条件(碘乙酰胺,室温暗处1h)、胰蛋白酶消化条件(37℃,16h)、PNGase F浓度(3mU)及条件(37℃,过夜)、甲基化试剂(甲基碘)、MALDI-TOF/TOF MS参数 阅读提示:Materials and Methods: Purification of N-Glycans from Cell Membrane Proteins; Permethylation; Mass Spectrometry (MS); Results: MALDI-TOF MS Analysis for N-glycan Profiling |
| 体内异种移植 | 小鼠品系(裸鼠)、周龄(4-6周)、注射细胞数(2×10⁷)、注射部位(右背侧皮下)、分组(HeLa组、HeLa/ST3Gal IV组)、测量频率(每5天一次,持续一个月)、肿瘤体积计算公式 阅读提示:Materials and Methods: Xenograft Model; Results: ST3Gal IV Overexpression Inhibits the Tumorigenicity of HeLa Cells in Nude Mice |