SHEDs的体外分化与表征
验证SHEDs在肠道条件培养基下是否能分化为TGM2+TFPI2+ QFLSs并明确其信号通路。
SHEDs在肠道类器官条件培养基(CM)中诱导2周,通过scRNA-seq分析分化轨迹,Western blot验证Wnt/JNK通路作用。
Harnessing dental stem cell-derived synovial cells for IBD therapy: dual modulation of gut immunity and crypt repair.
包含体外细胞分化实验(scRNA-seq、Western blot)、小鼠DSS/TNBS结肠炎模型、类器官共培养、体内中和抗体实验及人类IBD组织样本验证,涵盖功能与机制验证。
小鼠DSS结肠炎模型 小鼠TNBS结肠炎模型 肠道类器官(小鼠及人类IBD患者) 人类IBD组织样本
SHEDs和CM-SHEDs经尾静脉注射至8周龄雌性C57/B6(DSS)和BALB/c(TNBS)小鼠 DSS浓度2.5%连续7天;TNBS用1% TNBS溶于50%乙醇,每周一次共5周 TGM2+ QFLSs经尾静脉注射(1×10^5细胞/孔用于ELISA) IL-6和LIF中和抗体腹腔注射,隔天一次,从细胞移植前2天至移植后第6天 DSS模型中流式细胞术检测结肠CD45+淋巴细胞中Treg和Th17细胞比例
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SHEDs在肠道条件培养基下是否能分化为TGM2+TFPI2+ QFLSs并明确其信号通路。
SHEDs在肠道类器官条件培养基(CM)中诱导2周,通过scRNA-seq分析分化轨迹,Western blot验证Wnt/JNK通路作用。
评估SHEDs和CM-SHEDs对DSS和TNBS诱导的小鼠结肠炎的治疗作用。
通过尾静脉注射SHEDs或CM-SHEDs至DSS或TNBS诱导的结肠炎小鼠,监测体重、DAI评分、肠道长度和组织病理。
确定TGM2+ QFLSs是介导IBD缓解的核心细胞群体。
从CM-SHEDs中分选TGM2+和TGM2-细胞,分别尾静脉注射至DSS和TNBS模型小鼠中,比较治疗效果。
验证QFLSs分泌的IL-6是否促进潘氏细胞增殖以恢复隐窝稳态。
在肠道类器官培养系统中加入IL-6或IL-6中和抗体,观察类器官生长和潘氏细胞数量;Transwell实验检测TGM2+细胞迁移能力。
验证QFLSs分泌的LIF是否促进免疫抑制性Treg细胞扩增并抑制Th17细胞。
在DSS模型中,通过流式细胞术和scRNA-seq分析结肠CD45+淋巴细胞中Treg和Th17细胞比例。
评估TGM2+ QFLSs移植的免疫原性、安全性和组织滞留性。
DSS小鼠接受TGM2+ QFLSs移植后,检测血液学指标和细胞因子,并观察6个月内的存活率和细胞滞留。
验证TGM2+ QFLSs在人类IBD组织中的存在及其与预后的相关性。
收集43对UC和CD患者肠道组织(24例UC,19例CD),通过mIHC染色检测QFLSs、潘氏细胞和Treg细胞,并分析QFLSs与粪便钙卫蛋白水平的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM Alpha基础培养基 | Gibco | C12571500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | A5670701 | |
| 谷氨酰胺 | Gibco | A2916801 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| Advanced DMEM/F12培养基 | Gibco | 12634028 | |
| HEPES缓冲液 | Gibco | 15630130 | |
| GlutaMAX补充剂 | Gibco | 35050061 | |
| B27补充剂 | Life Technologies | 17504044 | |
| 胃泌素I | Sigma | 10047333 | |
| N-乙酰半胱氨酸 | Alfa Aesar | 616911 | |
| 人重组表皮生长因子 | Life Technologies | PHG0314 | |
| 人重组Noggin | Peprotech | 12010C | |
| 人重组R-spondin-1 | Peprotech | 12038 | |
| 人重组Wnt-3A | MCE | HYP70452 | |
| A83-01 | Tocris | 2939 | |
| SB202190 | Sigma | S7067 | |
| 动物模型 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | 160110 |
| 基因敲低 | pLKO.1载体 | Addgene | -- |
| TGM2人shRNA质粒试剂盒 | Origene | TL301132 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026CN |
| RT-qPCR | HiScript II qRT SuperMix | Vazyme | R22201 |
| 荧光多重免疫组化 | AlphaTSA多重免疫组化试剂盒 | Alpha X Biotech Co. Ltd. | -- |
| EDTA缓冲液pH 9 | Alpha X Biotech Co. Ltd. | -- | |
| 抗体稀释液/封闭液 | Alpha X Biotech Co. Ltd. | -- | |
| XTSA聚合物HRP小鼠+兔 | Alpha X Biotech Co. Ltd. | -- | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | Alpha X Biotech Co. Ltd. | -- | |
| 蔡司LSM880 + ELYRAS.1显微镜 | ZEISS | -- | |
| 流式细胞术 | FACScalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| ELISA | IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab178013 |
| LIF ELISA试剂盒 | Abcam | ab242228 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Abcam | ab208348 | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Abcam | ab282874 | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Abcam | ab100697 | |
| 血液分析 | BC-2008 VET血液分析仪 | Mindray | -- |
| 类器官培养 | 基质胶 | BD Biosciences | 356230 |
| 二硫苏糖醇 | Sigma | D0632 | |
| 柠檬酸三钠 | Sigma | C8532 | |
| 磷酸氢二钠 | Sigma | S9763 | |
| 氯化钠 | Sigma | S5886 | |
| 磷酸二氢钾 | Sigma | 795488 | |
| D-山梨醇 | Sigma | S1876 | |
| 蔗糖 | Sigma | S5016 | |
| 体内中和抗体 | IL-6中和抗体 | R&D Systems | -- |
| LIF中和抗体 | R&D Systems | -- | |
| 对照IgG | R&D Systems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | SHEDs来源(Hongxin Biology PCB006),培养条件(37°C、5% CO2),培养基成分(MEM Alpha + 15% FBS + 2 mM谷氨酰胺 + 1%青霉素-链霉素),传代时间(每3天更换培养基) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| SHEDs分化 | 诱导时间(2周),CM培养基成分(Advanced DMEM/F12、B27、gastrin I、N-acetylcysteine、EGF、Noggin、R-spondin-1、Wnt-3A、A83-01、SB202190),更换频率(每2天) 阅读提示:Methods - Cell culture |
| 动物模型 | 小鼠品系和性别(8周龄雌性C57/B6和BALB/c),DSS浓度(2.5%)和持续时间(7天),TNBS浓度(1% TNBS溶于50%乙醇)和注射方案(每周一次共5周),麻醉剂量(氯胺酮100 mg/kg + 赛拉嗪10 mg/kg) 阅读提示:Methods - Mice and IBD model establishment |
| 细胞治疗 | 细胞类型(SHEDs或CM-SHEDs,TGM2+或TGM2-细胞),注射方式(尾静脉),剂量(文中未明确说明具体细胞数),治疗时间点(文中未明确说明,但DSS模型在7天后开始恢复) 阅读提示:Methods - Mice and IBD model establishment; Results - Fig. 1, Fig. 3 |
| 类器官培养 | 隐窝分离方法(使用螯合缓冲液),Matrigel用量(25 μl/孔),培养基(CM),培养时间(1周),IL-6浓度(10-100 ng/ml) 阅读提示:Methods - Crypt isolation and 3D organoid culture; Results - Fig. 4 |
| 机制验证 | IL-6和LIF中和抗体剂量、给药途径(腹腔注射)、给药频率(隔天一次)和给药时间(从细胞移植前2天至移植后第6天),IL-6中和抗体浓度(5 μg/ml)在类器官共培养中 阅读提示:Methods - IL-6 or LIF neutralisation in vivo; Results - Supplementary Figure S4 and S7 |
| 人类样本分析 | 患者配对组织(43对,24 UC和19 CD),组织处理和mIHC染色方案,粪便钙卫蛋白水平检测方法 阅读提示:Methods - Fluorescent multiplex immunohistochemistry; Results - Fig. 6 |