提取和鉴定肉类来源EV
从熟红肉和白肉中分离EV并验证其特性。
采用超高速离心法提取EV,通过透射电镜观察形态,Western blot检测EV标志物CD63、CD81和TSG101,纳米颗粒跟踪分析测定粒径。
Cooked meat-derived extracellular vesicles ssc-miR-1 induces metabolic disorders in the mice liver via PI3k/AKT pathway.
包含体内动物实验(小鼠代谢表型)、体外细胞实验(增殖、胰岛素抵抗模型)、分子验证(双荧光素酶、Western blot)及转录组测序,多层级功能与机制验证。
ICR小鼠(饮用水中添加肉类来源EV) NCTC1469小鼠肝细胞系 胰岛素抵抗NCTC1469细胞模型
EV添加剂量:每只小鼠每日补充相当于5克肉中提取的EV量 动物实验周期:10周,每日9:00-10:00给药 胰岛素抵抗模型建立:棕榈酸(PA)处理NCTC1469细胞,浓度0.2 mM PI3K激动剂740Y-P浓度:1 µM 细胞转染后检测时间点:CCK8在24、48、72小时,EdU在48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从熟红肉和白肉中分离EV并验证其特性。
采用超高速离心法提取EV,通过透射电镜观察形态,Western blot检测EV标志物CD63、CD81和TSG101,纳米颗粒跟踪分析测定粒径。
评估红肉和白肉EV经口摄入对小鼠代谢表型的影响。
将RM-EV或WM-EV加入ICR小鼠饮水10周,监测体重、BMI、运动能力、糖耐量、胰岛素耐量、器官指数和肝脏油红O染色。
分析EV补充后小鼠肝脏基因表达变化。
提取肝脏RNA,构建转录组文库,进行高通量测序,分析差异表达基因和KEGG通路富集。
比较RM-EV和WM-EV中microRNA组成差异。
提取EV总RNA,构建小RNA文库,进行高通量测序,鉴定差异microRNA并进行靶基因预测和功能富集。
验证RM-EV-miR-1对肝细胞增殖的影响及其靶基因。
将RM-EV-miR-1 mimics转染NCTC1469细胞,通过双荧光素酶报告实验验证IGF1靶向关系,检测IGF1 mRNA水平、CCK8增殖、EdU染色和增殖相关基因表达。
验证RM-EV-miR-1在胰岛素抵抗肝细胞模型中的作用机制。
用棕榈酸处理NCTC1469细胞建立胰岛素抵抗模型,转染RM-EV-miR-1 mimics,检测PI3K/AKT通路相关基因和蛋白表达、葡萄糖摄取和糖原沉积。
验证RM-EV-miR-1通过PI3K通路发挥作用。
在RM-EV-miR-1处理的胰岛素抵抗NCTC1469细胞中加入PI3K激动剂740Y-P,检测葡萄糖消耗、2-NBDG摄取、通路蛋白表达和GLUT4膜转位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gbico | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 细胞处理 | 棕榈酸 | 上海四朵瑞生物技术服务有限公司 | -- |
| 740Y-P | Aladdin | Y413859 | |
| EV摄取实验 | PKH67染料 | Umibio | -- |
| DAPI染色液 | TargetMol | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen | 11402ES |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂 | Beyotime | -- |
| EdU检测试剂盒 | Solarbio | CA1174 | |
| 葡萄糖水平检测 | 葡萄糖检测试剂盒(己糖激酶法) | 南京建成生物工程研究所 | -- |
| 2-NBDG摄取实验 | 胰岛素 | Ye-Yuan | -- |
| 2-NBDG | Macklin | -- | |
| PAS染色 | PAS染色试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- |
| 免疫荧光染色 | GLUT4抗体 | Wanleibio | WL02425 |
| TRITC标记山羊抗兔IgG H&L | HUABIO | HA1016 | |
| Dil膜染料 | Absin | abs47048140 | |
| DAPI染色液 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 磷酸酶抑制剂 | Wanleibio | -- | |
| SDS-PAGE凝胶 | GenScript | M00666 | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 增强化学发光系统 | New Cell & Molecular Biotech | P10060 | |
| PI3K抗体 | Wanleibio | WL02240 | |
| AKT抗体 | Wanleibio | WL0003b | |
| 磷酸化AKT抗体 | Wanleibio | WLP001a | |
| GSK-3β抗体 | Wanleibio | WL01456 | |
| 磷酸化GSK-3β抗体 | Wanleibio | WL03518 | |
| GLUT4抗体 | Wanleibio | WL02425 | |
| 磷酸化PI3K抗体 | Beyotime | AF5905 | |
| β-actin抗体 | Zenbio | 380624 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗兔IgG抗体 | Cell Signaling | 7074 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| PrimeScript II 第一链cDNA合成试剂盒 | Takara | -- | |
| MiR-XTM miRNA第一链合成试剂盒 | Takara | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Takara | -- | |
| RNA提取 | Trizol LS试剂 | Ambion | -- |
| 测序 | TruSeq小RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| EV提取 | 透射电子显微镜HT7800 | Hitachi | -- |
| EV粒径分析 | ZetaView纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| EV提取 | 肉样种类(猪里脊和鸡胸肉)、煮熟时间1小时、离心条件(2000×g 30分钟、12,000×g 45分钟、160,000×g 2小时和1小时) 阅读提示:Methods中的“Extracellular vesicles isolation and observation” |
| 动物实验 | 小鼠品系(ICR雄性)、每组数量(8只)、EV添加剂量(相当于5克肉提取的EV溶于1mL饮水)、给药时间(每天9:00-10:00)、实验周期(10周)、对照组(生理盐水) 阅读提示:Methods中的“Animal feeding and management”及Figure 2图注 |
| 胰岛素抵抗细胞模型建立 | 细胞系(NCTC1469)、棕榈酸浓度(0.2 mM)、处理时间(文中未明确说明) 阅读提示:Methods中的“Cell culture and treatment” |
| 细胞转染 | mimics序列(RM-EV-miR-1 mimics)、转染试剂(Lipo3000)、转染浓度(文中未明确说明)、转染后检测时间点 阅读提示:Methods中的“Cell transfection” |
| PI3K激动剂处理 | 740Y-P浓度(1 µM)、处理时间(文中未明确说明) 阅读提示:Methods中的“Cell culture and treatment”及Figure 7图注 |
| Western blot | 抗体信息(PI3K、AKT、p-AKT、GSK-3β、p-GSK-3β、GLUT4、p-PI3K、β-actin)、稀释比例(1:1000等) 阅读提示:Methods中的“Western blotting” |