FOSL1通过TCOF1介导的核糖体生物发生促进非同小细胞肺癌的同源重组修复和喜树碱耐药

FOSL1 promotes homologous recombination repair and camptothecin resistance via TCOF1-mediated ribosome biogenesis in non-small cell lung cancer.

作者信息Chunmei Hao, Luojun Chen, Fuben Liao, Lulu Chen, Yi Yao, Qibin Song
PMID41687404
发布时间2026-04
DOI10.1016/j.tranon.2026.102701

实验完整度

包含细胞系功能实验、HR/NHEJ报告基因、核糖体生物发生检测、转录靶标验证及体内异种移植模型等多个独立证据层级,并进行机制验证。

主要模型

A549细胞系 H157细胞系 A549异种移植瘤裸鼠模型 LUAD患者单细胞转录组队列

重点核对

FOSL1敲低或过表达对CPT敏感性的影响 DR-GFP和EJ5-GFP报告基因检测HR和NHEJ效率 BMH-21抑制核糖体生物发生及CPT联合效果 FOSL1对TCOF1转录激活的荧光素酶报告验证 异种移植模型中FOSL1敲低和BMH-21联合CPT的抗肿瘤效果

摘要

喜树碱(CPT)及其衍生物是重要的化疗药物;然而,内在性和获得性耐受经常限制其长期疗效。本研究旨在确定非小细胞肺癌(NSCLC)中CPT反应性的关键转录调控因子,并阐明其潜在的分子机制。方法:基于单细胞RNA测序的转录组分析,结合批量RNA-seq,用于优先考虑CPT反应性转录程序并提名候选调控因子。在NSCLC细胞系中使用功能获得和丧失功能的方法验证了功能作用。使用分子和报告基因测定评估DNA损伤修复、核糖体生物发生和翻译活性。使用RNA聚合酶I抑制剂BMH-21评估核糖体生物发生的药理学抑制,并在异种移植模型中进一步检查治疗相关性。结果:我们确定FOSL1是一种CPT反应性转录因子,与肺腺癌的不良预后相关。CPT处理诱导FOSL1表达和核积累,而FOSL1缺失显著增强CPT诱导的细胞毒性。机制上,FOSL1缺失导致持续的DNA损伤积累和同源重组(HR)修复的选择性损伤。FOSL1通过转录激活TCOF1促进核糖体生物发生,间接维持HR修复。核糖体生物发生的药理学抑制表型复制了FOSL1缺失,并在体外和体内显著增强了CPT的功效。结论:我们的研究定义了FOSL1-TCOF1-核糖体轴,通过维持HR修复促进NSCLC中的CPT耐受。这些发现为靶向核糖体生物发生以增强基于CPT的治疗提供了理论依据,并强调了化疗应激下转录、蛋白质合成和DNA修复的协调调控。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
非小细胞肺癌中调控喜树碱反应性并介导耐药的关键转录因子及其分子机制是什么?
核心机制
FOSL1通过转录激活TCOF1促进核糖体生物发生,维持翻译能力,从而确保同源重组修复因子(如BRCA1和RAD51)的合成,促进HR修复,赋予CPT耐受。
主要证据
单细胞和批量转录组分析鉴定FOSL1;细胞实验显示FOSL1缺失增强CPT毒性、减少HR修复;分子实验证明FOSL1调控TCOF1和核糖体生物发生;体内异种移植模型证实靶向该轴增强CPT疗效。
研究意义
研究定义了一个FOSL1-TCOF1-核糖体轴,促进NSCLC中的CPT耐受,为靶向核糖体生物发生以增强基于CPT的治疗提供了理论依据,并强调了转录、蛋白质合成和DNA修复的协调调控。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

转录组分析鉴定关键调控因子

筛选CPT反应性转录程序并确定潜在的关键转录因子。

利用批量RNA-seq和WGCNA定义CPT响应样转录特征,整合单细胞RNA-seq和SCENIC分析,鉴定FOSL1为候选调控因子。

2

FOSL1功能验证

验证FOSL1是否影响NSCLC细胞对CPT的敏感性。

通过敲低和过表达FOSL1,检测CPT处理后的细胞活力、集落形成和凋亡。

3

DNA损伤和修复评估

确定FOSL1对CPT诱导的DNA损伤及修复途径的影响。

检测γ-H2AX水平评估DNA损伤,使用DR-GFP和EJ5-GFP报告系统分析HR和NHEJ效率,并检测相关修复蛋白表达。

4

核糖体生物发生和翻译评估

探究FOSL1是否通过调控核糖体生物发生影响蛋白质合成。

通过免疫荧光、透射电镜检测核仁形态,RT-qPCR检测rRNA水平,嘌呤霉素掺入实验评估蛋白质合成。

5

转录靶标验证

验证FOSL1是否直接转录激活TCOF1。

通过RNA-seq鉴定FOSL1调控的基因,结合RiboSis基因集筛选TCOF1,并用双荧光素酶报告实验验证FOSL1对TCOF1启动子的激活。

6

TCOF1功能验证

验证TCOF1是否介导FOSL1驱动的核糖体生物发生和HR修复。

敲低TCOF1,检测47S pre-rRNA水平、蛋白质合成、HR/NHEJ效率及DNA损伤标志物。

7

药理学抑制核糖体生物发生

评估RNA聚合酶I抑制剂BMH-21对CPT敏感性的影响。

使用BMH-21处理细胞,检测rRNA合成、蛋白质合成、γ-H2AX水平、细胞活力和凋亡。

8

体内异种移植模型验证

在体内验证FOSL1和核糖体生物发生抑制对CPT抗肿瘤效果的影响。

建立A549-shGFP或A549-shFOSL1皮下异种移植模型,单独或联合CPT和BMH-21处理,评估肿瘤生长和免疫组化标志物。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
喜树碱MedChemExpressHY-16560
BMH-21MedChemExpressHY-12484
DMEM培养基Gibco--
RPMI-1640培养基Gibco--
聚凝胺----
Lipofectamine RNAiMAX转染试剂Invitrogen13778075
AFTSpin组织/细胞快速RNA提取试剂盒(动物)AbclonalRK30120
ABScript II cDNA第一链合成试剂盒AbclonalRK20400
CCK-8试剂盒Dojindo--
Annexin V-APC/DAPI染色试剂Elabscience--
嘌呤霉素----
抗嘌呤霉素单克隆抗体Abcamab315887
pGL3-Basic载体Sangon Biotech--
pRL-TK载体Promega--
双荧光素酶报告基因检测系统PromegaE1910
BALB/c-nu裸鼠Beijing Vital River Laboratory Animal Technology--
蔡司Axio Scan.Z1扫描仪Zeiss--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
A549和H157细胞系来源、培养基(DMEM或RPMI-1640)、培养条件(37°C,5% CO2)
阅读提示:Materials and methods: Cell lines and reagents
药物处理
CPT浓度(30 nM)、处理时间(6小时或48小时)、BMH-21浓度(0.2 μM)
阅读提示:Materials and methods: Cell lines and reagents; Results: Figure legends
FOSL1敲低和过表达
shRNA序列、siRNA序列、转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX)、转染浓度(20 nM)、筛选浓度(嘌呤霉素2 μg/mL)
阅读提示:Materials and methods: Plasmids, lentivirus packaging, and infection; RNA interference assay
HR和NHEJ报告基因检测
DR-GFP和EJ5-GFP报告细胞系、I-SceI表达载体(pCBASceI)、转染后48小时检测GFP阳性细胞
阅读提示:Materials and methods: HR and NHEJ reporter assay
体内异种移植模型
小鼠品系(BALB/c-nu)、年龄(5周)、重量(约20g)、接种细胞数(5×10^6)、给药方案(CPT 2 mg/kg,BMH-21 25 mg/kg,隔天一次,共7次)
阅读提示:Materials and methods: Xenograft tumor assay; Results: Figure 9 legend