mBMSCs的分离、鉴定与分化潜能验证
确认mBMSCs的身份和多能性,确保实验模型的可靠性。
从C57BL/6小鼠股骨和胫骨分离mBMSCs,通过流式细胞术检测表面标志物(CD14、CD19、CD34、CD45阴性,CD29、CD44、CD73、CD90阳性),并进行成骨、成软骨、成脂分化诱导及染色鉴定。
Protective effects of mouse bone marrow mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles on radiation-induced epididymal cells damage via USP44/RBM14 axis.
实验包含体外细胞模型、分子机制验证和功能回复实验,但缺乏体内动物模型验证,且结论主要基于单一细胞系。
小鼠骨髓间充质干细胞(mBMSCs) 小鼠附睾上皮细胞系(mPC-1) mBMSC来源的细胞外囊泡(mBMSC-EVs)
辐射剂量:6 Gy,剂量率300 cGy/min(Methods) EVs处理浓度:20 μg/mL(Methods) 共培养比例:mPC-1与mBMSC比例为5:1(Methods) GW4869浓度:10 μM(Methods) USP44敲低效率:shUSP44-2用于下游实验(Results)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认mBMSCs的身份和多能性,确保实验模型的可靠性。
从C57BL/6小鼠股骨和胫骨分离mBMSCs,通过流式细胞术检测表面标志物(CD14、CD19、CD34、CD45阴性,CD29、CD44、CD73、CD90阳性),并进行成骨、成软骨、成脂分化诱导及染色鉴定。
获得并验证mBMSC来源的细胞外囊泡,确保其纯度和特征。
通过超速离心从mBMSC条件培养基中分离EVs,使用透射电子显微镜观察形态,纳米颗粒跟踪分析测量粒径分布,Western blot检测外泌体标志物CD9、CD63、CD81。
确定辐射对mPC-1细胞活力、DNA损伤和凋亡的影响,并选择后续实验的辐射剂量。
以不同剂量(2, 4, 6, 8 Gy)照射mPC-1细胞,通过MTT检测细胞活力,流式细胞术检测凋亡,Western blot检测γH2AX表达。
评估mBMSCs及其EVs是否通过分泌EVs介导对mPC-1/IR细胞的保护作用。
将mPC-1/IR细胞与mBMSCs共培养或用mBMSC-EVs处理,并加入GW4869抑制EV分泌,检测DNA修复、凋亡、氧化应激等相关指标。
筛选辐射响应性去泛素化酶,并验证USP44在放射保护中的作用。
通过RT-qPCR和Western blot检测辐射后USP家族表达变化,过表达候选USP评估细胞活力,并验证USP44在mBMSCs和EVs中的存在。
确定USP44在mBMSC-EVs介导的放射保护中是必需的。
用shRNA敲低mBMSCs中的USP44,然后共培养或提取EVs处理mPC-1/IR细胞,检测DNA修复、凋亡、氧化应激等指标。
确认USP44与RBM14的直接相互作用,并验证USP44通过去泛素化稳定RBM14。
通过免疫沉淀-质谱筛选互作蛋白,Co-IP和GST pull-down验证直接结合,CHX追踪和泛素化实验检测RBM14的稳定性。
验证RBM14是USP44下游的关键效应分子,其过表达能否逆转USP44敲低造成的损伤。
在mPC-1/IR细胞共培养或EVs处理中,过表达RBM14,检测DNA修复、凋亡、氧化应激等指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | PriGrow V培养基 | Abm | TM015 |
| 胎牛血清 | HyClone | SH30406.05 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15,140–148 | |
| DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT | |
| 间充质干细胞培养基 | Immocell | IMC-393 | |
| 流式分析 | CD14抗体 | eBioscience | 17–0141-82 |
| CD19抗体 | eBioscience | 11–0193-82 | |
| CD34抗体 | BioLegend | 119,307 | |
| CD45抗体 | eBioscience | 48–0451-82 | |
| CD29抗体 | BioLegend | 102,207 | |
| CD44抗体 | BioLegend | 103,021 | |
| CD73抗体 | eBioscience | 12–0731-82 | |
| CD90抗体 | Beyotime | AC1153 | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 分化诱导 | 成骨诱导培养基 | Procell | PD-005 |
| 转化生长因子β3 | Procell | PD-003 | |
| 成脂诱导培养基 | Procell | PD-004 | |
| EVs分离 | 去外泌体胎牛血清 | VivaCell Biosciences | C3801 |
| 0.22 µm滤膜 | Millipore | SLGVM33RS | |
| Optima L-100XP超速离心机 | Beckman Coulter | -- | |
| EVs表征 | 透射电子显微镜 | Hitachi | HT-7700 |
| Zetaview纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- | |
| Western blot | CD9抗体 | Proteintech | 20,597–1-AP |
| CD81抗体 | Proteintech | 27,855–1-AP | |
| CD63抗体 | Proteintech | 67,605–1-Ig | |
| 辐射处理 | 6 MV X射线直线加速器 | Elektra | precise |
| 共培养 | Corning Transwell系统 | Corning | 07–200-154 |
| 药物处理 | GW4869 | -- | -- |
| 敲低 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25776 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | L2000075 |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Yeasen | 20124ES03 | |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo | 23,227 |
| Western blot | USP44抗体 | Immunoway | YT4841 |
| USP10抗体 | Immunoway | YN1464 | |
| USP29抗体 | Immunoway | YN1469 | |
| USP32抗体 | Immunoway | YT4835 | |
| USP45抗体 | Immunoway | YT4842 | |
| RBM14抗体 | Abcam | ab70636 | |
| Rad51抗体 | Abcam | ab133534 | |
| γH2AX抗体 | CST | 9718 | |
| PCNA抗体 | CST | 13,110 | |
| Bax抗体 | Abcam | ab32503 | |
| Bcl2抗体 | CST | 3498 | |
| cleaved caspase-3抗体 | CST | 9664 | |
| ACTB抗体 | Sigma | A2228 | |
| HRP标记抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记抗鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| ECL化学发光底物 | Thermo Scientific | 34,580 | |
| 免疫共沉淀 | IP裂解缓冲液 | Yeasen | 20119ES60 |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51,064–2-AP | |
| 抗FLAG抗体 | Proteintech | 20,543–1-AP | |
| 蛋白质稳定性 | MG132 | -- | -- |
| 细胞周期分析 | 7-AAD | -- | -- |
| RNase A | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC和PI染色试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | S0034 |
| 细胞活力 | MTT试剂盒 | Yeasen | 0206ES76 |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| 氧化应激检测 | Griess试剂检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A012-1 |
| BH4 ELISA试剂盒 | Yueteng Biological | YT-M30398 | |
| 细胞毒性检测 | LDH检测试剂盒 | Solarbio | BC0680 |
| RT-qPCR | RNA提取试剂 | Vazyme | R401-01 |
| HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | R222-01 | |
| ChamQ SYBR Color qPCR预混液 | Vazyme | Q431-02 | |
| Applied Biosystems实时PCR系统 | Applied Biosystems | ABI | |
| 形态学观察 | 倒置相差显微镜 | Olympus | CKX41 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | mPC-1细胞培养条件:PriGrow V培养基,33°C,5% CO2;mBMSCs培养条件:DMEM,10% FBS,37°C,5% CO2。 阅读提示:Methods - Cell culture |
| mBMSC-EVs分离 | EVs分离方法:超速离心,条件:2000×g 10分钟,10,000×g 45分钟,100,000×g 60分钟和70分钟;培养基:含10%去外泌体FBS的DMEM;无血清培养48小时。 阅读提示:Methods - EVs isolation |
| 辐射处理 | 辐射剂量:6 Gy,剂量率300 cGy/min;照射后处理:共培养或EVs处理24小时。 阅读提示:Methods - mPC-1 cell irradiation and mBMSC co-culture or EVs exposure; Figure 2 legend |
| 共培养或EVs处理 | 共培养比例:5:1(mPC-1:mBMSC);EVs浓度:20 μg/mL;GW4869浓度:10 μM。 阅读提示:Methods - mPC-1 cell irradiation and mBMSC co-culture or EVs exposure |
| USP44敲低 | shRNA序列:shUSP44-2 (GCACAGGAGAAGGATACTAAT);转染条件:MOI 10,polybrene 8 μg/mL,puromycin 2 μg/mL。 阅读提示:Methods - shRNA-mediated knockdown; Results - USP44 expression regulates DNA repair... |
| 蛋白质检测 | Western blot一抗浓度、二抗浓度、曝光时间等需按Methods所述,但具体批次可能需验证。 阅读提示:Methods - Protein extraction and western blotting |
| 泛素化实验 | CHX浓度:30 μM;MG132浓度:10或20 μM;泛素化检测需共转染Flag-RBM14、HA-USP44、His-Ub。 阅读提示:Methods - Protein stability and ubiquitination assays |