筛选药物及确定处理浓度
确定FLLL31对膀胱癌细胞是否有抑制作用及合适的处理浓度。
使用天然产物库筛选膀胱癌潜在治疗药物,通过CCK-8法测定FLLL31处理24 h后的IC50,确定2.5 μM和5 μM作为低和高浓度处理组。
FLLL31 Induces Apoptosis via the FOXO4/BCL6 Axis to Inhibit Bladder Cancer Progression.
包含体外细胞功能实验(CCK-8、EdU、集落形成、Transwell)、体内异种移植瘤模型、RNA-seq、qRT-PCR、Western blot、流式凋亡、线粒体膜电位、透射电镜及慢病毒敲低功能验证,证据层级多且含机制验证,实验完整度高。
人膀胱尿路上皮癌细胞系T24 人膀胱尿路上皮癌细胞系5637 BALB/c-nu小鼠皮下T24异种移植瘤模型
FLLL31处理浓度(2.5/5 μM)和处理时间(24 h) 细胞活力检测的细胞接种密度(5000细胞/孔) 动物实验分组及给药剂量(对照组DMSO,低浓度25 mg/kg,高浓度50 mg/kg,腹腔注射14天) 慢病毒敲低FOXO4或BCL6的敲低效率及筛选方法(嘌呤霉素) JC-1检测细胞浓度(1×10^6 cells/mL)和流式采集细胞数(至少20000个)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定FLLL31对膀胱癌细胞是否有抑制作用及合适的处理浓度。
使用天然产物库筛选膀胱癌潜在治疗药物,通过CCK-8法测定FLLL31处理24 h后的IC50,确定2.5 μM和5 μM作为低和高浓度处理组。
验证FLLL31对膀胱癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。
使用CCK-8、EdU、集落形成、Transwell迁移和侵袭实验,检测FLLL31处理后细胞增殖、迁移和侵袭能力的变化。
探索FLLL31抑制膀胱癌恶性行为的分子机制。
对T24细胞进行RNA-seq分析,DMSO处理组为对照,2.5 μM FLLL31处理组为实验组,比较差异表达基因,并结合转录因子靶点桑基图分析FOXO4和BCL6的调控关系。
验证FLLL31是否诱导膀胱癌细胞凋亡。
使用透射电镜观察细胞线粒体和染色质形态,Annexin V-FITC/PI双染流式细胞术检测凋亡率,JC-1染色检测线粒体膜电位变化。
验证FLLL31对FOXO4、BCL6、Bcl-xL、Caspase-9和Caspase-3表达的影响。
使用qRT-PCR和Western blot检测FLLL31处理后FOXO4、BCL6、Bcl-xL、Caspase-9和Caspase-3的mRNA和蛋白水平变化。
验证FLLL31诱导的凋亡是否依赖FOXO4和BCL6。
使用慢病毒载体敲低T24细胞中的FOXO4或BCL6,然后检测FLLL31处理后凋亡相关基因和蛋白表达变化,以及细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡表型变化。
评估FLLL31在体内的抗膀胱癌效果和安全性。
将T24细胞皮下接种于BALB/c-nu小鼠,随机分为对照组(DMSO)、低浓度组和高浓度组,腹腔注射FLLL31 14天,测量肿瘤体积、重量和生长速率,并通过HE染色检测主要器官毒性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | FLLL31 | Selleck | -- |
| 药物溶解 | 二甲基亚砜 | Aladdin | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Shanghai Yuanpei Bio-technology Co. | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 慢病毒转染 | 聚凝胺 | Solarbio | -- |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | -- | |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂 | MCE | -- |
| 细胞增殖检测 | BeyoClick EdU细胞增殖检测试剂盒(AF401) | MCE | -- |
| BeyoClick EdU细胞增殖检测试剂盒(AF488) | Beyotime | -- | |
| Transwell迁移和侵袭实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| Transwell侵袭实验 | Matrigel基质胶 | Corning | -- |
| 透射电镜 | 电镜固定液 | Servicebio | -- |
| 包埋树脂 | -- | -- | |
| 乙酸铀酰 | -- | -- | |
| 柠檬酸铅 | -- | -- | |
| 透射电子显微镜 | -- | JEM1400PLUS | |
| RNA提取 | TRIzol试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| 逆转录 | HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂盒(+gDNA Wiper) | Vazyme | -- |
| qRT-PCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- |
| Bio-Rad实时荧光定量PCR系统 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | NCM Biotech | -- |
| Western blot | PVDF膜 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 增强化学发光检测试剂 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| GAPDH抗体 | ABClonal | AC002 | |
| β-actin抗体 | ABClonal | AC004 | |
| FOXO4抗体 | ABClonal | AC3307 | |
| BCL6抗体 | ABClonal | AC7173 | |
| Bcl-xL抗体 | ABClonal | AC0209 | |
| Caspase-9抗体 | ABClonal | AC2636 | |
| Caspase-3抗体 | ABClonal | AC11319 | |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI双染凋亡检测试剂盒 | Solarbio | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 数据分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| FlowJo软件 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基(RPMI 1640)、血清浓度(10% FBS)、培养条件(37°C, 5% CO2)、细胞系(T24和5637) 阅读提示:见‘2.2. Cell Line, Culture Condition, and Virus Transfection’ |
| 药物处理 | FLLL31处理浓度(2.5/5 μM)、处理时间(24 h)、溶解溶剂(DMSO)、母液浓度(100 μM) 阅读提示:见‘2.1. Drugs and Pharmaceutical Preparations’和‘3.1. FLLL31 Inhibits Malignant Biological Behavior of BC Cells’ |
| 体外功能实验 | 细胞密度(CCK-8和EdU为5000细胞/孔,集落形成为500细胞/孔,Transwell为1×10^6/孔)、Matrigel包被稀释度(1:8) 阅读提示:见‘2.3. Cell Viability, Proliferation, Migration, and Invasion Function Assays’ |
| 动物实验 | 小鼠品系和周龄(BALB/c-nu,5周龄)、每组数量(6只)、细胞接种量(100 μL,1×10^7 cells/mL)、给药剂量(25和50 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药天数(14天) 阅读提示:见‘2.4. Animal Experimentation’ |
| 基因敲低 | 慢病毒载体(FOXO4 shRNA、BCL6 shRNA)、转染时间(24 h)、polybrene浓度(5 μg/mL)、筛选药物(嘌呤霉素) 阅读提示:见‘2.2. Cell Line, Culture Condition, and Virus Transfection’和‘3.4. FOXO4 Acts as an Upstream Regulator to Mediate FLLL31-Induced Apoptosis in BC Cells by Upregulating BCL6’ |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色、JC-1染色、流式细胞仪参数(488 nm激发,FL1/FL2通道)、细胞浓度(1×10^6 cells/mL) 阅读提示:见‘2.9. Flow Cytometry’和‘2.10. Mitochondrial Membrane Potential (ΔΨm) Detection’ |