动物模型建立与药效评估
评估E0703对辐射诱导的小鼠损伤的防护作用。
C57BL/6J小鼠口服E0703后接受γ射线辐射,监测生存率,评估骨髓、脾脏、睾丸病理损伤,检测外周血白细胞水平。
E0703 targets ERβ to facilitate the upregulation of GLI3, thereby alleviating irradiation-induced DNA damage on lymphocytes.
研究包含体内小鼠模型、体外细胞模型(AHH-1)等多层级验证,并采用敲低/过表达、拮抗剂、CETSA/DARTS/SPR等多种功能与机制验证。
C57BL/6J小鼠辐射损伤模型 人外周血B淋巴细胞系AHH-1 人T淋巴细胞系H9 人NK细胞系KHYG-1
E0703给药剂量和时间:口服给药,24小时前,剂量未明确说明 辐射剂量:8 Gy(生存实验)和5 Gy(淋巴细胞实验) 细胞模型:AHH-1,E0703处理浓度320 nM 关键拮抗剂:KU-55933(ATM)、BML-277(CHK2)、PHTPP(ERβ)、SBI0640756(eIF4G1)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估E0703对辐射诱导的小鼠损伤的防护作用。
C57BL/6J小鼠口服E0703后接受γ射线辐射,监测生存率,评估骨髓、脾脏、睾丸病理损伤,检测外周血白细胞水平。
验证E0703对辐射诱导的B淋巴细胞损伤的保护作用。
AHH-1细胞用E0703或DMSO预处理后接受γ射线辐射,检测细胞活力、凋亡、DNA损伤。
确定E0703辐射防护作用所依赖的信号通路。
检测DDR相关通路蛋白水平,使用特异拮抗剂验证ATM-CHK2信号的必要性。
鉴定E0703激活ATM-CHK2信号所依赖的关键分子。
RNA测序筛选E0703处理后差异表达基因,重点关注GLI3,并通过敲低和过表达验证其功能。
确定E0703的直接作用靶蛋白。
通过CETSA、DARTS、分子对接和SPR分析E0703与ERβ的结合。
阐明E0703通过ERβ调控GLI3表达并影响下游机制。
使用ERβ拮抗剂PHTPP验证ERβ必要性;ChIP检测ERβ在GLI3启动子区域的富集;Co-IP和免疫共定位检测GLI3与eIF4G1相互作用及eIF4F复合物形成。
在动物和细胞水平验证E0703对辐射诱导损伤的保护作用。
在体内模型中评估E0703对淋巴细胞损伤和组织病理的影响;在体外模型中评估细胞活力和DNA损伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | E0703 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Shanghai Topscience Co., Ltd. | -- |
| Calcein AM/PI双染色试剂盒 | DOJINDO | -- | |
| 信号通路抑制 | KU-55933 | MedChemExpress | -- |
| BML-277 | MedChemExpress | -- | |
| AZD9496 | MedChemExpress | -- | |
| PHTPP | MedChemExpress | -- | |
| SBI0640756 | MedChemExpress | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL试剂 | -- | -- |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| Alexa Fluor® 488偶联物 | -- | -- | |
| 蛋白质提取 | M-PER™哺乳动物蛋白质提取试剂 | Thermo Fisher | 78501 |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0010S |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 |
| ECL底物 | epizyme | SQ201 | |
| 化学发光成像系统 | Tanon | 5200 | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 蔡司LSM980激光共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | LSM980 | |
| 彗星实验 | 彗星电泳试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGA1302-20 |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| CETSA | 蛋白酶 | MedChemExpress | HY-B2228 |
| SPR | Biacore T200 | Cytiva | -- |
| CM5传感芯片 | Cytiva | -- | |
| ChIP | Pierce琼脂糖ChIP试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26156 |
| IP | Pierce交联免疫沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 26147 |
| 质谱分析 | ORBITRAP ECLIPSE质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗体 | ATM抗体 | Abcam | ab201022 |
| CHK2抗体 | Abcam | ab199031 | |
| GLI3抗体 | Proteintech | 28272-1-AP | |
| ERβ抗体 | GeneTex | GTX70174 | |
| eIF4G1抗体 | Abcam | ab2609 | |
| γH2AX抗体 | Abcam | ab26350 | |
| β-actin抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | R380624 | |
| ATR抗体 | Cell Signaling Technology | 13934 | |
| CHK1抗体 | Abcam | ab32531 | |
| P53抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 345567 | |
| p-CHK1抗体 | Abcam | ab278717 | |
| p-ATR抗体 | Abcam | ab316925 | |
| DNA-PKcs抗体 | Abcam | ab32566 | |
| KU70抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 200995 | |
| KU80抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 201004 | |
| p-DNA-PKcs抗体 | Abcam | ab124918 | |
| RAD51抗体 | Abcam | ab133534 | |
| ATM抗体 (ab199726) | Abcam | ab199726 | |
| CHK2抗体 (ab109413) | Abcam | ab109413 | |
| p-ATM抗体 | Abcam | ab36810 | |
| p-CHK2抗体 | Abcam | ab85743 | |
| ERα抗体 | GeneTex | GTX127978 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| eIF4A1/A2/A3抗体 | Abclonal | A24293 | |
| eIF4E抗体 | Abcam | ab33766 | |
| eIF4E抗体 (R24194) | ZEN-BIOSCIENCE | R24194 | |
| HRP标记的二抗 | Cell Signaling | 7074S |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、E0703给药剂量、给药途径(口服)、给药时间(辐射前24小时)、辐射剂量(8 Gy和5 Gy)、每组动物数(10只/5只/3只) 阅读提示:见Methods部分'Animal model of radiation injury'及图1图注 |
| 细胞实验 | 细胞系(AHH-1、H9、KHYG-1)、培养条件、辐射剂量(5 Gy)、E0703浓度(320 nM)、处理时间 阅读提示:见Methods部分'Cell culture and treatments'及图2图注 |
| 信号通路抑制实验 | 拮抗剂名称(KU-55933、BML-277、PHTPP、AZD9496、SBI0640756)、处理浓度(文中未明确说明)、处理时间 阅读提示:见Methods部分'Cell culture and treatments'及图3、图5、图7图注 |
| 靶点验证 | CETSA温度梯度、DARTS蛋白酶浓度、SPR运行缓冲液、E0703浓度等 阅读提示:见Methods部分'CETSA assay'、'DARTS assay'、'SPR' |
| 分子机制研究 | ChIP抗体、qPCR引物序列、Co-IP抗体、质谱条件 阅读提示:见Methods部分'ChIP assay'、'IP'、'Label-free proteomics'及表1 |