TSCI损伤局部铁死亡的鉴定
确定TSCI损伤部位是否发生铁死亡及其特征。
使用Western blot检测铁死亡相关蛋白(ACSL4、LPCAT3、GPX4、FTH1),GSSG/GSH量化分析,MDA检测脂质过氧化,Perl's染色检测铁沉积,免疫荧光检测4-HNE分布,JC-1染色评估线粒体功能,并进行脂质代谢组学分析。
PPARa-FSP1 axis modulates lipid peroxidation-induced neuronal ferroptosis to promote functional recovery in mouse model of traumatic spinal cord injury.
包含体内动物模型实验、体外细胞系实验、分子机制验证(CUT&Tag、双荧光素酶报告基因)及行为学评估等多个独立证据层级。
小鼠创伤性脊髓损伤模型(C57BL/6雌性小鼠) N2A细胞系 HT22细胞系
PPARa过表达慢病毒(Lv-PPARa)与敲低慢病毒(Lv-PPARa RNAi)的构建及感染效率验证 铁死亡诱导剂Erastin和RSL3的浓度(10μM和1μM)及处理时间(24小时) FSP1抑制剂icFSP1的浓度(体外2.5μM,体内20mg/kg)及给药方式(灌胃) 小鼠TSCI模型的建立方法(T12椎板切除,10g重物从5cm高度撞击) 体内实验分组(Mock、Lv-PPARa、Lv-PPARa+icFSP1)及检测指标(MAP2、NeuN、β3-tubulin、4-HNE、MDA、CoQ10、NADH)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TSCI损伤部位是否发生铁死亡及其特征。
使用Western blot检测铁死亡相关蛋白(ACSL4、LPCAT3、GPX4、FTH1),GSSG/GSH量化分析,MDA检测脂质过氧化,Perl's染色检测铁沉积,免疫荧光检测4-HNE分布,JC-1染色评估线粒体功能,并进行脂质代谢组学分析。
验证TSCI导致PPARa表达下降,并评估PPARa激动剂对神经元存活和运动功能的影响。
Western blot、RT-qPCR和免疫荧光检测PPARa表达和分布;给予PPARa激动剂Fenofibrate或拮抗剂GW6471,检测成熟神经元标志物(MAP2、NeuN)、轴突标志物β3-tubulin、BMS评分。
评估PPARa活性对脂质过氧化、铁死亡标志物和线粒体形态的影响。
检测MDA、4-HNE水平,GSSG/GSH比率,TEM观察线粒体形态,Western blot检测铁死亡相关蛋白(LPCAT3、GPX4、FTH1、FSP1)。
在细胞模型中验证PPARa激动剂对铁死亡诱导剂引起的细胞死亡和脂质过氧化的保护作用。
使用N2A和HT22细胞,Erastin和RSL3诱导铁死亡,CCK-8检测细胞活力,流式细胞术检测ROS和脂质ROS,MDA检测,Bodipy C11染色,GSSG/GSH检测,Western blot检测PPARa和铁死亡相关蛋白。
验证PPARa作为转录因子直接调控FSP1表达,并确认FSP1-CoQ10-NAD(P)H通路在保护效应中的作用。
构建PPARa过表达和敲低的稳定细胞系,检测FSP1表达;JASPAR预测结合位点;CUT&Tag和Sanger测序验证PPARa与FSP1启动子结合;双荧光素酶报告基因检测转录激活;检测CoQ10、NADH水平;使用icFSP1抑制FSP1后观察细胞活力、ROS、脂质过氧化等变化。
在TSCI小鼠模型中确认PPARa通过FSP1保护神经元并促进运动功能恢复。
通过脊髓内注射慢病毒过表达或敲低PPARa,构建PPARa过表达+icFSP1组,检测FSP1表达、成熟神经元标志物(MAP2、NeuN)、β3-tubulin、4-HNE、MDA、CoQ10、NADH、TEM线粒体形态,进行BMS评分。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 小鼠脊髓撞击器 | RWD | 68097 |
| 细胞培养 | DMEM/Ham's F-12 (1:1)培养基 | Thermo Fisher Scientific | 12634010 |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | A5256701 | |
| 青霉素和链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| 药物处理 | 非诺贝特 | Selleck | S1794 |
| GW6471 | Selleck | S2798 | |
| icFSP1 | Selleck | E1535 | |
| Fer-1 | Selleck | S7243 | |
| Erastin | Selleck | S7242 | |
| RSL3 | Selleck | S8155 | |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化探针 - BDP 581/591 C11 | DOJINDO | L267 |
| 代谢检测 | NAD/NADH检测试剂盒-WST | DOJINDO | N509 |
| 铁检测 | FerroOrange | DOJINDO | F374 |
| CUT&Tag | Hyperactive InSitu Universal CUT&Tag检测试剂盒(Illumina Pro) | Vazyme Biotech | TD904-02 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Solarbio | D0011 |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- | |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | -- | |
| Sanger测序 | Big Dye Terminator v3.1循环测序试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| DNA分析仪3730XL | Applied Biosystems | -- | |
| 抗体 | β-Actin (13E5)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 |
| ACSL4 (F6T3Z)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 38493 | |
| GPX4 (E5Y8K)兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 59735 | |
| MAP2抗体 | Cell Signaling Technology | 4542 | |
| NeuN (D4G4O) XP兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | #24307 | |
| GFAP (GA5)小鼠单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | #3670 | |
| Iba1/AIF-1 (E4O4W) XP兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 17198 | |
| LPCAT3兔单克隆抗体 | ABclonal Biotechnology | A26617 | |
| 铁蛋白重链兔多克隆抗体 | ABclonal Biotechnology | A25458PM | |
| FSP1兔单克隆抗体 | ABclonal Biotechnology | A22278 | |
| β3-微管蛋白兔单克隆抗体 | ABclonal Biotechnology | A17913 | |
| 三甲基组蛋白H3-K4兔单克隆抗体 | ABclonal Biotechnology | A22146 | |
| 山羊抗兔IgG | ABclonal Biotechnology | AS070 | |
| 抗PPARa (磷酸化S12)多克隆抗体 | Abcam | ab3484 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (HRP) | Abcam | ab6789 | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) | Abcam | ab6721 | |
| PPARa单克隆抗体 (3B6/PPAR) | Thermo Fisher Scientific | MA1-822 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与分组 | 小鼠品系、年龄、体重、性别(雌性C57BL/6)、TSCI造模方法(T12椎板切除,10g重物从5cm高度撞击)、药物剂量、给药途径、给药起始时间及持续时间。 阅读提示:Materials and methods: Animals, Traumatic spinal cord injury |
| 细胞培养与处理 | 细胞系(N2A、HT22)的来源、培养基成分、培养条件、铁死亡诱导剂浓度(Erastin 10μM、RSL3 1μM)、药物浓度(Fenofibrate 20μM、GW6471 10μM、icFSP1 2.5μM)、处理时间(24小时)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Lentiviral production and transduction |
| 分子机制验证 | PPARa过表达和敲低慢病毒载体信息(GV341、GV112)、感染复数(MOI 50)、筛选抗生素浓度(嘌呤霉素10μM)、CUT&Tag实验细胞数、双荧光素酶报告基因质粒信息及转染方法。 阅读提示:Materials and methods: Lentiviral production and transduction, CUT&Tag, Dual luciferase reporter assay |
| 检测指标 | 铁死亡相关蛋白(ACSL4、LPCAT3、GPX4、FTH1、FSP1)、脂质过氧化(MDA、4-HNE、Bodipy C11)、氧化还原状态(GSSG/GSH)、辅酶Q10及NAD/NADH水平、线粒体形态(TEM)、神经元标志物(MAP2、NeuN)、轴突标志物(β3-tubulin)。 阅读提示:Results sections and Figure legends |
| 统计方法 | 统计检验类型(t检验、ANOVA)、事后检验(Dunnett、Bonferroni)、显著性水平(p<0.05等)、数据表示(mean±SD或SEM)。 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |