TOPs制备与理化表征
获得并表征由三种食用龟肉混合制备的寡肽产物,确定其分子量、肽长度及氨基酸组成等特性。
以1:1:1比例混合三龟种肉,经蒸煮、酶解、过滤、浓缩、喷雾干燥和冷冻干燥等步骤制备TOPs;进行营养成分分析和氨基酸组成测定;通过LC–MS/MS进行从头测序。
Tortoise Oligopeptides Augment Cyclophosphamide's Antitumor Activity Through Dual Modulation of Therapeutic Efficacy and Hematologic Toxicity.
包含体外肽组学及分子对接、非荷瘤小鼠剂量效应、荷瘤小鼠疗效评估、FMT因果验证等多层级实验。
KM小鼠CTX诱导白细胞减少模型 S180荷瘤小鼠模型 粪便微生物群移植(FMT)受体小鼠模型
TOPs给药剂量:0.12、0.24、0.48 g/mL,每日灌胃1 mL/100 g体重 CTX给药方案:80 mg/kg腹腔注射,连续3天 S180细胞接种量:2×10^6细胞(200 μL生理盐水) FMT供体选择:TCTX和THD组,受体预处理抗生素鸡尾酒1周 样本采集时间:首次CTX注射后10天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并表征由三种食用龟肉混合制备的寡肽产物,确定其分子量、肽长度及氨基酸组成等特性。
以1:1:1比例混合三龟种肉,经蒸煮、酶解、过滤、浓缩、喷雾干燥和冷冻干燥等步骤制备TOPs;进行营养成分分析和氨基酸组成测定;通过LC–MS/MS进行从头测序。
从TOPs中筛选潜在的抗肿瘤肽,并评估其与关键肿瘤靶点的结合亲和力。
使用TriNet预测肽的抗癌活性,PeptideRanker评分(阈值≥0.8)筛选生物活性肽;对高含量肽与BCL-2、MDM2、EGFR进行CABS-dock分子对接模拟。
评估TOPs对CTX诱导的白细胞减少症的缓解作用及其剂量依赖性。
KM小鼠分组(NC, MC, LD, MD, HD)灌胃TOPs或生理盐水30天,随后除NC外腹腔注射CTX(80mg/kg×3天),10天后采集样本检测血常规、免疫器官指数和病理。
评估TOPs联合CTX对S180荷瘤小鼠的抗肿瘤效果及对白细胞减少的改善。
KM小鼠分组(TMC, TCTX, THD),灌胃TOPs(高剂量)或生理盐水30天后接种S180细胞,随后CTX处理,监测肿瘤体积、最终肿瘤重量、抑瘤率及血液学参数。
验证肠道菌群在TOPs介导的骨髓保护及抗肿瘤作用中的因果作用。
受体小鼠用抗生素鸡尾酒预处理1周清除肠道菌群,然后接受来自TCTX或THD组供体的粪便悬浮液灌胃30天,随后进行S180接种和CTX处理,评估血液学参数和肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 环磷酰胺(安道生) | AstraZeneca | HJ20160467 |
| 细胞系 | S-180肿瘤细胞 | Procell | CL-0201 |
| 肽制备 | 木瓜蛋白酶 | -- | -- |
| LC-MS/MS样品制备 | DL-二硫苏糖醇 | -- | -- |
| LC-MS/MS分析 | Q Exactive四极杆-静电场轨道阱质谱仪 | ThermoFisher Scientific | -- |
| 血清检测 | IL-4 ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 血细胞分析 | BC-2800ve | Mindray | -- |
| FMT | 甲硝唑 | Sichuan Kelun Pharmaceutical Co. Ltd. | -- |
| 新霉素 | Hefei Dubang Biopharmaceutical Co. Ltd. | -- | |
| 万古霉素 | Hainan Poly Pharm. Co. Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| TOPs制备 | 原料比例、酶解条件(料水比、pH、温度、时间、酶量) 阅读提示:Methods 2.2 制备过程 |
| 非荷瘤小鼠实验 | 动物品系、周龄、分组、给药剂量、CTX剂量、给药途径、时间点 阅读提示:Methods 2.7 和图1a |
| 荷瘤小鼠实验 | S180细胞接种量、CTX剂量和方案、TOPs剂量、分组 阅读提示:Methods 2.8 和图1b |
| FMT实验 | 供体选择、受体预处理抗生素方案、粪便悬浮液制备和灌胃量 阅读提示:Methods 2.9 和图1c |
| 血清细胞因子检测 | ELISA试剂盒品牌、检测指标 阅读提示:Methods 2.14 |