化合物分离与结构鉴定
从云南松树脂中分离并鉴定松香烷型二萜类化合物
采用石油醚和95%乙醇提取云南松树脂,通过MCI gel、硅胶柱色谱等方法分离得到10个化合物,利用HRESIMS、NMR、ECD计算和X射线衍射确定结构。
Abietane-Type Diterpenoids from the Resin of Pinus yunnanensis and Their Potential Anti-Renal Fibrosis Activities.
包含化合物分离、结构鉴定(波谱及计算)、体外细胞活力与Western blot实验,但缺乏动物模型和功能验证。
TGF-β1诱导的NRK-52E细胞(大鼠肾小管上皮细胞) TGF-β1诱导的NRK-49F细胞(大鼠肾成纤维细胞)
NRK-52E细胞用5% FBS培养,NRK-49F细胞用10% FBS培养,均含1%青霉素/链霉素 细胞处理:血清饥饿6小时后,加入TGF-β1(10 ng/mL)和/或化合物,处理48小时 p-Smad2和p-Smad3检测:TGF-β1处理仅2小时 化合物浓度:40 μM用于初筛,剂量反应实验使用不同浓度(未明确具体浓度) Western blot实验重复三次,定量分析使用ImageJ和GraphPad Prism
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从云南松树脂中分离并鉴定松香烷型二萜类化合物
采用石油醚和95%乙醇提取云南松树脂,通过MCI gel、硅胶柱色谱等方法分离得到10个化合物,利用HRESIMS、NMR、ECD计算和X射线衍射确定结构。
排除化合物对细胞活力的影响
使用CCK-8法检测化合物在40 μM浓度下对NRK-52E和NRK-49F细胞活力的影响。
评估化合物对TGF-β1诱导的纤维化标志物表达的影响
在TGF-β1诱导的NRK-52E和NRK-49F细胞中,用Western blot检测α-SMA、纤连蛋白和胶原蛋白I的表达。
确定化合物对纤维化标志物抑制作用的剂量依赖性
对化合物1、3、6–8和10进行剂量反应实验,使用Western blot检测不同浓度下纤维化标志物的表达。
探讨化合物是否通过抑制TGF-β/Smad信号通路发挥抗纤维化作用
在NRK-52E细胞中,用Western blot检测Smad2/3磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | NRK-52E细胞 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | -- |
| NRK-49F细胞 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| DMEM培养基 | Shanghai VivaCell Biosciences Ltd. | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich LLC. | -- | |
| 细胞活力测定 | CCK-8试剂盒 | Shenzhen Laibo Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| Western blot | 重组人TGF-β1 | MedChemExpress | HY-P70543 |
| GW788388 | -- | -- | |
| RIPA裂解液 | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd. | R21237 | |
| 蛋白酶抑制剂 | MIKX Biotechnology Co., Ltd. | DB612A | |
| 磷酸酶抑制剂 | Meilun Biotechnology Co., Ltd. | MB12707 | |
| PVDF膜 | Cytiva | 10600023 | |
| 抗GAPDH抗体 | Servicebio Technology Co., Ltd. | GB15002 | |
| 抗α-SMA抗体 | Sigma-Aldrich | A5228 | |
| 抗Smad3抗体 | ABclonal Technology | A16913 | |
| 抗p-Smad3抗体 | Cell Signaling Technology | #8828 | |
| 抗胶原蛋白I抗体 | Abcam | ab270993 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Abcam | ab2413 | |
| 抗Smad2抗体 | Abcam | ab40855 | |
| 抗p-Smad2抗体 | Abcam | ab280888 | |
| HRP标记的二抗(抗兔) | Cell Signaling Technology | #7074 | |
| HRP标记的二抗(抗小鼠) | Cell Signaling Technology | #7076 | |
| ECL试剂盒 | MIKX Biotechnology Co., Ltd. | MK-S400 | |
| 化合物分离 | MCI凝胶CHP 20P | Mitsubishi Chemical Industries | -- |
| 硅胶 | Qingdao Marine Chemical Inc. | -- | |
| C-18反相硅胶 | Daiso Co., Ltd. | -- | |
| Sephadex LH-20 | Amersham Pharmacia | -- | |
| 结构鉴定 | 安东帕MCP 100旋光仪 | Anton Paar GmbH | -- |
| Jasco J-815圆二色光谱仪 | JASCO | -- | |
| Bruker Avance III 600 MHz核磁共振波谱仪 | Bruker | -- | |
| SCIEX X500R QTOF质谱仪 | AB Sciex LLC | -- | |
| 半制备高效液相色谱 | Saipuruisi (SEP) | LC-52 | |
| YMC-Pack ODS-A色谱柱 | YMC | -- | |
| 制备高效液相色谱 | Saipuruisi (SEP) | LC-52 | |
| YMC-Actus ODS-A色谱柱 | YMC | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:NRK-52E和NRK-49F细胞购自Procell Life Science & Technology;培养基为高糖DMEM(VivaCell),分别添加5%和10% FBS,并含1%青霉素/链霉素。 阅读提示:见“Materials and Methods, 3.7 Cell Culture” |
| 细胞活力测定 | CCK-8检测细节:细胞饥饿6小时后,用40 μM化合物处理48小时,CCK-8孵育25分钟,测450 nm吸光度。 阅读提示:见“Materials and Methods, 3.8 Cell Viability” |
| Western blot | TGF-β1处理浓度(10 ng/mL)和时间(48小时),p-Smad2/3检测时TGF-β1处理仅2小时;化合物处理浓度(40 μM及剂量反应未明确具体浓度)。 阅读提示:见“Materials and Methods, 3.9 Western Blot” |
| Western blot | 抗体信息:包括抗GAPDH (GB15002)、抗α-SMA (A5228)、抗Smad3 (A16913)、抗p-Smad3 (#8828)、抗collagen I (ab270993)、抗fibronectin (ab2413)、抗Smad2 (ab40855)、抗p-Smad2 (ab280888)等。 阅读提示:见“Materials and Methods, 3.9 Western Blot”中的抗体列表 |
| 统计学分析 | 数据以mean ± SEM表示,来自三次独立实验;统计分析用单因素方差分析(one-way ANOVA),p<0.05有意义。 阅读提示:见“Materials and Methods, 3.9 Western Blot”和图表说明 |