检测猪链球菌对EphA2和ZO-1表达的影响
验证猪链球菌是否下调EphA2和紧密连接蛋白ZO-1的表达。
用SC19和D39感染hCMEC/D3和bEnd.3细胞及小鼠,通过免疫印迹和免疫荧光检测EphA2和ZO-1的表达。
Dcaf15-mediated EphA2 degradation triggers disruption of the blood-brain barrier during Streptococcus suis meningitis.
包含体外细胞模型(hCMEC/D3、bEnd.3)、体内小鼠模型(EphA2+/+和EphA2-/-)、CRISPR-Cas9敲除、功能验证(TEER、EB染色)及机制验证(泛素化、去乙酰化、磷酸化)等多层证据。
hCMEC/D3细胞 bEnd.3细胞 EphA2基因敲除小鼠(EphA2-/-) 野生型C57BL/6J小鼠(EphA2+/+)
感染复数(MOI=10)及感染时间(0-6小时) 小鼠感染剂量(2.5×10^8 CFU)和感染途径(腹腔注射) EphA2敲除和过表达细胞系 DCAF15敲低和过表达细胞系 MG132和氯喹(CQ)处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证猪链球菌是否下调EphA2和紧密连接蛋白ZO-1的表达。
用SC19和D39感染hCMEC/D3和bEnd.3细胞及小鼠,通过免疫印迹和免疫荧光检测EphA2和ZO-1的表达。
探究EphA2缺失或过表达对猪链球菌诱导的BBB破坏的影响。
使用EphA2敲除细胞和EphA2-/-小鼠,检测ZO-1表达、TEER值、细菌载量和EB渗漏。
验证EphA2是否通过LKB1/AMPK通路调节自噬以保护BBB。
检测EphA2敲除细胞中LC3、P62表达及自噬流,分析AMPK和LKB1磷酸化,并验证EphA2与LKB1相互作用。
筛选并验证与EphA2相互作用并介导其降解的E3泛素连接酶。
通过Co-IP和质谱分析筛选EphA2相互作用蛋白,验证DCAF15与EphA2的相互作用及结构域。
证明DCAF15通过K48和K63连接的泛素化促进EphA2降解。
检测DCAF15对EphA2蛋白水平的影响,分析泛素化类型和位点,并通过突变体验证。
确定S. suis的STK是否参与EphA2的降解。
感染stk缺失菌株,检测EphA2表达和泛素化水平。
阐明STK如何通过磷酸化SIRT1促进DCAF15去乙酰化,增强EphA2泛素化。
检测DCAF15乙酰化水平,筛选去乙酰化酶,验证SIRT1磷酸化位点和DCAF15乙酰化位点。
验证EphA2敲除和Crocetin处理对体内BBB破坏的影响。
使用EphA2-/-小鼠和Crocetin预处理小鼠,检测细菌载量、ZO-1表达和BBB通透性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gbico | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gbico | -- | |
| 细菌培养 | Todd-Hewitt肉汤 | OXOID | CM0189B |
| 胰蛋白胨大豆琼脂 | -- | -- | |
| 蛋白检测 | 抗EphA2抗体 | Cell Signaling Technology | 6997 |
| 抗LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 3868T | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272S | |
| 抗磷酸化AKT(Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| 抗磷酸化p44/42 MAPK(ERK1/2)(Thr202/Tyr204)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370T | |
| 抗p44/42 MAPK(ERK1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 4695T | |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 5831 | |
| 抗磷酸化AMPKα(Thr172)抗体 | Cell Signaling Technology | 2535 | |
| 抗磷酸化LKB1(Ser334)抗体 | Cell Signaling Technology | 3055 | |
| 抗DYKDDDDK标签抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| 抗P62/SQSTM1抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| 抗STK11/LKB1抗体 | Proteintech | 10746-1-AP | |
| 抗ZO-1抗体 | Proteintech | 21773-1-AP | |
| 抗SIRT1抗体 | Proteintech | 60303-1-Ig | |
| 抗HA标签多克隆抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗Myc抗体 | Proteintech | 16286-1-AP | |
| 抗DYKDDDDK抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 抗磷酸化(Ser/Thr)抗体 | Abcam | ab117253 | |
| 抗P300抗体 | Abcam | ab275378 | |
| 抗泛素抗体 | Santa Cruz | sc-8017 | |
| 抗乙酰赖氨酸抗体 | PTM BIO | PTM-105RM | |
| 抗DCAF15抗体 | Sigma | -- | |
| 药物处理 | 3-甲基腺嘌呤 | MCE | HY-19312 |
| 雷帕霉素 | MCE | HY-10219 | |
| MG-132 | MCE | HY-13259 | |
| 氯喹 | MCE | HY-17589A | |
| Pim1/AKK1-IN-1 | MCE | HY-10371 | |
| 藏红花酸单甲酯 | MCE | HY-N6904 | |
| 二甲基亚砜 | MCE | HY-Y0320 | |
| 免疫沉淀 | 抗Myc亲和凝胶 | Beyotime | P2285 |
| 蛋白A+G琼脂糖 | Beyotime | P2055 | |
| GST标签纯化树脂 | Beyotime | P2251 | |
| 细胞裂解 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013F |
| 免疫沉淀 | 抗DYKDDDDK G1亲和树脂 | GenScript | L00432 |
| 转染 | Lipomaster 293转染试剂 | Vazyme | JC3001 |
| RT-qPCR | ChamQ Blue通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | Q312 |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000008 |
| 蛋白表达 | SIRT1融合蛋白 | Proteintech | Ag17677 |
| STK11融合蛋白 | Proteintech | Ag1048 | |
| RT-qPCR | FastPure细胞/组织总RNA提取试剂盒V2 | Vazyme | -- |
| HiScript IV All-in-One Ultra RT超混液 | Vazyme | -- | |
| qPCR | CFX96 | Bio-Rad | -- |
| 动物实验 | 伊文思蓝 | Sigma | -- |
| 免疫荧光 | 0.1% Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG(H&L)Alexa fluor 488 | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔IgG(H&L)Alexa fluor 594 | Abcam | -- | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 显微镜 | 共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 透射电镜 | JEM-1400-FLASH透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 细胞培养 | Transwell-Clear插入小室 | Corning Costar | -- |
| TEER测量 | Millicell-ERS电阻系统 | Millipore | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细菌感染细胞 | 感染复数(MOI=10)和感染时间(0-6小时) 阅读提示:见Methods 'Cell culture and bacterial infection' |
| 体内感染 | 小鼠数量、感染剂量(2.5×10^8 CFU)、感染途径(腹腔注射)、感染时间(48小时) 阅读提示:见Methods 'Bacterial infection in vivo' |
| EphA2敲除细胞 | CRISPR-Cas9靶序列、筛选浓度和周期 阅读提示:见Methods 'The generation of EphA2−/− hCMEC/D3 cells' |
| 药物处理 | 3-MA浓度5 mM、BafA1浓度50 nM、Rapa浓度20 μM、Crocin剂量20 mg/kg 阅读提示:见Methods 'Cell culture and bacterial infection'和Fig. 3P |
| 蛋白质印迹 | 抗体稀释度和孵育时间 阅读提示:见Methods 'Western blotting' |
| 免疫共沉淀 | 裂解缓冲液(NP-40)和抗体使用 阅读提示:见Methods 'Co-immunoprecipitation (Co-IP) and GST affinity-isolation assays' |
| TEER测量 | 细胞培养天数(7-10天)和TEER阈值(>200 Ω/cm2) 阅读提示:见Methods 'Endothelial cell permeability assay in vitro using transwell model' |