验证E2诱导SIRT7蛋白降解
检验E2是否影响SIRT7蛋白稳定性及其降解途径。
在MCF-7和T47D细胞中用E2处理,检测SIRT7蛋白和mRNA水平;使用CHX追踪蛋白半衰期;用MG132抑制蛋白酶体观察SIRT7水平恢复。
SIRT7 safeguards ERα proteostasis via deacetylation-dependent degradation of unliganded and misfolded receptors.
包含体外细胞实验(多种细胞系)、体内动物实验(SIRT7敲除小鼠)、人体组织样本(乳腺癌组织芯片)及公共数据集分析,功能验证(降解、泛素化)和机制验证(去乙酰化、相互作用)明确。
MCF-7细胞 T47D细胞 MDA-MB-231细胞 HEK293T细胞 Sirt7敲除小鼠
细胞系:MCF-7、T47D、MDA-MB-231,HEK293T 药物处理:E2浓度、MG132(10 μM)、CHX(50 μg/ml)、fulvestrant、4-OHT、trametinib(25 nM) 剂量和时间:E2处理0.5-12小时,热应激42°C 基因敲降或过表达:ERα、STUB1、UBR5的siRNA/shRNA及SIRT7过表达 检测方法:免疫印迹、Co-IP、泛素化实验、qPCR
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检验E2是否影响SIRT7蛋白稳定性及其降解途径。
在MCF-7和T47D细胞中用E2处理,检测SIRT7蛋白和mRNA水平;使用CHX追踪蛋白半衰期;用MG132抑制蛋白酶体观察SIRT7水平恢复。
探究在没有E2时ERα对SIRT7蛋白稳定性的影响。
在雌激素剥夺条件下,通过siRNA敲低ERα或使用fulvestrant降解ERα,检测SIRT7蛋白水平;进行CHX追踪和泛素化实验。
确定E2诱导的SIRT7降解是否依赖于配体结合的ERα及其下游信号。
在ERα阴性MDA-MB-231细胞中恢复ERα,观察E2对SIRT7的影响;在MCF-7细胞中敲低ERα或UBR5或使用ERK抑制剂,检测SIRT7降解和泛素化;检测SIRT7与UBR5的相互作用。
探索STUB1是否参与无配体条件下SIRT7和ERα的降解。
通过Co-IP检测SIRT7与STUB1的相互作用;敲低STUB1观察SIRT7蛋白水平和泛素化变化;用4-OHT处理以稳定ERα,观察对SIRT7的影响。
确定SIRT7是否通过去乙酰化ERα特定赖氨酸残基来影响ERα蛋白稳定性及SIRT7自身的稳定性。
用SIRT7过表达检测ERα乙酰化水平;比较ERα野生型、K302/303R(2KR)突变体对SIRT7稳定性和泛素化的影响;用E2处理观察SIRT7-ERα相互作用及乙酰化变化。
验证SIRT7在ERα错误折叠时促进其降解,以维持受体质量。
使用ERα-ΔAD突变体(缺乏配体依赖激活域)或热应激(42°C)诱导错误折叠;过表达SIRT7或敲低STUB1观察ERα水平和泛素化;通过E2处理检测下游靶基因表达(如TFF1)来评估功能。
研究SIRT7和ERα在乳腺癌及衰老相关疾病中的表达关联。
利用公共数据集(GSE202203、TCGA、METABRIC)分析SIRT7表达与乳腺癌亚型及ERα状态;通过IHC染色人乳腺癌组织芯片和年老小鼠晶状体,分析SIRT7和ERα表达及关联;使用SIRT7敲除小鼠观察晶状体ERα表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PM150210 |
| MEM培养基 | Procell | PM150410 | |
| 胎牛血清 | Nanjing SenBeiJia Biological Technology | BC-SE-FBS07 | |
| 青霉素/链霉素 | Nanjing SenBeiJia Biological Technology | BC-CE-007 | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | |
| 聚乙烯亚胺 | Yeasen | 40816ES02 | |
| 慢病毒包装 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 诱导表达 | 多西环素 | MCE | HY-N0565 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 逆转录 | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR014 |
| qPCR | SYBR Green荧光染料 | Takara | RR064 |
| PCR扩增 | PCR扩增酶 | YEASEN | 10154ES |
| 分子克隆 | 一步克隆试剂盒 | Vazyme Biotech | C112 |
| 蛋白提取 | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Sangon Biotech | -- |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| BG-gdsAUTO 710成像系统 | Baygene Biotech | -- | |
| 免疫组织化学 | 免疫组化试剂盒 | Solarbio | SP0041 |
| 组织芯片 | 人乳腺癌组织芯片 | Alena Bio | BR963b |
| 统计分析 | GraphPad Prism统计软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系来源、培养基、血清批次、抗生素浓度;E2处理浓度与时间;MG132、CHX、fulvestrant等药物浓度 阅读提示:查看Methods中的Cell culture部分及图注 |
| 基因敲低/过表达 | siRNA/shRNA序列和靶向效率;转染试剂及用量;质粒构建和突变位点 阅读提示:查看Methods中的Transfection and lentivirus production部分及补充表S2 |
| 蛋白检测 | 抗体来源和稀释比例;裂解缓冲液配方;免疫沉淀和免疫印迹条件;泛素化实验步骤 阅读提示:查看Methods中的Protein extraction, immunoprecipitation, and immunoblotting及补充表S1 |
| 体内实验 | 小鼠品系和基因型;年龄和性别;伦理批准号;组织处理和分析方法 阅读提示:查看Methods中的Animals部分及图7图注 |
| 数据分析 | 统计检验方法(t检验、ANOVA、卡方检验);样本量和重复数;数据标准化方法 阅读提示:查看Methods中的Statistical analysis部分 |