Pb处理细胞模型建立及表型检测
确定Pb暴露对乳腺癌细胞迁移、侵袭和增殖的影响
用不同浓度PbAc处理MCF-10A和MCF-7细胞,通过划痕愈合、Transwell迁移和侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力,通过流式细胞术和MTT实验检测细胞周期和增殖。
Environmental Lead Promotes Breast Cancer Migration and Invasion via the AKR1C3-NF-κB-MMP Axis.
包含体外细胞实验(迁移、侵袭、增殖)、RNA-seq转录组分析、功能获得与缺失实验(过表达、酶死突变、siRNA敲低)、机制验证(Western blot、免疫荧光、ELISA、抑制剂)等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
MCF-7乳腺癌细胞系 MCF-10A乳腺上皮细胞系 293T细胞系
PbAc浓度:MCF-7用10和20 μM,MCF-10A用80和100 μM 处理时间:迁移/侵袭24小时,增殖/周期48小时 AKR1C3酶死突变位点:Tyr55和His117突变为Ala NF-κB抑制剂JSH-23浓度及处理时间(文中未明确说明)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Pb暴露对乳腺癌细胞迁移、侵袭和增殖的影响
用不同浓度PbAc处理MCF-10A和MCF-7细胞,通过划痕愈合、Transwell迁移和侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力,通过流式细胞术和MTT实验检测细胞周期和增殖。
鉴定Pb诱导迁移和侵袭的潜在分子靶点
MCF-7细胞经10或20 μM PbAc处理48小时后提取RNA进行RNA-seq,通过差异表达分析、GO和KEGG富集分析、Venn图筛选共同差异基因,并用qRT-PCR和Western blot验证候选基因表达。
验证AKR1C3是否促进乳腺癌细胞迁移和侵袭,以及其酶活性是否必需
构建过表达野生型AKR1C3和酶死突变体(AKR1C3▲)的稳定细胞系,以及siRNA敲低细胞,通过划痕愈合、Transwell迁移和侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力,并通过Western blot验证EMT标志物变化。
确认AKR1C3是Pb诱导迁移和侵袭所必需的
在Pb处理条件下敲低AKR1C3,通过划痕愈合和Transwell迁移和侵袭实验检测细胞迁移和侵袭能力的变化。
探究AKR1C3是否通过激活NF-κB信号促进迁移和侵袭
通过Western blot检测IκBα和p65磷酸化水平,免疫荧光检测p65核转位,并使用NF-κB抑制剂JSH-23处理,验证AKR1C3对NF-κB的激活作用。
验证NF-κB下游MMP2/9的表达及对侵袭的贡献
通过Western blot和ELISA检测MMP2/9的表达和分泌,使用GM6001抑制MMP活性,添加重组活性MMP9,检测细胞侵袭能力的变化。
预测可能调控AKR1C3转录的转录因子
使用TF Target Finder等工具预测AKR1C3启动子区域的转录因子结合位点,并通过JASPAR数据库分析,识别出TP63。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Procell | PM150310 |
| RPMI-1640培养基 | Procell | PM150113 | |
| DMEM培养基 | Procell | PM150217 | |
| 马血清 | Procell | 164215 | |
| 表皮生长因子 | Sigma-Aldrich | E9644 | |
| 氢化可的松 | Sigma-Aldrich | H0135 | |
| 胰岛素 | Procell | PB180432 | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | P1400 | |
| 胎牛血清 | ExCell Bio | FSP500 | |
| 细胞增殖检测 | MTT | Beyotime | ST1537 |
| 二甲基亚砜 | Coolaber | CD4731 | |
| 细胞迁移侵袭 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 结晶紫 | Beyotime | ST1537 | |
| GM6001 | MedChemExpress | HY-15768 | |
| 重组MMP-9蛋白 | MedChemExpress | HY-P73300 | |
| APMA | MedChemExpress | HY-148905 | |
| 基质胶 | Corning | 356234 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Seven | SC119-02 |
| ROS检测 | 荧光探针 | Beyotime | S0033S |
| ELISA | MMP-2 ELISA试剂盒 | Meimian | MM-0069H1 |
| MMP-9 ELISA试剂盒 | Meimian | MM-0149H2 | |
| RNA提取 | RNAiso Plus | Takara | 9108 |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | TransGen Biotech | AU341 |
| qRT-PCR | TB Green试剂盒 | TaKaRa | RR420A |
| Western blot | RIPA裂解液 | YangGuangBio | C190419 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | YangGuangBio | H221661 | |
| 慢病毒包装 | pWPXLd载体 | Addgene | 12258 |
| Lipo6000转染试剂 | Beyotime Biotechnology | C0526 | |
| 定点突变 | 定点突变试剂盒 | Beyotime Biotechnology | D0206S |
| RNA-seq | fastp | -- | 0.22.0 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与Pb处理 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、PbAc浓度和暴露时间 阅读提示:Methods 2.1 |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞接种密度、PbAc浓度、处理时间、Matrigel包被、GM6001等抑制剂浓度 阅读提示:Methods 2.3和Figure legends |
| 蛋白质表达检测 | 抗体信息(Table S1)、裂解液、上样量等 阅读提示:Methods 2.8和Table S1 |
| 基因表达检测 | 引物序列、内参基因、qRT-PCR条件 阅读提示:Methods 2.7 |
| NF-κB通路抑制 | JSH-23浓度和处理时间 阅读提示:Methods 2.11和Figure 5 |