体内感染模型建立与EV释放抑制
验证LuEVs在S. aureus肺炎中的作用
小鼠经气管内接种S. aureus(1×10^8 CFU)建立急性肺炎模型,部分小鼠提前6小时给予GW4869抑制EV释放,检测组织细菌负荷、EV水平、体重和生存率。
Extracellular Vesicles Coordinate Bacterial Cloaking in Lung Epithelial Cells to Alleviate Acute Inflammatory Injury.
包含体内小鼠肺炎模型、体外A549细胞模型,并通过GW4869抑制、Rab27a敲低、受体敲低、通路抑制剂及基因敲除进行功能与机制验证。
金黄色葡萄球菌诱导的急性肺炎小鼠模型(C57BL/6J小鼠) A549肺腺癌细胞系 人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)
金黄色葡萄球菌Newman菌株(mCherry或GFP标记) GW4869(2.5 μg/g)气管内给药于感染前6小时 A549细胞感染MOI 50,3小时 LuEVs或AEVs与S. aureus按比例预孵育形成复合物 Y-27632(10 μg/g)气管内给药于感染前4小时用于ROCK1抑制
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证LuEVs在S. aureus肺炎中的作用
小鼠经气管内接种S. aureus(1×10^8 CFU)建立急性肺炎模型,部分小鼠提前6小时给予GW4869抑制EV释放,检测组织细菌负荷、EV水平、体重和生存率。
确认LuEVs的物理特性和来源
从肺组织分离EVs,通过TEM、NTA、Western blot表征形态、大小和标志物,并通过纳米流式分析表面标志物确定来源。
验证外源性LuEVs或AEVs能否逆转GW4869抑制EV释放引起的效应
将LuEVs或AEVs与S. aureus预孵育形成复合物,气管内给予EV抑制小鼠,检测细菌负荷、体重、生存率和组织病理。
验证LECs释放的EVs促进S. aureus内化
从A549细胞培养上清分离EVs(AEVs),与S. aureus预孵育后感染A549细胞,检测细胞内细菌负荷,并通过GW4869或Rab27a敲低抑制EV释放,观察对细菌内化的影响。
证明EVs通过表面受体(如纤连蛋白)结合S. aureus
通过Western blot检测EVs上的纤连蛋白和纤维蛋白原γ表达,TEM和免疫印迹验证EV与细菌的直接结合,并利用FN敲低AEVs(AEVsFN-KD)验证纤连蛋白的作用。
阐明EV-细菌复合物进入宿主细胞的途径
使用多种内吞抑制剂处理A549细胞,检测AEVs-SA复合物的内化效率,并检测相关信号通路蛋白磷酸化水平。
验证ROCK1在EV介导的细菌隐蔽中的作用
小鼠经气管内给予Y-27632抑制ROCK1,感染S. aureus后检测肺细菌负荷和生存率。
评估EV介导的细菌内化对长期感染和炎症的影响
感染后10天或15天检测肺细菌负荷(CFU、16s rRNA、活体成像)、组织病理、细胞因子水平和B/T细胞浸润。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细菌培养 | LB肉汤 | -- | -- |
| 氯霉素 | -- | -- | |
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | Procell | PM150910 |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | 315-02 | |
| 红细胞裂解液 | Beyotime | C3702 | |
| 药物处理 | 巴弗洛霉素A1 | MedChemExpress | HY-100558 |
| GW4869 | MedChemExpress | HY-19363 | |
| Y-27632 | MedChemExpress | HY-10071 | |
| 硫酸乙酰肝素 | MedChemExpress | HY-101916 | |
| 肝素 | MedChemExpress | HY-17567A | |
| 细胞松弛素D | MedChemExpress | HY-N6682 | |
| 氯丙嗪 | MedChemExpress | HY-12708 | |
| 制霉菌素 | MedChemExpress | HY-17409 | |
| 阿米洛利 | MedChemExpress | HY-B0285 | |
| 肝素酶III | New England Biolabs | P0737S | |
| Rho抑制剂I | Cytoskeleton | CT04 | |
| 葡萄球菌蛋白A | Sino Biological | 10600-P07E | |
| EV分离 | BCA蛋白测定试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0012S |
| EV表征 | NanoSight NS300 | Malvern Panalytical | -- |
| Nanosight LM10 | Malvern Panalytical | -- | |
| ZetaView PMX 120 | Particle Metrix | -- | |
| EV荧光标记 | PKH67 | Sigma-Aldrich | MINI67 |
| 免疫荧光染色 | 溶葡萄球菌素 | Sigma-Aldrich | L7386 |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | 93443 | |
| 正常山羊血清 | Boster Biological Technology | AR0009 | |
| Hoechst 33342 | Sigma-Aldrich | ST9H9BC1534E | |
| Alexa Fluor 488标记的鬼笔环肽 | YeaSen | 40735ES75 | |
| 抗细胞角蛋白7抗体 | ABclonal | A4765 | |
| 抗F4/80抗体 | Abcam | ab6640 | |
| 抗Ly-6G抗体 | BioLegend | 127601 | |
| 抗C反应蛋白抗体 | Servicebio | GB115545 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Abcam | ab268020 | |
| 超分辨成像 | 蔡司Elyra 7显微镜 | ZEISS | -- |
| 组织病理学 | 徕卡CM1860冷冻切片机 | Leica | -- |
| 徕卡RM2235轮转式切片机 | Leica | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Merck Millipore | -- |
| 化学发光试剂盒 | AccuRef Scientific | AP0081S | |
| Tanon 4600成像系统 | Tanon | -- | |
| 抗TSG101抗体 | Abcam | ab125011 | |
| 抗钙联蛋白抗体 | Abcam | ab22595 | |
| 抗钠钾ATP酶抗体 | Abcam | ab76020 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Abcam | ab268020 | |
| 抗纤维蛋白原γ抗体 (D6) | Santa Cruz | sc-133226 | |
| 抗Alix抗体 | Cell Signalling Technology | 92880 | |
| 抗ROCK1抗体 | Cell Signalling Technology | 4035 | |
| 抗磷酸化FAK (Tyr397)抗体 | Cell Signalling Technology | 3283s | |
| 抗Rab27a抗体 | Cell Signalling Technology | 69295s | |
| 抗CD9抗体 | ABclonal | A1703 | |
| 抗CD63抗体 | ABclonal | A5271 | |
| 抗Caveolin-1抗体 | ABclonal | A22417 | |
| 抗磷酸化Caveolin-1-Y14抗体 | ABclonal | AP0742 | |
| 抗Src抗体 | ABclonal | A19119 | |
| 抗磷酸化Src-Y419抗体 | ABclonal | AP1027 | |
| 抗FAK抗体 | ABclonal | A11131 | |
| 抗GAPDH抗体 | ABclonal | A19056 | |
| 抗CD9抗体 | MedChemExpress | HY-P80610 | |
| 过氧化物酶标记山羊抗小鼠IgG | DIYIBio | DY60203 | |
| 过氧化物酶标记山羊抗兔IgG | DIYIBio | DY60202 | |
| 离体荧光成像 | IVIS Spectrum活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 膜蛋白提取 | Mem-PER Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89842 |
| 电镜 | TECNAI Spirit透射电子显微镜 | FEI Company | -- |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GEM0001 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GEM0002 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GEM0004 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Mmouse Biotechnology | MI00617 |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SweScript All-in-One第一链cDNA合成超混液 | Servicebio | G3337 | |
| SYBR Green预混液 | Servicebio | G3326 | |
| CFX 96Touch实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | FITC标记抗小鼠CD3抗体 | Thermo Fisher Scientific | 11-0032-82 |
| PE标记抗小鼠CD19抗体 | Thermo Fisher Scientific | 12-0193-82 | |
| PE标记抗小鼠CD326 (EpCAM)抗体 | Thermo Fisher Scientific | 11-5791-82 | |
| APC标记抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123115 | |
| CytoFLEX LX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| Sony MA900细胞分选仪 | Sony | -- | |
| 纳米流式细胞术 | NanoFCM N30E纳米流式细胞仪 | NanoFCM | -- |
| FITC标记抗Ly6G抗体 | BD Biosciences | 551460 | |
| FITC标记抗F4/80抗体 | Elabscience | E-AB-F0995C | |
| 统计分析 | IBM SPSS Statistics 26 | IBM | -- |
| GraphPad Prism 8.3.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌培养 | 金黄色葡萄球菌Newman菌株(mCherry或GFP标记)的传代条件(LB肉汤,37°C,200 rpm,16-18小时)及氯霉素浓度(10 μg/mL) 阅读提示:Methods 4.1细菌菌株和生长条件 |
| 细胞培养 | A549细胞(MOI 50)和BMDMs(MOI 10)的培养条件、感染时间(3小时) 阅读提示:Methods 4.2 细胞培养 |
| 动物模型 | C57BL/6J雌性小鼠(4-5周龄)、S. aureus菌量(1×10^8 CFU用于亚致死,6×10^8 CFU用于致死)、感染途径(气管内)、GW4869剂量(2.5 μg/g)和给药时间(感染前6小时) 阅读提示:Methods 4.3 动物实验 |
| EV分离和表征 | 差速离心程序(800×g, 16,000×g, 150,000×g)、EV浓度测定(BCA、NTA)、标志物检测(CD9, CD63, TSG101, Alix阳性;calnexin阴性) 阅读提示:Methods 4.4 EV分离和表征 |
| EV-细菌复合物制备 | S. aureus与LuEVs或AEVs的浓度比例(5.2×10^7 CFU对应100 μg EVs)、孵育条件(37°C, 200 rpm, 30分钟) 阅读提示:Methods 4.6 预孵育EV-S. aureus复合物 |
| 细菌内化检测 | 细胞内细菌定量需用溶葡萄球菌素(20 μg/mL)处理去除胞外菌 阅读提示:Methods 4.16 细胞内金黄色葡萄球菌定量评估 |
| 内吞途径抑制 | 各抑制剂浓度和预处理时间:Bafilomycin A1(10 nM, 30分钟)、Y-27632(1 μM, 30分钟)、细胞松弛素D(1 μg/mL, 4小时)等 阅读提示:Methods 4.2 细胞培养(药物处理) |