评估prenylterphenyllin对CRC细胞的细胞毒性
确定prenylterphenyllin是否抑制CRC细胞活力
使用CCK-8和结晶紫染色检测HCT116、SW620和SW480细胞在不同浓度prenylterphenyllin处理24或48小时后的活力。
Prenylterphenyllin, a regulator of P53, inhibits colorectal cancer progression through oxidative stress and energy metabolism pathway.
包含体外细胞实验(活力、迁移、凋亡、周期、蛋白检测)、转录组和代谢组分析、体内异种移植和肺转移模型等多层验证。
人结直肠癌细胞系HCT116、SW480、SW620 小鼠结直肠癌细胞系MC38、CT26 BALB/c裸鼠皮下异种移植模型(HCT116) C57BL/6和BALB/c小鼠同系移植模型(MC38、CT26)
prenylterphenyllin处理浓度(5-80 μmol/L)和时间(24或48 h) 细胞活力检测(CCK-8,每孔5000细胞,处理24或48 h) 动物模型中prenylterphenyllin剂量(10和20 mg/kg/天)和给药方式(腹腔注射) 对照药物奥沙利铂剂量(5 mg/kg,每周两次) RNA-seq和代谢组学中prenylterphenyllin浓度(20 μmol/L)和处理时间(24 h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定prenylterphenyllin是否抑制CRC细胞活力
使用CCK-8和结晶紫染色检测HCT116、SW620和SW480细胞在不同浓度prenylterphenyllin处理24或48小时后的活力。
探索prenylterphenyllin抑制CRC细胞增殖的分子机制
HCT116细胞用20 μmol/L prenylterphenyllin处理24小时后进行RNA测序,分析差异表达基因和通路富集。
验证prenylterphenyllin是否诱导凋亡和细胞周期阻滞
通过流式细胞术检测Annexin V-FITC/PI染色评估凋亡,PI染色分析细胞周期;Western blot检测凋亡相关蛋白。
评估prenylterphenyllin对CRC细胞迁移的影响
通过划痕实验检测迁移能力,Western blot检测EMT相关蛋白。
探索prenylterphenyllin对能量代谢的影响
使用靶向能量代谢组学(LC-MS/MS)分析处理与未处理HCT116细胞的代谢物变化。
验证prenylterphenyllin是否诱导氧化应激和线粒体功能障碍
通过免疫荧光检测ROS、线粒体膜电位、线粒体质量,Western blot检测Keap1/Nrf2/HO-1/NQO-1蛋白表达。
评估prenylterphenyllin在体内对肿瘤生长的抑制作用
建立皮下异种移植和同系移植模型,给予prenylterphenyllin或奥沙利铂,监测肿瘤体积和重量,进行IHC和H&E染色。
评估prenylterphenyllin对CRC肺转移的抑制作用
通过尾静脉注射建立肺转移模型,给予prenylterphenyllin或奥沙利铂,评估肺转移结节数和肺重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0038 |
| 细胞凋亡检测 | 凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A211 |
| 细胞周期与凋亡分析 | 细胞周期与凋亡分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI双染法 | -- | -- |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒(CM-H2DCFDA) | Beyotime | S0035M |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE | Beyotime | C2001S |
| 线粒体质量检测 | Mito-Tracker Green | Beyotime | C1435M |
| 线粒体超氧化物检测 | MitoSO Red | Beyotime | S0061M |
| 细胞核染色 | Hoechst 33258 | Beyotime | C1017 |
| 药物处理 | 奥沙利铂 | MCE | HY-17371 |
| 蛋白质印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 20536-1-AP |
| 抗Caspase3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| 抗Cleaved caspase3抗体 | Proteintech | 25128-1-AP | |
| 抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-Ig | |
| 抗Bad抗体 | Proteintech | 10435-1-AP | |
| 抗Bcl-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| 抗E-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 26874-1-AP | |
| 抗P53抗体 | Proteintech | 10442-1-AP | |
| 抗N-钙黏蛋白抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| 抗波形蛋白抗体 | Proteintech | 10366-1-AP | |
| 抗Nrf2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| 抗Keap1抗体 | Proteintech | 10503-2-AP | |
| 抗Nqo1抗体 | Proteintech | 11451-1-AP | |
| 抗Ho1抗体 | Proteintech | 10701-1-AP | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Abcam | Ab15580 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RNA测序 | NanoPhotometer分光光度计 | Implen | -- |
| Agilent 2100 RNA Nano 6000检测试剂盒 | Agilent | -- | |
| 流式细胞术 | BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- |
| 色谱分离 | 硅胶 | -- | -- |
| 半制备高效液相色谱 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度、处理浓度、处理时间、CCK-8孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Cell viability assay |
| 划痕实验 | 细胞密度、划痕方式、处理浓度、处理时间 阅读提示:Materials and methods, Wound healing assay |
| 细胞周期分析 | 处理时间、PI染色浓度、RNase A浓度、获取事件数 阅读提示:Materials and methods, Cell cycle analysis |
| 凋亡检测 | 处理时间、Annexin V和PI用量、孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Apoptosis assay |
| 蛋白质印迹 | 蛋白上样量、抗体稀释比例、二抗孵育时间 阅读提示:Materials and methods, Western blot analysis |
| 免疫荧光 | 染料浓度、孵育时间、观察条件 阅读提示:Materials and methods, Immunofluorescence |
| RNA测序 | 处理浓度、处理时间、RNA提取方法、测序平台 阅读提示:Materials and methods, RNA sequencing and differential gene enrichment analysis |
| 体内肿瘤模型 | 细胞注射数量、给药剂量、给药频率、治疗时长 阅读提示:Materials and methods, Animal experiments |