网络药理学分析
识别 DHQ 与 MASLD 的共同靶点及相关信号通路。
利用 GeneCards、Super-PRED、TargetNet 数据库预测 DHQ 和 MASLD 的靶点,取交集获得共同靶点,并进行 PPI 网络分析、GO 和 KEGG 富集分析,以及分子对接验证。
Molecular Mechanism of Dihydroquercetin in Ameliorating Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease: Insights Into the HIF-1α/VEGF Pathway.
包含网络药理学分析、分子对接、小鼠体内模型和 HepG2 细胞体外模型,并通过 CoCl2 激动剂实验进行了功能验证和机制验证。
高脂饮食诱导的 MASLD 小鼠模型 游离脂肪酸诱导的 HepG2 细胞脂肪变性模型
小鼠分组:Control、Model、DHQ-L (40 mg/kg)、DHQ-H (80 mg/kg),每组 6 只 小鼠给药方式:腹腔注射,0.01 mL/g,每日一次,持续 6 周 HepG2 细胞分组:Control、Model、DHQ-L (50 μmol/L)、DHQ-H (100 μmol/L)、CoCl2 (100 μM)、DHQ-H + CoCl2 HepG2 细胞处理时间:24 小时 细胞实验重复数:至少三次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别 DHQ 与 MASLD 的共同靶点及相关信号通路。
利用 GeneCards、Super-PRED、TargetNet 数据库预测 DHQ 和 MASLD 的靶点,取交集获得共同靶点,并进行 PPI 网络分析、GO 和 KEGG 富集分析,以及分子对接验证。
评估 DHQ 对高脂饮食诱导的 MASLD 小鼠的治疗效果。
将小鼠分为四组,给予高脂饮食建立 MASLD 模型,并通过腹腔注射 DHQ 或对照干预,检测体重、肝重、血清生化指标、炎症因子、肝脏组织病理及脂质代谢相关蛋白和 HIF-1α/VEGF 通路表达。
验证 DHQ 对游离脂肪酸诱导的 HepG2 细胞脂肪变性的作用,并探究 HIF-1α 通路参与机制。
用油酸处理 HepG2 细胞建立 MASLD 模型,给予不同浓度 DHQ,并使用 CoCl2 激活 HIF-1α,检测脂质积累、炎症因子表达及 HIF-1α/VEGF 通路变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 玉米油 | -- | -- |
| 生理盐水 | Beyotime | ST341 | |
| 细胞培养 | HepG2 细胞系 | Wuhan Puno Sai Life Technology Co. Ltd. | CL-0103 |
| DMEM 培养基 | Solarbio | 11995 | |
| 胎牛血清 | Beyotime | C0226 | |
| 青霉素-链霉素 | Pricella | PB180120 | |
| 药物处理 | 油酸 | Solarbio | ST2053 |
| 组织学 | 倒置荧光显微镜 | OLYMPUS | CKX53 |
| 生化检测 | 总胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A111-1-1 |
| 低密度脂蛋白胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A113-1-1 | |
| 高密度脂蛋白胆固醇测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A112-1-1 | |
| 丙氨酸氨基转移酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | C009-2-1 | |
| 天冬氨酸氨基转移酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | C010-2-1 | |
| 甘油三酯测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A110-1-1 | |
| ELISA | 小鼠 TNF-α ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10851 |
| 小鼠 IL-6 ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10187 | |
| 小鼠 IL-1β ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10173 | |
| 小鼠 IL-18 ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10172 | |
| 人 TNF-α ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB11762 | |
| 人 IL-6 ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10373 | |
| 人 IL-1β ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10347 | |
| 人 IL-18 ELISA 试剂盒 | COIBO BIO | CB10313 | |
| 酶标仪 | MOLECULAR DEVICES | CMaxPlus | |
| 细胞脂质积累观察 | 油红 O 染色试剂盒 | Beyotime | C0157S |
| 倒置显微镜 | Jiangnan | XD-202 | |
| RT-qPCR | TRIzol 试剂 | Beyotime | R0016 |
| mRNA 第一链 cDNA 合成试剂盒 | Beyotime | D7178M | |
| SYBR Green 一步法 qRT-PCR 试剂盒 | Beyotime | D7268S | |
| 荧光定量 PCR 仪 | Roche | LightCycler96 | |
| Western Blot | RIPA 裂解液 | Beyotime | P0013B |
| BCA 蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| SDS-PAGE 凝胶 | Beyotime | P0015A | |
| PVDF 膜 | Beyotime | P0021S | |
| ECL 试剂盒 | Pierce, Thermo Fisher | 35055 | |
| LKB1 抗体 | Abcam | ab199970 | |
| p-LKB1 抗体 | Abcam | ab63473 | |
| AMPK-α 抗体 | Abcam | ab32047 | |
| p-AMPK-α 抗体 | Abcam | ab133448 | |
| ACC 抗体 | Abcam | ab45174 | |
| p-ACC 抗体 | Abcam | ab68191 | |
| HIF-1α 抗体 | Servicebio | GB111339-100 | |
| VEGF 抗体 | Servicebio | GB114200-100 | |
| GAPDH 抗体 | Servicebio | GB15002-100 | |
| 二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2305 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 网络药理学分析 | 数据来源、靶点预测工具参数、富集分析数据库版本 阅读提示:Materials and Methods 2.1 小节,图 1 图注 |
| 动物实验 | 小鼠品系、性别、周龄、体重、数量和分组;高脂饮食诱导时间和给药方案 阅读提示:Materials and Methods 2.3 小节,图 2 图注 |
| 细胞实验 | 细胞系和来源;培养条件;油酸浓度;DHQ 浓度;CoCl2 浓度;处理时间 阅读提示:Materials and Methods 2.4 小节,图 4 图注 |
| Western Blot | 抗体稀释比例、孵育时间、显色方法 阅读提示:Materials and Methods 2.10 小节 |