临床样本分析与风险因素评估
分析 IDD 患者的临床特征和 LncRNA MIR100HG 表达,评估其作为 IDD 风险因素和诊断标志物的价值。
纳入 183 例患者(101 例 IDD,82 例对照),收集临床资料和术中 NP 组织,MRI 评估退变程度,RT-qPCR 检测 MIR100HG 表达,Logistic 回归和 ROC 分析评估风险因素和诊断价值。
LncRNA MIR100HG induces degenerative changes in intervertebral disc degeneration nucleus pulposus cells by targeting miR-31-5p.
包含临床样本分析、细胞实验(过表达和挽救实验)及分子验证(DLR、RIP),但缺少体内动物模型和蛋白水平验证。
人髓核细胞(NPCs) 临床椎间盘组织样本
LncRNA MIR100HG 过表达质粒 pcDNA3.1-MIR100HG 和 miR-31-5p mimic 转染 细胞增殖检测:CCK8 法,细胞接种密度 1×10^3 细胞/孔,检测时间点 0、24、48、72 小时 凋亡检测:Annexin V-FITC/PI 双染流式细胞术 靶向关系验证:双荧光素酶报告基因实验(WT-MIR100HG 和 MT-MIR100HG 质粒)和 RIP 实验 炎症因子检测:ELISA 检测 TNF-α、IL-1β、IL-10
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析 IDD 患者的临床特征和 LncRNA MIR100HG 表达,评估其作为 IDD 风险因素和诊断标志物的价值。
纳入 183 例患者(101 例 IDD,82 例对照),收集临床资料和术中 NP 组织,MRI 评估退变程度,RT-qPCR 检测 MIR100HG 表达,Logistic 回归和 ROC 分析评估风险因素和诊断价值。
获取并鉴定原代髓核细胞,确保细胞纯度和活性用于后续实验。
从 NP 组织分离 NPCs,使用 0.25% 胰蛋白酶和 0.2% II 型胶原酶消化,过滤后培养于含 20% FBS 的 DMEM/F12 培养基,甲苯胺蓝染色鉴定,使用第二代细胞进行实验。
在 NPCs 中过表达 LncRNA MIR100HG 和 miR-31-5p 模拟物,验证转染效率和基因表达变化。
使用 Poly Fast 转染试剂将 pcDNA3.1-MIR100HG 或 miR-31-5p mimic 转染至 NPCs,RT-qPCR 检测 MIR100HG 和 miR-31-5p 表达水平。
评估 LncRNA MIR100HG 过表达对 NPCs 增殖和凋亡的影响,以及 miR-31-5p 能否逆转这些效应。
CCK8 检测细胞增殖,Annexin V-FITC/PI 流式细胞术检测凋亡。
评估 LncRNA MIR100HG 对炎症因子分泌和 ECM 合成/降解代谢的影响,以及 miR-31-5p 的调节作用。
ELISA 检测 TNF-α、IL-1β、IL-10 水平;RT-qPCR 检测 ECM 合成基因(Col II、Aggrecan)和降解基因(MMP3、MMP13)的表达。
验证 LncRNA MIR100HG 与 miR-31-5p 的直接靶向结合关系。
构建 WT-MIR100HG 和 MT-MIR100HG 质粒,双荧光素酶报告基因实验检测荧光活性;RIP 实验检测 RNA 结合蛋白的富集。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 样本处理 | OSE-Y30 手持式组织研磨器 | -- | -- |
| 细胞分离 | 0.25% 胰蛋白酶 | Gibco | -- |
| 0.2% II 型胶原酶 | Sigma | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12 培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞分离 | 磷酸盐缓冲液 | Sangon | -- |
| 台盼蓝 | Procell | -- | |
| 细胞染色 | 甲苯胺蓝 | -- | -- |
| 细胞转染 | Poly Fast 转染试剂 | MCE | HY-K1014 |
| RT-qPCR | Trizol 试剂 | -- | -- |
| BeyoFast™ SYBR Green 一步法 qRT-PCR 试剂盒 | Beyotime | D7268S | |
| TaqMan™ 微RNA 逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | 4366596 | |
| miRNA 荧光定量 PCR 试剂盒 | Sangon | B532461 | |
| Quant Studio 5 实时荧光定量 PCR 系统 | -- | -- | |
| 细胞功能检测 | CCK8 溶液 | -- | -- |
| Annexin V-FITC/PI 凋亡检测试剂盒 | YEASEN | 40302ES | |
| 流式分析 | Beckman CytoFlex 分析型流式细胞仪 | Beckman | -- |
| ELISA | 人 TNF-α ELISA 试剂盒 | Hangzhou Lianke Biotechnology Co., Ltd. | EK182 |
| 人 IL-1β ELISA 试剂盒 | Hangzhou Lianke Biotechnology Co., Ltd. | EK101B | |
| 人 IL-10 ELISA 试剂盒 | Hangzhou Lianke Biotechnology Co., Ltd. | EK110 | |
| DLR | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Vazyme | DL101 |
| RIP | RNA 免疫沉淀试剂盒 | Genecreat | JKR23003 |
| 数据分析 | IBM SPSS 统计软件 23.0 | IBM | -- |
| GraphPad Prism 9.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 样本来源:深圳市第四人民医院住院患者,排除标准:骨质疏松、糖尿病、类风湿关节炎、脊柱手术史、精神障碍、金属植入物等;IDD 组 101 例,对照组 82 例(脊柱侧凸患者) 阅读提示:Methods 部分样本收集 |
| 细胞分离与培养 | 消化酶浓度和条件(0.25% 胰蛋白酶 30 分钟,0.2% II 型胶原酶 37°C 4 小时),培养基成分(DMEM/F12 含 20% FBS 和 1% 青霉素/链霉素),培养条件(37°C,5% CO2),细胞代数(第二代) 阅读提示:Methods 部分 Isolation and culture of NPCs |
| 细胞转染 | 转染试剂 Poly Fast Transfection Reagent (HY-K1014),DNA 用量 1 μg,转染时间 24 小时 阅读提示:Methods 部分 Cell transfection |
| RT-qPCR | 内参基因:GAPDH 和 U6;反应条件:95°C 5 分钟,95°C 10 秒,60°C 30 秒,40 个循环;使用 2−ΔΔCt 计算表达 阅读提示:Methods 部分 RT-qPCR |
| 靶向验证 | DLR 实验:WT-MIR100HG 和 MT-MIR100HG 质粒构建,荧光素酶底物和 Renilla 底物检测;RIP 实验:细胞数量 2×10^6,抗体用量 5 μg,Protein A/G 磁珠 阅读提示:Methods 部分 DLR 和 RIP |