临床样本分析
检测CBX4在胃癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的关系。
通过免疫组织化学(IHC)和Western blot分析114对胃癌组织及配对癌旁组织中的CBX4蛋白表达。
CBX4 Drives Gastric Cancer Progression by Activating β-Catenin Signaling.
包含临床组织样本(114对)IHC和WB分析、细胞系功能实验(敲低/过表达)、体内异种移植瘤模型、机制研究(β-连环蛋白水平和转录活性),并采用抑制剂XAV939进行功能验证。
胃癌细胞系(MKN45、SNU-1等) 裸鼠皮下异种移植瘤模型 胃癌患者组织样本(114对)
CBX4表达调控方式:慢病毒介导的shRNA敲低(MKN45)和过表达(SNU-1) 体外功能实验:CCK-8增殖、集落形成、Transwell迁移和侵袭(细胞密度和Matrigel包被) 体内实验:BALB/c裸鼠皮下注射2×10^6细胞,5只/组,4周后处死 机制检测:Western blot检测总/核β-连环蛋白,双荧光素酶报告基因检测转录活性 抑制剂处理:XAV939(10 μM)处理SNU-1-CBX4细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测CBX4在胃癌组织中的表达水平及其与临床病理特征的关系。
通过免疫组织化学(IHC)和Western blot分析114对胃癌组织及配对癌旁组织中的CBX4蛋白表达。
验证CBX4在胃癌细胞系中的表达,并建立敲低和过表达模型以进行功能研究。
Western blot检测多个胃癌细胞系和正常胃黏膜上皮细胞GES-1中CBX4蛋白表达;利用慢病毒载体构建MKN45-shCBX4(敲低)和SNU-1-CBX4(过表达)细胞系。
评估CBX4对胃癌细胞增殖、克隆形成、迁移和侵袭的影响。
使用CCK-8检测细胞增殖,集落形成实验检测克隆形成能力,Transwell实验(未包被或Matrigel包被)检测迁移和侵袭能力。
验证CBX4在体内的致瘤作用。
将MKN45-shCBX4或MKN45-shNC细胞皮下注射至裸鼠,监测肿瘤体积和重量。
探究CBX4是否通过β-连环蛋白信号传导发挥作用。
Western blot检测总β-连环蛋白和核β-连环蛋白水平,双荧光素酶报告基因检测β-连环蛋白转录活性。
验证CBX4的致癌效应依赖于Wnt/β-连环蛋白信号。
用XAV939处理SNU-1-CBX4细胞,检测细胞增殖、迁移和侵袭能力的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | BasalMedia | L210KJ |
| 磷酸盐缓冲液 | BasalMedia | B310KJ | |
| 胎牛血清 | VivaCell | C04001 | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime Biotechnology | C0222 | |
| 胰蛋白酶-EDTA溶液 | Beyotime Biotechnology | C0223 | |
| Western blot | Western blot裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 核蛋白提取 | 核提取试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0028 |
| Western blot检测 | BeyoECL Star化学发光检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | P0018AS |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime Biotechnology | C0038 |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Beyotime Biotechnology | ST551 |
| 杀稻瘟菌素S | Beyotime Biotechnology | ST018 | |
| 组织固定 | 10%中性福尔马林 | Solarbio | G2161 |
| 细胞染色 | 0.5%结晶紫 | Solarbio | G1065 |
| 侵袭实验 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 |
| 抑制剂处理 | XAV939 | MCE | HY-15147 |
| 双荧光素酶实验 | 双荧光素酶检测系统 | Promega | E2920 |
| Western blot | 兔抗CBX4抗体 | GeneTex | GTX53928 |
| 兔抗β-连环蛋白抗体 | CST | 8480 | |
| 兔抗组蛋白H3抗体 | CST | 9717 | |
| 兔抗GAPDH抗体 | ImmunoWay | YM8394 | |
| Western blot/免疫组化 | 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Servicebio | G1213 |
| 免疫组化 | 环保脱蜡液I-III | Servicebio | G1128 |
| EDTA缓冲液(pH 9.0) | Servicebio | G1203 | |
| 3%牛血清白蛋白 | Servicebio | GC305010 | |
| 明场显微镜(E100) | Nikon | E100 | |
| 细胞增殖检测 | 酶标仪(Synergy H1) | BioTek | -- |
| 荧光显微 | 荧光显微镜(NIB600) | Nexcope | NIB600 |
| 流式分析 | 流式细胞仪(FACSCelesta) | BD | FACSCelesta |
| Western blot检测 | 化学发光图像分析仪(Tanon 5200) | Tanon | 5200 |
| 图像分析 | ImageJ软件(版本1.8) | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | CBX4表达评估方法(IHC评分、WB)及与临床病理参数的关联;样本量114对 阅读提示:Materials and Methods: 3.2, 3.3; Results: 5.1; Table 1 |
| 细胞模型构建 | 慢病毒感染效率(GFP、流式);敲低/过表达效率(WB) 阅读提示:Materials and Methods: 3.1; Figure 2 |
| 体外功能实验 | 细胞增殖(CCK-8)检测时间点;克隆形成培养时间;迁移/侵袭细胞数量和培养时间 阅读提示:Materials and Methods: 3.4-3.6; Figure 3A-3C, 4 |
| 体内异种移植 | 小鼠品系、年龄、性别;细胞注射数量;肿瘤测量时间;实验持续时间 阅读提示:Materials and Methods: 3.7; Figure 3D-3G |
| 机制研究 | β-连环蛋白总蛋白和核蛋白检测方法;双荧光素酶报告基因实验条件;XAV939浓度和处理时间 阅读提示:Materials and Methods: 4, 4.1, 4.2; Figure 5 |