鉴定PRMT7为SOX9的调控因子
筛选调控SOX9蛋白丰度的PRMT家族成员,确定PRMT7的作用及其甲基转移酶活性的依赖性。
在HEK293T细胞中过表达各种PRMTs,检测SOX9蛋白水平;通过Co-IP验证PRMT7与SOX9的相互作用;利用PRMT7敲除、过表达、突变体(A32T)及抑制剂SGC3027检测SOX9蛋白变化。
Protein arginine methyltransferase 7-mediated arginine mono-methylation stabilizes SRY-box transcription factor 9 to promote non-small cell lung cancer progression.
包含体外细胞实验、体内异种移植瘤模型、临床组织样本分析及机制验证(如泛素化、甲基化、半衰期检测)。
HEK293T细胞 H1299细胞 H292细胞 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
确认PRMT7与SOX9的相互作用(Co-IP、免疫荧光) 验证PRMT7甲基转移酶活性对SOX9稳定性的影响(WT vs A32T突变体) 确认SOX9 R160位点为PRMT7介导的单甲基化位点(R160K突变体) 验证PRMT7对SOX9泛素化水平及半衰期的影响(泛素化实验、CHX追踪) 临床样本中PRMT7和SOX9表达水平与患者预后的关联(IHC、Kaplan-Meier分析)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选调控SOX9蛋白丰度的PRMT家族成员,确定PRMT7的作用及其甲基转移酶活性的依赖性。
在HEK293T细胞中过表达各种PRMTs,检测SOX9蛋白水平;通过Co-IP验证PRMT7与SOX9的相互作用;利用PRMT7敲除、过表达、突变体(A32T)及抑制剂SGC3027检测SOX9蛋白变化。
探究PRMT7是否通过抑制泛素-蛋白酶体降解来增加SOX9蛋白稳定性。
使用MG132阻断蛋白酶体,检测SOX9水平变化;通过CHX追踪实验检测SOX9半衰期;进行体内泛素化实验检测PRMT7对SOX9多泛素化水平的影响。
确定PRMT7是否通过干扰KEAP1/FBXW7与SOX9的相互作用来保护SOX9。
共表达PRMT7与KEAP1或FBXW7,检测SOX9蛋白水平及多泛素化;通过Co-IP检测PRMT7对KEAP1/FBXW7与SOX9结合的影响。
确定PRMT7介导SOX9单甲基化的具体精氨酸残基。
构建SOX9 HMG结构域内R/K突变体,体外甲基化实验结合体内甲基化检测,鉴定R160为关键位点。
验证PRMT7是否促进NSCLC细胞增殖、迁移和体内肿瘤生长。
CCK-8、集落形成、伤口愈合实验评估细胞增殖和迁移;异种移植实验评估体内肿瘤生长;IHC检测肿瘤组织中SOX9表达。
确定PRMT7促进NSCLC恶性表型是否以SOX9依赖性方式。
在PRMT7敲除细胞中回补SOX9-WT或R160K突变体,检测细胞增殖、集落形成、迁移及体内肿瘤生长。
评估PRMT7和SOX9在NSCLC组织中的表达及其与患者预后的关系。
IHC染色和生物信息学分析检测PRMT7和SOX9在NSCLC和正常组织中的表达;Kaplan-Meier生存分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良 Eagle 培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 转染 | Neofect DNA转染试剂 | -- | -- |
| 基因敲除 | pLentiCRISPR载体 | Chengdu RabbitBio | -- |
| 免疫印迹 | 抗SOX9抗体 | Cell Signaling Technology | 82630 |
| 抗PRMT7抗体 | Cell Signaling Technology | 14762 | |
| 抗单甲基精氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 8015S | |
| 抗KEAP1抗体 | Cell Signaling Technology | 8047 | |
| 抗SOX9抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166505 | |
| 抗PRMT7抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376077 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23948 | |
| 抗Vinculin抗体 | Sigma-Aldrich | V9131 | |
| 抗Flag标签抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗Lamin B1抗体 | HuaBio | ET1606-27 | |
| 药物处理 | MG132 | Selleck Chemicals | S2619 |
| 免疫印迹 | 抗FBXW7抗体 | Abcam | ab109617 |
| 药物处理 | SGC3027 | MedChemExpress | HY-11245 |
| 质粒构建 | His标签PRMTs构建体 | Sino Biological | -- |
| GFP-泛素质粒 | Addgene | -- | |
| HA-泛素质粒 | Addgene | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | TakaRa | 9109 |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TakaRa | RR092A |
| SYBR Select 预混液 | TakaRa | RR820A | |
| Bio-Red CFX Manager 3.1 系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫印迹/免疫沉淀 | IP裂解液 | Thermo Fisher Scientific | 87788 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Roche | A32965, A32957 | |
| 免疫印迹 | 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- |
| ECL底物 | Thermo Fisher Scientific | 34096 | |
| 免疫沉淀 | Protein A/G琼脂糖珠 | Thermo Fisher Scientific | 78610 |
| 亚细胞分级 | 亚细胞分级试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| 体外去泛素化实验 | Flag标签蛋白免疫沉淀检测试剂盒(磁珠) | Beyotime | P2181M |
| 镍-氮基三乙酸基质 | QIAGEN | 31314 | |
| 体外甲基转移酶实验 | S-腺苷甲硫氨酸 | Sigma-Aldrich | A4377 |
| 免疫荧光 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma-Aldrich | D9542 |
| Leica共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 免疫组化 | 抗SOX9抗体 | Cell Signaling Technology | 82630 |
| 抗PRMT7抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-30743 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源:HEK293T、H1299、H292;培养条件:DMEM+10% FBS+青霉素链霉素;转染试剂:Neofect DNA transfection reagent 阅读提示:参考Methods 'Cell culture and transfection' |
| PRMT7敲除细胞系构建 | sgRNA序列:5'-GTCGGGCCAATCCGACCACG-3';载体:pLentiCRISPR;筛选:嘌呤霉素 阅读提示:参考Methods 'Generation of PRMT7 knockout cell lines using the CRISPR/Cas9 technology' |
| 蛋白半衰期检测 | CHX浓度:100 μg/mL;时间点:指定间隔;细胞:HEK293T和H1299 阅读提示:参考Methods 'Protein half-life assay' |
| 体内泛素化实验 | MG132浓度:20 μM;处理时间:8小时;转染时间:36小时;细胞:HEK293T和H1299 阅读提示:参考Methods 'In vivo ubiquitination assay' |
| 异种移植瘤模型 | 细胞数量:5×10^5-5×10^6 cells/只;小鼠品系:BALB/c裸鼠或NOD/SCID小鼠;鼠龄:6-8周;性别:雄性;测量频率:每2-3天;体积公式:(L×W^2×π/6) 阅读提示:参考Methods 'In vivo xenograft assay' |