EGFR在乳腺癌中的表达和激活分析
验证EGFR在人乳腺癌组织和细胞中的表达和激活水平及其与预后的关联。
利用Cbioportal和TCGA数据库分析EGFR基因扩增和mRNA表达;通过免疫组化检测74例乳腺癌和8例癌旁组织中EGFR蛋白表达;Western blot和RT-qPCR检测14对乳腺癌及癌旁组织、多种乳腺癌细胞系中EGFR、HER2和Trop2的表达。
A novel kinase inhibitor, Regorafenib, blocks EGFR-dependent signaling to repress tumour metastasis in human triple-negative breast cancers.
包含临床样本分析、体外细胞功能实验、体内动物模型验证及转录组学分析,并通过药理学抑制与基因敲低双重验证机制。
人三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-468和MDA-MB-231 人乳腺癌细胞系MCF-7、JIMT-1、SK-BR-3 MDA-MB-231尾静脉注射肺转移小鼠模型 MMTV-PyMT自发乳腺癌肺转移小鼠模型
EGFR抑制剂瑞戈非尼(1 μM)处理浓度 EGF刺激浓度100 ng/mL及刺激时间5分钟 MDA-MB-231细胞尾静脉注射剂量5×10^5细胞/200 μL/只 瑞戈非尼给药方案:10 mg/kg灌胃,隔日一次,持续8周 MMTV-PyMT小鼠模型:4周瑞戈非尼治疗
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证EGFR在人乳腺癌组织和细胞中的表达和激活水平及其与预后的关联。
利用Cbioportal和TCGA数据库分析EGFR基因扩增和mRNA表达;通过免疫组化检测74例乳腺癌和8例癌旁组织中EGFR蛋白表达;Western blot和RT-qPCR检测14对乳腺癌及癌旁组织、多种乳腺癌细胞系中EGFR、HER2和Trop2的表达。
明确EGFR激活或过表达是否诱导乳腺癌细胞发生上皮-间质转化并增强迁移侵袭能力。
构建EGFR激活突变(del19+L858R)和过表达质粒,稳定转染MCF-7、JIMT-1和MDA-MB-468细胞;通过Western blot和免疫荧光检测EMT标志物(vimentin、N-cadherin、E-cadherin)表达;划痕实验评估细胞迁移能力;并通过siRNA敲低EGFR作为补充验证。
评估瑞戈非尼对EGFR激酶活性的抑制效果及其对乳腺癌细胞增殖的影响。
采用Glo-kinase实验测定瑞戈非尼对EGFR激酶的IC50;CCK-8实验检测不同浓度瑞戈非尼处理24小时后对多种乳腺癌细胞增殖的抑制作用;Western blot检测瑞戈非尼处理后EGF刺激的EGFR磷酸化水平。
验证瑞戈非尼是否能抑制TGF-β1诱导的乳腺癌细胞上皮-间质转化。
使用TGF-β1处理MCF-7、MDA-MB-468和JIMT-1细胞3天或6天诱导EMT,同时加入瑞戈非尼处理;通过倒置显微镜观察细胞形态变化,Western blot检测EMT标志物表达。
评估瑞戈非尼对三阴性乳腺癌细胞迁移和侵袭能力的影响。
划痕实验和Transwell侵袭实验评估瑞戈非尼处理对MDA-MB-231细胞迁移和侵袭能力的影响。
在动物模型中验证瑞戈非尼对乳腺癌肺转移的抑制作用及其对生存期的影响。
建立MDA-MB-231尾静脉注射肺转移模型和MMTV-PyMT自发乳腺癌肺转移模型,给予瑞戈非尼治疗,统计肺转移结节数,H&E染色观察肺组织病理,记录生存期。
通过转录组测序分析瑞戈非尼治疗对肺转移灶基因表达的影响,寻找相关信号通路。
提取肺转移灶和癌旁组织RNA进行转录组测序,使用edgeR分析差异表达基因,进行KEGG通路富集分析。
阐明瑞戈非尼抑制EGFR下游信号通路的具体机制。
通过Western blot检测EGF刺激和瑞戈非尼处理后EGFR及其下游信号通路蛋白(Src、JNK、p38、YAP1、STAT3、NF-κB)的磷酸化水平变化;通过天然凝胶电泳检测EGFR二聚化和多聚化;通过Co-IP和质谱鉴定EGFR相互作用蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 瑞戈非尼 | MedChemExpress | HY-10331 |
| 肝细胞生长因子 | MedChemExpress | HY-P7121 | |
| BAY 60-6583 | MedChemExpress | HY-103171 | |
| 脱氢表雄酮 | MedChemExpress | HY-100197 | |
| 转化生长因子-β1 | MedChemExpress | HY-p70543 | |
| 多肽合成 | TSFSILMSPDSPD多肽 | Beijing Qingke Biological Company | -- |
| Western blot | EGFR抗体 | Proteintech | 51071-2-AP |
| HER2抗体 | Proteintech | 18299-1-AP | |
| 波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| N-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| 磷酸化STAT3抗体 | Proteintech | ET1603-40 | |
| 磷酸化JNK抗体 | Proteintech | 80024-1-RR | |
| β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 磷酸化EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 3777S | |
| Trop2抗体 | Cell Signaling Technology | 47866S | |
| 磷酸化Src抗体 | Cell Signaling Technology | 2105S | |
| 磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511T | |
| PKM2抗体 | Cell Signaling Technology | 4053T | |
| MMP1抗体 | Immunoway Technology | YT2792 | |
| 磷酸化YAP1抗体 | Immunoway Technology | R26121 | |
| 细胞刺激 | 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | GF316 |
| 溶血磷脂酸 | Sigma-Aldrich | L-7260 | |
| 质粒构建 | pCDH-EGFR-GFP-puro质粒 | Wuhan Miaoling Biological Technology Company | -- |
| pCMV-Flag-EGFR-del19 + L858R质粒 | Wuhan Miaoling Biological Technology Company | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| 慢病毒感染 | ViraPower慢病毒表达系统 | Invitrogen | -- |
| 激酶活性检测 | Kinase-Glo发光激酶检测试剂盒 | Promega | V6711 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 蛋白质提取 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 非变性凝胶上样缓冲液 | Beyotime | P0016N | |
| ECL化学发光试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ImageQuant LAS400成像系统 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | -- | -- |
| RNA测序 | VAHTS Universal V6 RNA-seq文库制备试剂盒 | -- | -- |
| NanoDrop 200分光光度计 | -- | -- | |
| Agilent 210生物分析仪 | -- | -- | |
| 显微镜观察 | Olympus 1120激光扫描共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| Leica Aperio Versa 200显微镜 | Leica | -- | |
| Leica DM4B显微镜 | Leica | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EGFR表达与激活分析 | EGFR组织芯片样本量(74例乳腺癌、8例癌旁组织);14对乳腺癌组织及配对癌旁组织中EGFR蛋白表达 阅读提示:Results 3.1及Figure 1 |
| 细胞培养与处理 | 细胞系、培养条件(DMEM+10%FBS+1%双抗)、EGF刺激浓度与时间(100 ng/mL, 5 min) 阅读提示:Materials and methods 2.4、2.7及Figure 5 legend |
| EGFR激活或过表达 | 质粒名称(pCDH-EGFR-GFP-puro, pCMV-Flag-EGFR-del19+L858R)、稳定转染细胞筛选 阅读提示:Materials and methods 2.3、2.4及Results 3.2 |
| 药物处理 | 瑞戈非尼浓度(1 μM)、处理时长(24小时) 阅读提示:Results 3.3及Figure 3 legend |
| 体外功能实验 | 细胞密度(5×10^4)、Transwell侵袭实验时间(24小时)、划痕实验观察时间、基质胶的使用与否 阅读提示:Materials and methods 2.7及Figure 4 legend |
| 动物模型 | 小鼠品系(NOD-SCID, MMTV-PyMT)、周龄(6-8周)、细胞注射剂量(5×10^5/200 μL)、给药剂量(10 mg/kg)、给药频率(隔日一次)、治疗周期(4周或8周)、每组动物数(n=6) 阅读提示:Materials and methods 2.9及Figure 4 legend |
| 转录组测序 | 每组样本数(6个)、样本分组(癌、瑞戈非尼、癌旁)、文库构建试剂盒 阅读提示:Materials and methods 2.11及Results 3.4 |
| 信号通路验证 | EGF刺激浓度与时间(100 ng/mL, 5 min)、瑞戈非尼处理浓度与时间(1 μM, 24 h)、抗体型号 阅读提示:Materials and methods 2.1、2.12及Figure 5 legend |