建立体内模型验证PJ34对内膜增生的影响
探究PARP1抑制剂PJ34是否改善FA导丝损伤诱导的小鼠内膜增生。
对C57BL/6J小鼠实施FA导丝损伤,分为对照、损伤、损伤+溶剂、损伤+PJ34低剂量、损伤+PJ34高剂量组,给予PJ34或溶剂处理4周,HE染色评估新内膜面积和内膜/中膜比,免疫组化检测α-SMA和PCNA。
PARP1 contributes to intimal hyperplasia by regulating METTL3-mediated m6A methylation of TRAIL.
包含体内股动脉导丝损伤模型和体外PDGF-BB刺激的VSMC实验,结合MeRIP、RNA稳定性、过表达/敲低及TRAIL敲除小鼠等验证,证据层级丰富。
股动脉导丝损伤诱导的C57BL/6J小鼠IH模型 PDGF-BB刺激的小鼠主动脉VSMCs (ATCC CRL-2797) TRAIL基因敲除小鼠 (C57BL/6Smoc背景)
PJ34剂量:低剂量5 mg/kg,高剂量10 mg/kg,腹腔注射,每周两次,持续4周 小鼠股动脉导丝损伤模型:0.38 mm弹簧丝插入髂动脉1分钟,4周后分析 体外PJ34处理浓度:0.2 nM,处理12小时,PDGF-BB刺激浓度20 ng/ml,处理12小时 METTL3敲低效率:si-METTL3#2用于功能实验 TRAIL mRNA稳定性:放线菌素D (5 mg/ml)处理,检测0, 2, 4, 8小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究PARP1抑制剂PJ34是否改善FA导丝损伤诱导的小鼠内膜增生。
对C57BL/6J小鼠实施FA导丝损伤,分为对照、损伤、损伤+溶剂、损伤+PJ34低剂量、损伤+PJ34高剂量组,给予PJ34或溶剂处理4周,HE染色评估新内膜面积和内膜/中膜比,免疫组化检测α-SMA和PCNA。
验证PJ34是否通过调节m6A甲基化修饰发挥作用。
提取损伤动脉内膜组织RNA,通过dot blot检测整体m6A水平,RT-qPCR检测m6A相关酶(METTL3、METTL14、WTAP、FTO、ALKBH5)的mRNA水平,免疫组化检测METTL3蛋白表达。
探究PJ34对PDGF-BB刺激的小鼠VSMC增殖和迁移的影响,并验证METTL3的介导作用。
使用小鼠主动脉VSMCs,分组包括对照、PDGF-BB+溶剂、PDGF-BB+PJ34、PDGF-BB+PJ34+METTL3过表达,通过CCK-8、EdU、transwell迁移和Western blot检测MMP2/MMP9。
验证METTL3是PJ34发挥作用的必要靶点。
使用siRNA敲低METTL3,分组包括si-NC+溶剂、si-NC+PJ34、si-METTL3+溶剂、si-METTL3+PJ34,在PDGF-BB刺激下检测细胞活力、增殖、迁移及MMP2/MMP9蛋白和整体m6A水平。
阐明PJ34通过METTL3调控TRAIL mRNA的m6A甲基化及稳定性的机制。
利用SRAMP预测TRAIL mRNA的m6A位点,MeRIP实验检测TRAIL mRNA的m6A水平,RT-qPCR检测TRAIL mRNA水平,放线菌素D实验检测mRNA稳定性。
验证TRAIL是METTL3下游的关键效应分子。
在METTL3敲低细胞中过表达TRAIL,分组包括对照、PDGF-BB+si-NC、PDGF-BB+si-METTL3、PDGF-BB+si-METTL3+TRAIL,检测细胞活力、增殖、迁移及MMP2/MMP9蛋白。
验证TRAIL是PJ34在体内发挥保护作用的必要下游基因。
使用TRAIL KO和WT小鼠,分为未损伤组和损伤组,给予PJ34或溶剂处理,HE染色评估内膜增生,RT-qPCR和Western blot检测TRAIL表达,IHC检测TRAIL定位,ELISA检测血浆炎症因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 异氟烷 | -- | -- |
| PJ34 | Invivochem | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | ATCC | 30-2002 |
| 胎牛血清 | Gibco, Thermo | A5670801 | |
| G-418 | Procell | PB180125 | |
| 药物处理 | PDGF-BB | MCE | HY-P7087 |
| 二甲基亚砜 | Sangon | A100231 | |
| 转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen, Thermo | 13778150 |
| pcDNA3.1(+)质粒 | Invitrogen, Thermo | V79020 | |
| ViaFect转染试剂 | Promega | E4982 | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Sangon | B610409 |
| DNase I | Thermo | EN0521 | |
| Dot blot | 硝酸纤维素膜 | GE Healthcare | RPN303B |
| 抗m6A抗体 | Abcam | ab151230 | |
| 二抗 | Abcam | ab97051 | |
| 亚甲蓝 | Sangon | A416886 | |
| RT-qPCR | HiScript III RT SuperMix qPCR预混液(含gDNA去除剂) | Vazyme | R323 |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme | R331 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Sangon | E606335 |
| 细胞增殖检测 | BeyoClick EdU-488细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| 增强免疫染色通透液 | Beyotime | P0097 | |
| DAPI | Beyotime | C1005 | |
| 细胞迁移检测 | 结晶紫 | Sangon | A600331 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013 |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP78 | |
| 抗METTL3抗体 | Abcam | ab195352 | |
| 抗MMP2抗体 | FineTest | FNab05238 | |
| 抗MMP9抗体 | FineTest | FNab05247 | |
| 抗TRAIL抗体 | BosterBio | A00466-1 | |
| 抗β-actin抗体 | FineTest | FNab00869 | |
| 化学发光底物 | Millipore | WBKLS0500 | |
| ECL成像仪(Tanon-5200 Multi) | Tanon | -- | |
| MeRIP | riboMeRIP m6A转录组分析试剂盒 | RiboBio | R11096.3 |
| 组织学染色 | 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 过氧化氢 | -- | -- | |
| DAB底物 | -- | -- | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | -- | -- |
| IL-6 ELISA试剂盒 | -- | -- | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 小鼠主动脉血管平滑肌细胞 | ATCC | CRL-2797 |
| 转染 | si-METTL3#1 | Tsingke | -- |
| si-METTL3#2 | Tsingke | -- | |
| si-METTL3#3 | Tsingke | -- | |
| 显微镜成像 | 徕卡显微镜 | Leica | -- |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Nikon | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | NIH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、性别;FA导丝损伤操作细节(弹簧丝直径、插入时间);PJ34剂量(5或10 mg/kg)、给药途径(腹腔)、频率(每周两次)、持续时间(4周) 阅读提示:Materials and methods: 'FA wire injury model and groupings' |
| 细胞培养与处理 | VSMC细胞系(ATCC CRL-2797)、培养基(DMEM+10%FBS+0.2mg/ml G-418);PJ34浓度(0.2 nM)、处理时间(12小时);PDGF-BB浓度(20 ng/ml)、刺激时间(12小时) 阅读提示:Materials and methods: 'Cell culture' |
| METTL3敲低与过表达 | siRNA序列(si-METTL3#1、#2、#3)及转染试剂(Lipofectamine RNAiMAX);METTL3过表达质粒(pcDNA3.1)及转染试剂(ViaFect) 阅读提示:Materials and methods: 'RNA interference and plasmid transfection' |
| m6A检测 | Dot blot实验步骤:RNA上样量、抗体稀释度(1:5000)、染料(0.02%亚甲蓝);MeRIP实验:RNA用量(100 μg)、抗体量(5 μg) 阅读提示:Materials and methods: 'Dot blot assay' and 'Methylated RNA immunoprecipitation (MeRIP)' |
| 细胞功能检测 | CCK-8实验细胞数(5×10^3细胞/孔)、孵育时间;EdU实验试剂用量;Transwell实验细胞数(2×10^4)、迁移时间(24小时) 阅读提示:Materials and methods: 'Cell viability analysis', 'Cell proliferation analysis', 'Cell migration analysis' |
| 统计方法 | 数据表示(mean±SEM)、正态性检验(Shapiro-Wilk)、ANOVA类型、事后检验(Tukey) 阅读提示:Materials and methods: 'Statistical analysis' |