菌株筛选与化合物分离
从海洋链霉菌中分离具有胆固醇外排促进活性的化合物
通过胆固醇外排活性引导的分离,从 Streptomyces sp. FXY-T25 的发酵液中提取得到 enterocin,并通过 HPLC、NMR 和 HRMS 进行结构鉴定。
Natural polyketide enterocin inhibits ASGR1 to enhance cholesterol efflux and regulate hepatic lipid metabolism
包含体外细胞实验(胆固醇外流、Western blot、SPR、分子对接)、药物干预、基因敲低/过表达及动物模型(HFD小鼠、LDLR-KO小鼠)等多层级验证。
Huh-7 细胞 HepG2 细胞 HEK-293T 细胞 高脂饮食(HFD)喂养的 C57BL/6J 小鼠 LDLR 基因敲除(LDLR−/−)小鼠
ASGR1 结合亲和力(SPR 检测,K_D = 4.25 μM) ASGR1 降解途径(蛋白酶体抑制剂 MG-132 处理) 基因敲低/过表达验证(si-ASGR1、ASGR1 质粒) 动物模型(HFD 小鼠和 LDLR−/− 小鼠)及给药剂量(1 和 10 mg/kg) 胆固醇外排检测方法(BODIPY 标记)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从海洋链霉菌中分离具有胆固醇外排促进活性的化合物
通过胆固醇外排活性引导的分离,从 Streptomyces sp. FXY-T25 的发酵液中提取得到 enterocin,并通过 HPLC、NMR 和 HRMS 进行结构鉴定。
验证 enterocin 对肝细胞胆固醇外排的促进作用及细胞毒性
在 Huh-7 和 HepG2 细胞中进行胆固醇外排实验(BODIPY 标记)和细胞活力实验(刃天青转化法)。
验证 enterocin 是否通过 ASGR1 发挥作用
在 ASGR1 过表达或敲低的细胞中检测胆固醇外排和 ASGR1 蛋白水平,并使用药理学抑制剂(dorsomorphin、GSK2033)和激动剂(asialofetuin)验证通路。
确证 enterocin 与 ASGR1 直接结合并促进其蛋白酶体降解
通过 SPR 检测结合亲和力,分子对接预测结合模式,使用蛋白酶体或溶酶体抑制剂处理细胞,观察 ASGR1 蛋白水平变化。
评价 enterocin 对 HFD 小鼠和 LDLR−/− 小鼠血脂、脂肪沉积和肝脏脂质的影响
对 HFD 诱导的高脂血症小鼠进行 8 周口服给药,检测血清脂质、肝脏脂质、粪便脂质、肝组织学、脂肪含量(CT 成像)。在 LDLR−/− 小鼠中比较 enterocin、阿托伐他汀和 GW3965 的作用。
排除 enterocin 通过抑制肠道脂肪吸收来降脂的可能性
小鼠灌胃橄榄油后测量血清 TG 水平,并收集粪便检测 TG 和 TC,与奥利司他(脂肪酶抑制剂)比较。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化合物分离纯化 | JNM-ECZ600R/S1 核磁共振波谱仪 | JEOL | -- |
| 化合物鉴定 | LTQ-Orbitrap 质谱仪 | Thermo Fisher | -- |
| 化合物分离纯化 | 硅胶 | Qingdao Haiyang Chemical Co., Ltd. | -- |
| 薄层色谱 | 玻璃预制硅胶GF254薄层板 | Qingdao Haiyang Chemical Co., Ltd. | -- |
| 中压液相色谱 | CombiFlash RF+ 中压制备液相色谱仪 | Teledyne Isco | -- |
| 半制备高效液相色谱 | 安捷伦1260 Infinity II 半制备高效液相色谱仪 | Agilent | -- |
| 细胞实验 | 毛地黄皂苷 | TOPSCIENCE | T2721 |
| GW3965 | TOPSCIENCE | T6310L | |
| GSK2033 | TOPSCIENCE | T15427 | |
| A-769662 | TOPSCIENCE | T2468 | |
| MG-132 | TOPSCIENCE | T2154 | |
| 氯喹 | TOPSCIENCE | T8689 | |
| 巴佛洛霉素 A1 | TOPSCIENCE | T6740 | |
| 动物实验 | 阿托伐他汀 | Qilu Pharmaceutical | -- |
| 奥利司他 | Lunan Pharmaceutical | -- | |
| 细胞实验 | 胎球蛋白 | TargetMol | T41033 |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Vazyme | -- |
| DMEM基础培养基 | Gibco | -- | |
| GlutaMAX™ | Gibco | -- | |
| Opti-MEM 减血清培养基 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | Pricella | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 2000 转染试剂 | Thermo Fisher | -- |
| Lipofectamine® RNAiMAX 转染试剂 | Thermo Fisher | -- | |
| ASGR1 人源 pcDNA 3.1(+) 质粒 | Thermo Fisher | -- | |
| 靶向ASGR1的小干扰RNA寡核苷酸双链体 | Genepharma | -- | |
| 细胞活力实验 | 刃天青钠盐 | Sigma-Aldrich | -- |
| 溶剂 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- |
| 表面等离子体共振仪 | Cytiva | -- | |
| SPR实验 | CM5 传感器芯片 | Cytiva | BR-1005-30 |
| 重组人ASGR1蛋白 | TOPSCIENCE | TMPY-02702 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Abcam | -- | |
| 高通量组织匀浆器 | SCIENTZ-48 | -- | |
| 旋转混合器 | MIULAB | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 一抗:ASGR1 | Starter | #S0B0088 | |
| 一抗:LXRα | Absin | #abs124102 | |
| 一抗:AMPKα | Proteintech | #10929-2-AP | |
| 一抗:AMPKα2 | Proteintech | #18167-1-AP | |
| 一抗:磷酸化AMPKα (Thr172) | Cell Signaling Technology | #2535T | |
| 一抗:SREBP1 | MedChemExpress | #HY-P80900 | |
| 一抗:BRCA1 | Proteintech | #22362-1-AP | |
| 一抗:BARD1 | Proteintech | #22964-1-AP | |
| 一抗:LDLR | Proteintech | #10785-1-AP | |
| 一抗:GAPDH | Abcam | #ab181602 | |
| Image Lab 软件 | Bio-Rad | v5.2.1 | |
| 动物实验 | C57BL/6J 小鼠 | Vital River Laboratory Animal Technology Co., Ltd. | -- |
| LDLR基因敲除小鼠 | GemPharmatech | T001464 | |
| 小动物CT成像 | 精密小动物麻醉系统 | RWD R500 | -- |
| 高分辨率小动物活体成像系统 | PerkinElmer Quantum GX2 | -- | |
| 血清/肝脏/粪便脂质检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A110-1-1 |
| 总胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A111-1-1 | |
| 高密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A112-1-1 | |
| 低密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A113-1-1 | |
| 血清肝功能检测 | 天冬氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C010-2-1 |
| 丙氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C009-2-1 | |
| 肝脏总胆汁酸检测 | 总胆汁酸检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | E003-2-1 |
| 脂质检测 | Tecan SUNRISE 酶标仪 | Tecan | -- |
| 组织学染色 | 旋转切片机 | Leica RM2255 | -- |
| 多聚赖氨酸处理载玻片 | -- | -- | |
| 哈里斯苏木素溶液 | -- | -- | |
| 伊红Y溶液 | -- | -- | |
| 显微镜 | Nikon Eclipse TS100 | -- | |
| qPCR | TRIzol™ 试剂 | Sigma-Aldrich | T9424 |
| 超微量分光光度计 | Implen P330 | -- | |
| FastKing 逆转录试剂盒 | Tiangen | KR116 | |
| SYBR Green 荧光定量试剂盒 | -- | -- | |
| PCR仪 | Bio-Rad CFX96 Touch | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 软件 | GraphPad Software Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(Huh-7, HepG2, HEK-293T)的来源和培养条件(37°C, 5% CO2,DMEM+10% FBS);enterocin 浓度和处理时间(24小时);胆固醇外排实验的 BODIPY-胆固醇浓度(62.5 μM)和 HDL 刺激时间(6小时) 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.7 Cell culture 和 2.10 Cholesterol efflux assay |
| 基因操作 | ASGR1 过表达质粒(pcDNA 3.1+)和 siRNA 序列(si-ASGR1-A/B/C 及 si-Control);转染试剂(Lipofectamine 2000 和 RNAiMAX)用量及转染时间(24-48小时) 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.8 Cell transfection |
| 蛋白降解实验 | 环己酰亚胺浓度(50 μg/mL),MG-132 浓度(5 μM),氯喹浓度(100 μM),巴佛洛霉素 A1 浓度(20 nM),检测时间点(0,3,6,9,12,15小时) 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.12 Cycloheximide chase assay 和 Results 3.4 部分 |
| SPR 实验 | 重组人 ASGR1 蛋白(TMPY-02702)的固定化方法,enterocin 浓度范围,缓冲液条件(PBS, pH 5.0 等),Biacore 1K 仪器设置 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.13 Surface plasmon resonance (SPR) studies |
| 动物实验 | 小鼠品系(C57BL/6J, LDLR-KO),年龄(6周),性别(雄性),饮食(HFD 配方:10% 猪油,3% 胆固醇,0.5% 猪胆盐),给药剂量(enterocin 1 或 10 mg/kg/day,阿托伐他汀 10 mg/kg/day,GW3965 20 mg/kg/day),给药方式(灌胃),给药周期(8周或4周),动物分组和数量(每组15只或6只) 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.15 Animal experiments 及 Results 3.6 和 3.7 |
| 脂质检测 | 血清、肝脏和粪便样品的处理方式(离心速度、时间),检测试剂盒(TG, TC, HDL-C, LDL-C 等)和生产商,微孔板读数仪设置 阅读提示:参见 Materials and Methods 2.18 Analysis of serum, hepatic, and fecal lipids and liver enzymes |