自然衰老小鼠模型表征
研究年龄相关的RPE/脉络膜复合体中铁死亡和EMT标志物的变化。
使用8周和18月龄C57BL/6J小鼠,通过PAS染色观察视网膜形态,检测Fe2+含量、MDA水平、衰老标志物p16/p21和EMT标志物(Vimentin、N-cadherin、E-cadherin)的表达。
The contribution of ferroptosis to the epithelial-mesenchymal transition phenotype in models of age-related macular degeneration.
研究包含自然衰老小鼠模型、D-gal和SI诱导的细胞模型等至少两个独立证据层级,并通过Fer-1抑制实验进行功能验证。
ARPE-19细胞系(D-半乳糖诱导衰老模型) ARPE-19细胞系(碘酸钠诱导氧化损伤模型) 自然衰老小鼠(18月龄)RPE/脉络膜复合体
D-gal处理浓度200 mM,处理72小时 SI处理浓度2 mM,处理48小时 Fer-1预处理浓度20 μM,处理2小时 ARPE-19细胞分化条件:Laminin包被,nicotinamide处理至少2周 细胞活力检测使用CCK-8试剂盒
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究年龄相关的RPE/脉络膜复合体中铁死亡和EMT标志物的变化。
使用8周和18月龄C57BL/6J小鼠,通过PAS染色观察视网膜形态,检测Fe2+含量、MDA水平、衰老标志物p16/p21和EMT标志物(Vimentin、N-cadherin、E-cadherin)的表达。
建立D-gal诱导的衰老模型和SI诱导的氧化损伤模型,并确定合适的处理条件。
使用不同浓度和时间处理ARPE-19细胞,通过SA-β-gal染色评估衰老,CCK-8评估活力,Western blot检测p16/p21。
验证D-gal和SI处理是否诱导ARPE-19细胞发生EMT。
通过免疫荧光检测Vimentin和α-SMA表达,Western blot检测上皮标志物(β-catenin、ZO-1、E-cadherin)和间充质标志物(Vimentin)的变化。
验证D-gal和SI处理是否诱导铁死亡相关应激。
使用DCFH-DA探针检测ROS,C11-BODIPY检测脂质过氧化,Western blot检测xCT和GPX4表达。
验证铁死亡是否参与D-gal和SI诱导的EMT和衰老。
使用Fer-1预处理细胞,检测ROS、脂质过氧化、Fe2+水平、xCT/GPX4表达、SA-β-gal染色、SASP因子(IL-6/IL-8)和EMT标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F-12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 层粘连蛋白 | Biolamina | -- | |
| 烟酰胺 | MCE | -- | |
| 药物处理 | D-半乳糖 | -- | -- |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | C0037 |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA探针 | Beyotime | S0033S |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY 581/591探针 | Thermo Fisher | D3861 |
| 细胞衰老检测 | SA-β-半乳糖苷酶染色试剂盒 | Beyotime | C0602 |
| 铁含量检测 | 亚铁比色检测试剂盒 | Beyotime | S1066S |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 |
| 细胞因子检测 | IL-6 ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-7066 |
| IL-8 ELISA试剂盒 | Invitrogen | 88-8086 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Beyotime | P0131 |
| Vimentin抗体 | ZenBio | R22775 | |
| α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| Western blot | β-catenin抗体 | Proteintech | 51067-2-AP |
| E-cadherin抗体 | zenbio | R22490 | |
| ZO-1抗体 | Affinity | AB_2837631 | |
| N-cadherin抗体 | Abmart | T55015 | |
| GPX4抗体 | Proteintech | 67763-1-Ig | |
| β-actin抗体 | Abclonal | AC026 | |
| xCT抗体 | Proteintech | 26864-1-AP | |
| p21抗体 | Abmart | TA5484F | |
| p16INK4a抗体 | Abmart | T55543F | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| PAS染色 | 希夫试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | 6孔板 | Corning | -- |
| 24孔板 | -- | -- | |
| 96孔板 | -- | -- | |
| 显微镜 | 奥林巴斯显微镜 | Olympus | -- |
| 荧光显微镜 | 奥林巴斯IX73P1F倒置荧光显微镜 | Olympus | -- |
| 流式细胞术 | Beckman CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与分化 | ARPE-19细胞密度1.6×105 cells/cm2,Laminin包被浓度10 μg/mL,nicotinamide浓度10 mM,分化培养至少2周 阅读提示:Materials and methods 2.2 Cell culture |
| 衰老模型诱导 | D-gal浓度200 mM,处理72小时 阅读提示:Materials and methods 2.2 Cell culture; Figure 2 legend |
| 氧化损伤模型诱导 | SI浓度2 mM,处理48小时 阅读提示:Materials and methods 2.2 Cell culture; Figure 2 legend |
| 铁死亡抑制 | Fer-1浓度20 μM,预处理2小时 阅读提示:Materials and methods 2.2 Cell culture; Figure 5-9 legends |
| 分子检测 | Western blot抗体及稀释比例、免疫荧光抗体及稀释比例 阅读提示:Materials and methods 2.7 Western blot; Figure legends |