临床样本与VSMC中LINC01605表达验证
验证生物信息学筛选出的LINC01605在AD患者主动脉组织和VSMCs中的表达情况。
通过RT-qPCR检测AD患者(n=30)和正常对照(n=30)主动脉组织以及分离的VSMCs中LINC01605的表达;通过FISH检测其定位。
LncRNA LINC01605 Regulates Smooth Muscle Cell Functions and Participates in the Development of Aortic Dissection Through Regulating SGK1.
包含临床样本验证、体外细胞功能实验(CCK-8、Transwell、Western blot)、机制验证(RIP、FISH)及体内动物模型(Ang II诱导ApoE−/−小鼠)等多个独立证据层级。
人主动脉组织(30例AD患者与30例正常对照) 人主动脉血管平滑肌细胞(VSMCs) Ang II诱导的ApoE−/−小鼠主动脉夹层模型
LINC01605敲低和过表达慢病毒转染VSMCs(MOI=20,1×108 TU/mL) Ang II处理VSMCs的浓度和时间(1000 nM,24小时) Ang II诱导小鼠AD模型(1000 ng/kg/min,皮下渗透泵持续28天) LINC01605敲低慢病毒尾静脉注射剂量和频率(1×108 TU,每7天) sh-LINC01605慢病毒在Ang II输注前3天给予以确保提前敲低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证生物信息学筛选出的LINC01605在AD患者主动脉组织和VSMCs中的表达情况。
通过RT-qPCR检测AD患者(n=30)和正常对照(n=30)主动脉组织以及分离的VSMCs中LINC01605的表达;通过FISH检测其定位。
探究LINC01605对VSMC增殖、迁移、表型转换和自噬的影响。
使用LINC01605敲低和过表达慢病毒转染VSMCs,在有无Ang II(1000 nM,24 h)的条件下,通过CCK-8、EdU、Transwell、划痕实验和Western blot检测相关指标。
验证LINC01605是否通过靶向SGK1发挥作用。
通过ENCORI数据库预测靶基因,与GEO和Genecards数据取交集;通过RIP实验验证LINC01605与SGK1结合;通过FISH共定位观察;在LINC01605敲低基础上过表达SGK1,检测SGK1表达及VSMC功能变化。
评估敲低LINC01605对Ang II诱导的AD小鼠病理变化的影响。
建立Ang II诱导的ApoE−/−小鼠AD模型,给予sh-LINC01605慢病毒敲低,通过EVG和HE染色观察主动脉病理,Western blot检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | Procell | PM150910 |
| 胎牛血清 | Procell | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Procell | -- | |
| 维生素C | Procell | -- | |
| 胰岛素 | Procell | -- | |
| 转铁蛋白 | Procell | -- | |
| ECGs | Procell | -- | |
| HEPES | Procell | -- | |
| TES | Procell | -- | |
| 血管紧张素II | Sigma | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript逆转录预混液 | Takara | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Toyobo | -- | |
| ABI 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| FISH | FITC标记的LINC01605探针 | RiboBio | -- |
| Cy3标记的SGK1探针 | RiboBio | -- | |
| DAPI | Sigma | -- | |
| 蔡司LSM 880共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| CCK-8 assay | CCK-8试剂 | Dojindo | -- |
| BioTek Synergy H1酶标仪 | BioTek Instruments | -- | |
| EdU assay | EdU | Beyotime | -- |
| Click-iT EdU Alexa Fluor 488试剂盒 | Invitrogen | -- | |
| 奥林巴斯IX73显微镜 | Olympus | -- | |
| Transwell migration assay | Transwell小室(8 μm孔径) | Corning | -- |
| 结晶紫 | Beyotime | -- | |
| 尼康Eclipse Ti显微镜 | Nikon | -- | |
| 动物实验 | 生理盐水 | -- | -- |
| Alzet 2004渗透压泵 | Alzet | 2004 | |
| 异氟烷 | Vet One | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 抗SM22α抗体 | Abcam | ab14106 | |
| 抗MMP-2抗体 | Proteintech | 10373-2-AP | |
| 抗MMP-9抗体 | Abcam | ab137867 | |
| 抗p62抗体 | Abcam | ab155686 | |
| 抗LC3B抗体 | Abcam | ab222776 | |
| 抗SGK1抗体 | Proteintech | 28454-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab181603 | |
| HRP偶联二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| ECL底物 | Millipore | -- | |
| ImageLab软件 | Bio-Rad | -- | |
| 自噬检测 | GFP-mRFP-LC3质粒 | -- | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 氯喹 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | VSMCs(CP-H116)购买自Procell;培养在Ham's F-12K培养基(PM150910)并添加特定成分;转染使用慢病毒MOI=20(1×108 TU/mL,2 μL/well),转染72小时 阅读提示:Methods 2.5 Cell Culture and Lentiviral Transfection |
| Ang II处理 | Ang II浓度1000 nM,溶解于无菌PBS,处理24小时 阅读提示:Methods 2.5 Cell Culture and Lentiviral Transfection |
| 动物模型 | 雄性ApoE−/−小鼠(8-10周龄,C57BL/6背景),随机分为4组(n=8-10/组);Ang II剂量1000 ng/kg/min,皮下渗透泵(Alzet 2004)持续28天;sh-LINC01605慢病毒1×108 TU,尾静脉注射,每7天一次,在Ang II输注前3天开始 阅读提示:Methods 2.12 Animal Experiment |
| Western blot | 蛋白裂解使用RIPA缓冲液;上样量30 μg/lane;一抗浓度如α-SMA 1:6000等(详见Methods 2.13) 阅读提示:Methods 2.13 Western Blot |
| 自噬流检测 | GFP-mRFP-LC3质粒转染,CQ处理,共聚焦显微镜观察红色和黄色斑点数量 阅读提示:Methods 2.14 Tandem Fluorescent-Tagged LC3 Reporter Assay 及补充图S1 |
| 统计分析 | 所有实验三重复(n=3);数据表示为mean±SD;两组比较使用独立样本t检验,多组比较使用单因素方差分析;显著性水平p<0.05 阅读提示:Methods 2.15 Statistical Analysis |