评估单药及联合用药的细胞毒性
测定黄芩苷和5-Fu对结直肠癌细胞活力的影响及半数抑制浓度(IC50),并评估联合用药是否具有协同作用。
使用CCK-8法检测HCT116和Lovo细胞经不同浓度黄芩苷、5-Fu及其联合处理后的活力,计算IC50并比较联合组与单药组的抑制作用。
Baicalin Augments 5-Fluorouracil Efficacy in Colorectal Cancer by Triggering MLKL-Dependent Necroptosis: A Novel Strategy to Overcome Chemoresistance.
包含体外功能实验(CCK-8、克隆形成、划痕、Transwell)、转录组测序、Western blot和qPCR验证机制,并通过MLKL抑制剂NSA进行功能回复实验,且经体内异种移植模型验证。
HCT116细胞系 Lovo细胞系 BALB/c裸鼠异种移植模型(皮下接种HCT116细胞)
细胞系:HCT116和Lovo,购自ATCC 药物浓度:Baicalin IC50分别为206.96 μM(HCT116)和363.41 μM(Lovo);5-Fu IC50分别为15.32 μM和53.87 μM;NSA IC50为124 nM 药物处理时间:24小时 体内给药剂量:Baicalin 50 mg/kg,5-Fu 20 mg/kg 体内给药方式:Baicalin和NSA每日腹腔注射,5-Fu每周两次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测定黄芩苷和5-Fu对结直肠癌细胞活力的影响及半数抑制浓度(IC50),并评估联合用药是否具有协同作用。
使用CCK-8法检测HCT116和Lovo细胞经不同浓度黄芩苷、5-Fu及其联合处理后的活力,计算IC50并比较联合组与单药组的抑制作用。
验证黄芩苷和5-Fu联合是否更有效抑制结直肠癌细胞的克隆形成、迁移和侵袭能力。
分别进行克隆形成实验、划痕愈合实验和Transwell迁移/侵袭实验,比较对照组、单药组和联合组的效果。
通过RNA-seq分析黄芩苷处理后的差异表达基因及富集通路,探索其潜在机制。
对黄芩苷处理的HCT116细胞和对照组进行RNA测序,分析差异表达基因(|log2FC|>1,校正p<0.05),并进行GO富集分析。
验证黄芩苷和5-Fu联合处理是否影响坏死性凋亡通路关键分子caspase-8、RIPK3和pMLKL的表达。
通过Western blot和qRT-PCR检测HCT116和Lovo细胞中各处理组(对照、黄芩苷、5-Fu、联合)中caspase-8、RIPK3、pMLKL的蛋白和mRNA表达水平。
验证MLKL介导的坏死性凋亡在黄芩苷和5-Fu协同抗结肠癌作用中的因果贡献。
在黄芩苷单药或联合5-Fu处理的同时加入MLKL特异性抑制剂NSA,评估其对克隆形成、迁移和侵袭的回复作用。
在体内验证抑制MLKL依赖性坏死性凋亡会减弱黄芩苷和5-Fu联合治疗的抗肿瘤效果。
BALB/c裸鼠皮下接种HCT116细胞,肿瘤体积约200 mm³时开始给药,设置对照组、黄芩苷组、联合组、联合加NSA组,治疗两周后测量肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Servicebio | #G4515 |
| 胎牛血清 | Procell | #164210 | |
| 青霉素-链霉素-两性霉素B溶液 | Servicebio | #G4015 | |
| 药物处理 | 黄芩苷 | Yuanye | #B20570 |
| 5-氟尿嘧啶 | Solarbio | #F8300 | |
| 坏死磺酰胺 | MedChemExpress | #1360614-48-7 | |
| Western blot | Caspase 8多克隆抗体 | Proteintech | #13423-1-AP |
| 磷酸化MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | #18640 | |
| RIPK3多克隆抗体 | Proteintech | #17563-1-AP | |
| β-肌动蛋白单克隆抗体 | Proteintech | #66009-1-Ig | |
| 偶联的山羊抗兔IgG多克隆抗体 | Huabio | #HA1121 | |
| 偶联的山羊抗小鼠IgG多克隆抗体 | Huabio | #HA1125 | |
| CCK-8实验 | 细胞计数试剂盒-8 | Servicebio | #G4103 |
| 克隆形成实验 | 结晶紫溶液 | Servicebio | #G1014-50 mL |
| Transwell侵袭实验 | BD基质胶 | Corning | #356234 |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Costar | #3422 |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| Evo M-MLV反转录预混液 | Accurate Biology | #AG11706 | |
| SYBR Green qPCR预混液 | Accurate Biology | #AG11761 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Epizyme | #ZJ101 |
| 近红外双色荧光成像系统 | Licor | Odyssey CLx | |
| RNA-seq | Illumina测序平台 | Illumina | -- |
| CCK-8实验 | BioTekSynergy酶标仪 | BioTek | Synergy |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源:HCT116和Lovo购自ATCC;培养基:高糖DMEM + 10% FBS + 1%青霉素-链霉素-两性霉素B;培养条件:5% CO2,37°C 阅读提示:Methods 4.1 Cell Culture |
| 药物处理 | Baicalin纯度>98%,5-Fu和Baicalin的浓度梯度(详见补充表S1);处理时间24小时 阅读提示:Methods 4.2 Reagents and Treatment;补充表S1 |
| CCK-8实验 | 细胞密度:2000细胞/孔;CCK-8孵育时间:2小时;吸光度:450 nm 阅读提示:Methods 4.3 CCK8 Assay |
| 克隆形成实验 | 细胞密度:500细胞/孔;培养周期:2周;固定:4%多聚甲醛20分钟;染色:0.1%结晶紫20分钟 阅读提示:Methods 4.4 Colony Formation Assay |
| 划痕愈合实验 | 细胞汇合度:约80%;划痕工具:无菌移液器吸头;迁移观察时间:0、12、24小时 阅读提示:Methods 4.5 Wound Healing Assay |
| Transwell实验 | 细胞密度:1×10^5细胞/孔;上室无血清培养基,下室含10% FBS;孵育时间:24小时;计数:200×显微镜 阅读提示:Methods 4.6 Transwell Assay |
| qRT-PCR | RNA提取:Trizol法;cDNA合成和qPCR试剂;引物序列:caspase-8、RIPK3、ACTB(见Methods 4.7);反应条件:95°C 20秒初始变性,40个循环(95°C 3秒,60°C 30秒) 阅读提示:Methods 4.7 Quantitative Real-Time PCR (qRT-PCR) |
| Western blot | 蛋白裂解:直接在培养皿中裂解;BCA法测定浓度;SDS-PAGE凝胶浓度:15%;封闭:5%脱脂牛奶TBST 1小时;一抗孵育4°C过夜;二抗室温1小时;检测:近红外双色荧光成像系统 阅读提示:Methods 4.8 Western Blot Analysis |
| RNA-seq | 测序平台:Illumina;差异表达基因筛选标准:|log2FC| > 1 且 adjusted p-value < 0.05;GO分析软件:R-4.2.3 阅读提示:Methods 4.9 RNA Sequencing and Bioinformatic Analysis |
| 体内异种移植模型 | 动物:SPF级BALB/c裸鼠,5-6周龄;细胞接种:HCT116 1×10^7细胞/100 μL皮下接种;给药:Baicalin 50 mg/kg每日腹腔注射,5-Fu 20 mg/kg每周两次,NSA剂量文中未明确说明;治疗起始:肿瘤体积约200 mm³;治疗时长:2周;样本量:n=6 阅读提示:Methods 4.10 In Vivo Xenograft Tumor Model;图6 |