鉴定DHA对铁死亡的敏化作用
确定DHA是否特异性增强GPX4依赖性铁死亡
用不同浓度DHA处理N27细胞,并与多种细胞死亡诱导剂(STS、T/S/Z、雷帕霉素、RSL-3)共处理,检测细胞活力。
HMOX1 drives dihydroartemisinin-sensitized ferroptosis antagonized by mitochondrial fusion.
包含体外细胞实验(N27、STHdhQ7/Q7等)、原代神经元、多种癌细胞系,以及基因敲低和药理学抑制/激活验证,功能与机制验证完整。
N27大鼠多巴胺能神经元细胞 STHdhQ7/Q7小鼠神经元细胞 HT-1080、MDA-MB-231、U251癌细胞系 小鼠原代皮层神经元
DHA非致死剂量(1.5μM)与RSL-3(100nM)联合处理48小时 HO-1 siRNA敲低或ZnPP(5μM)抑制HO-1活性 MitoQ(5μM)和Mito-TEMPO清除线粒体ROS M1(5μM)促进线粒体融合 N27细胞系(5000细胞/孔)进行活力测定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DHA是否特异性增强GPX4依赖性铁死亡
用不同浓度DHA处理N27细胞,并与多种细胞死亡诱导剂(STS、T/S/Z、雷帕霉素、RSL-3)共处理,检测细胞活力。
确认共处理诱导的细胞死亡是铁死亡
检测铁死亡抑制剂(Fer-1、Lip-1)的挽救效应,并测量GSH、4-HNE、脂质ROS以及线粒体形态。
探讨DHA是否通过铁和氧化应激影响铁死亡敏感性
检测细胞内铁水平、氧化应激水平,并使用铁螯合剂DFO和抗氧化剂NAC处理。
确定HO-1是否介导DHA增强的铁死亡敏感性
分析转录组数据,检测HO-1蛋白表达,使用siRNA敲低和ZnPP抑制HO-1,观察对细胞死亡和氧化应激的影响。
验证DHA是否诱导HO-1依赖的线粒体ROS增加
用MitoSOX检测线粒体ROS,并使用MitoQ和Mito-TEMPO清除线粒体ROS,检测细胞活力。
探究线粒体氧化应激是否激活线粒体融合,以及融合对铁死亡的影响
检测Mfn1、Mfn2、Drp1表达,使用M1促进融合或siRNA敲低Mfn1/2,观察对铁死亡的影响。
评估Mfn1/Mfn2表达与癌症患者预后的关系
使用UALCAN分析肿瘤组织中的Mfn1/Mfn2表达,使用Kaplan-Meier plotter分析总生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 铁死亡诱导 | RSL3 | Selleck | S8155 |
| ML162 | Absin | abs823477 | |
| 铁死亡抑制 | Ferrostatin-1 | Selleck | S7243 |
| Liproxstatin-1 | Selleck | S7699 | |
| 氧化应激调节 | N-乙酰半胱氨酸 | Selleck | S1623 |
| 铁螯合 | 甲磺酸去铁胺 | Selleck | S5742 |
| HO-1抑制 | 锌原卟啉 | MedChemExpress | HY-101193 |
| HO-1激活 | 血红素 | Sigma-Aldrich | 51280 |
| 线粒体抗氧化 | 甲磺酸米托醌 | Selleck | S8978 |
| Mito-TEMPO | Selleck | S9733 | |
| 线粒体融合促进 | 线粒体融合促进剂M1 | Selleck | S3375 |
| 氧化磷酸化调节 | 寡霉素A | Selleck | S1478 |
| TCA循环代谢物 | α-酮戊二酸钠盐 | Sigma-Aldrich | K1875 |
| 线粒体复合体I抑制 | 鱼藤酮 | Selleck | S2348 |
| 氧化应激诱导 | 过氧化氢 | Macklin | H792072 |
| 铁死亡诱导 | FINO2 | Selleck | E1244 |
| 谷胱甘肽合成抑制 | BSO | Selleck | S9728 |
| 铁死亡诱导 | Erastin | Selleck | S7242 |
| 铁补充 | 六水合硫酸亚铁铵 | Sigma-Aldrich | 215406 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Selleck | B34304 |
| 活/死细胞检测 | 活/死细胞检测试剂盒 | Abcam | ab115347 |
| 脂质ROS检测 | BODIPY 581/591 C11 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| ROS检测 | H2DCFDA | MedChemExpress | HY-D0940 |
| CellROX Green | Thermo Fisher Scientific | C10444 | |
| 亚铁检测 | FerroOrange | Dojindo | F374 |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX Red | Thermo Fisher Scientific | M36008 |
| 线粒体膜电位检测 | MitoProbe JC-1检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | M34152 |
| 蛋白质印迹 | 抗4-羟基壬烯醛抗体 | Abcam | ab46545 |
| 抗谷胱甘肽过氧化物酶4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗FACL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| AIFM2/FSP1多克隆抗体 | Proteintech | 20886-1-AP | |
| DHODH多克隆抗体 | Proteintech | 14877-1-AP | |
| KEAP1单克隆抗体 | Proteintech | 60027-1-Ig | |
| 抗Nrf2抗体 | HUABIO | R1312-8 | |
| HO-1/HMOX1单克隆抗体 | Proteintech | 66743-1-Ig | |
| HMOX2多克隆抗体 | Proteintech | 14817-1-AP | |
| MFN1多克隆抗体 | Proteintech | 13798-1-AP | |
| MFN2多克隆抗体 | Proteintech | 12186-1-AP | |
| DRP1(C端)多克隆抗体 | Proteintech | 12957-1-AP | |
| 总OXPHOS啮齿动物WB抗体混合物 | Abcam | ab110413 | |
| TOM20多克隆抗体 | Proteintech | 11802-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| HRP偶联GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | HRP-60004 | |
| α-微管蛋白单克隆抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 抗小鼠IgG(全分子)–过氧化物酶抗体(兔源) | Sigma-Aldrich | A9044 | |
| 抗兔IgG(全分子)–过氧化物酶抗体(羊源) | Sigma-Aldrich | A0545 | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | NATOCOR | SFBE | |
| 青霉素/链霉素 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 原代神经元培养 | 胰蛋白酶 | Sigma | T-4665 |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 |
| 蛋白质印迹 | 细胞裂解液(P0013) | Beyotime | P0013 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0011 | |
| 透射电镜 | HT7700 | HITACHI | -- |
| 流式细胞术 | LSR Fortessa | BD | -- |
| 荧光显微镜 | Axiovert 200 Basic standard | Carl Zeiss | -- |
| ICP-MS | iCAP-6500 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 化学发光成像 | ChemiDoc XRS+系统 | Bio-Rad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、抗生素、传代条件、支原体检测 阅读提示:STAR★Methods - Cell lines |
| 药物处理 | DHA浓度、RSL-3浓度、处理时间、溶剂对照 阅读提示:Figures 1-6图注及STAR★Methods - Reagents |
| 细胞活力测定 | 细胞接种密度(5000细胞/孔)、处理时间(48小时)、CCK-8检测波长 阅读提示:STAR★Methods - Cell viability assays |
| 脂质ROS检测 | C11-BODIPY浓度、孵育时间、流式细胞仪设置 阅读提示:STAR★Methods - Flow cytometry analysis for lipid ROS detection |
| 线粒体ROS检测 | MitoSOX Red浓度、孵育时间、检测方法(流式或荧光显微镜) 阅读提示:STAR★Methods - Mitochondrial reactive oxygen species measurements |
| 基因敲低 | siRNA序列、转染试剂、转染浓度、转染时间 阅读提示:STAR★Methods - RNAi and transfection |