化学成分鉴定
鉴定ZQ提取物中的主要化学成分。
利用UHPLC-Q-Exactive Plus Orbitrap HRMS对ZQ乙醇提取物进行分析,共鉴定出104种化合物。
Elucidating the PTK2-Targeted Anti-Hepatocellular Carcinoma Effects of Euphorbia helioscopia L. via Integrated Network Pharmacology, Mendelian Randomization, and Experimental Validation.
研究包含化学分析、网络药理学、MR分析、体内动物实验、分子对接和MD模拟等实验层级,但缺乏体外细胞实验和直接功能验证,完整度中等。
H22荷瘤小鼠模型(皮下移植)
ZQ提取物的剂量:低剂量232 mg/kg(0.91 g/kg ZQ)、高剂量928.2 mg/kg(3.64 g/kg ZQ),每日一次口服灌胃 H22细胞接种浓度和途径:1×10^7 cells/mL,0.2 mL皮下注射至右腋窝 治疗周期:14天 阳性对照药物:DOX,3 mg/kg,隔日一次尾静脉注射 Western blot检测:PTK2 (Tyr397)、PI3K (Y607)、AKT (Ser473) 磷酸化水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定ZQ提取物中的主要化学成分。
利用UHPLC-Q-Exactive Plus Orbitrap HRMS对ZQ乙醇提取物进行分析,共鉴定出104种化合物。
预测ZQ活性成分及其作用靶点,并构建“成分-靶点-通路”网络。
利用TCMSP筛选活性化合物,PubChem和SwissTargetPrediction预测靶点,GeneCards和OMIM获取HCC相关靶点,STRING构建PPI网络,DAVID进行GO和KEGG富集分析。
评估预测靶点与HCC风险的因果关联。
利用eQTLGen的血液cis-eQTL数据和GWAS Catalog的HCC GWAS数据,进行双样本MR分析,主要采用IVW方法,并进行了敏感性分析。
验证PTK2在HCC组织中的表达差异及诊断价值。
利用HCCDB、HPA、TCGA数据库分析PTK2表达水平,并绘制ROC曲线评估其诊断能力。
评估ZQ对H22荷瘤小鼠肿瘤生长的抑制作用及其对PTK2/PI3K/AKT通路的影响。
建立H22皮下移植瘤模型,随机分为对照组(生理盐水)、DOX组(3 mg/kg)、ZQ低剂量组(232 mg/kg提取物)和高剂量组(928.2 mg/kg提取物),连续治疗14天,测量肿瘤体积和重量,计算抑瘤率,并通过H&E染色和Western blot分析肿瘤坏死和蛋白磷酸化水平。
评估ZQ活性成分与PTK2蛋白的结合能力和稳定性。
将18种ZQ活性成分及Defactinib与PTK2进行分子对接,选取结合能低于-5 kcal/mol的化合物进行100 ns MD模拟,分析RMSD和RMSF。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学成分分析 | Hypersil Gold色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Vanquish超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Q Exactive Plus高分辨质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 甲酸 | Thermo Fisher Scientific | 214911 | |
| 动物实验 | 多柔比星 | Meilunbio | J06248 |
| 蛋白提取与Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013D |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| 十二烷基硫酸钠 | Solarbio | S8010-500g | |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| Western blot | 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 |
| 抗PTK2抗体 | Proteintech | 12636-1-AP | |
| 抗磷酸化PTK2 (Tyr397)抗体 | CST | #3283 | |
| 抗PI3K抗体 | Proteintech | 60225-1-Ig | |
| 抗磷酸化PI3K (Y607)抗体 | Affinity Biosciences | AF3241 | |
| 抗AKT抗体 | Proteintech | 10176-2-AP | |
| 抗磷酸化AKT (Ser473)抗体 | CST | #4060 | |
| HRP标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| ECL底物 | Biosharp | BL520A | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 动物实验 | 羧甲基纤维素钠 | -- | -- |
| 仪器 | Allegra X-30R离心机 | Beckman Coulter | -- |
| 电泳仪 | Liuyi | DYY-6C | |
| 酶标仪 | PerkinElmer | EnSpire | |
| 成像系统 | Leica Instruments Shanghai Co., Ltd. | LEICA DM750 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 化学成分分析 | ZQ提取方法:70%乙醇回流提取,提取物剂量需核实;色谱条件:Hypersil Gold柱,流动相梯度,流速0.3 mL/min,柱温40 °C 阅读提示:Methods 2.1和2.4 |
| 网络药理学分析 | 筛选标准:TCMSP活性成分筛选OB≥30%,DL≥0.18;靶点预测概率>10;PPI网络置信度≥0.9 阅读提示:Methods 2.5 |
| 孟德尔随机化分析 | 数据来源:eQTLGen全血cis-eQTL数据(n=31,684),HCC GWAS数据(123例,456,225对照);工具变量筛选条件:F>20,p<5×10^-8,LD r2<0.001 阅读提示:Methods 2.6 |
| 动物实验 | 动物品系、周龄、体重:雄性ICR小鼠,4周龄,20±2 g;样本量:每组6只;H22细胞接种浓度和途径:1×10^7 cells/mL,0.2 mL皮下注射;给药方案:ZQ低剂量232 mg/kg(0.91 g/kg)、高剂量928.2 mg/kg(3.64 g/kg)每日灌胃,DOX 3 mg/kg隔日尾静脉注射;治疗周期:14天 阅读提示:Methods 2.8 |
| Western blot | 抗体稀释比例:GAPDH 1:5000,PTK2 1:20000,p-PTK2 1:1000,PI3K 1:5000,p-PI3K 1:1000,AKT 1:2000,p-AKT 1:2000;蛋白提取和检测条件 阅读提示:Methods 2.9 |
| 分子对接和MD模拟 | 对接软件:AutoDock Vina;筛选阈值:结合能< -5 kcal/mol;MD模拟软件:GROMACS;模拟时间:100 ns 阅读提示:Methods 2.10 |