临床样本与细胞系中GLIS2表达分析
评估GLIS2在胃癌组织及细胞系中的表达水平及其与预后的关系
收集18对胃癌及癌旁组织,提取RNA和蛋白,使用RT-qPCR和Western blot检测GLIS2表达;通过UALAN数据库和Kaplan-Meier分析预测GLIS2表达和预后关联;在胃癌细胞系MKN74、MKN1、KATO-III、AGS和SNU-16中检测GLIS2表达
GLIS2 Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition and Gastric Cancer Progression by Regulating BGN to Activate the Wnt/β-Catenin Pathway.
研究包含患者组织样本、细胞系模型及多种功能实验(CCK-8、EdU、划痕、Transwell),通过ChIP和双荧光素酶验证机制,但缺乏体内实验验证。
胃癌细胞系MKN74和MKN1 胃癌细胞系AGS 胃癌患者组织样本(18对) 293T细胞
GLIS2敲低和过表达效率通过RT-qPCR和Western blot验证 Wnt/β-catenin通路激活剂CHIR-99021(10 μM)和抑制剂XAV-939(10 μM)的处理浓度及时间 ChIP实验验证GLIS2与BGN启动子结合 双荧光素酶报告基因实验验证GLIS2与BGN启动子结合 18对胃癌及癌旁组织样本
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GLIS2在胃癌组织及细胞系中的表达水平及其与预后的关系
收集18对胃癌及癌旁组织,提取RNA和蛋白,使用RT-qPCR和Western blot检测GLIS2表达;通过UALAN数据库和Kaplan-Meier分析预测GLIS2表达和预后关联;在胃癌细胞系MKN74、MKN1、KATO-III、AGS和SNU-16中检测GLIS2表达
确定GLIS2对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和EMT的影响
在MKN74和MKN1细胞中敲低GLIS2,在AGS细胞中过表达GLIS2,通过CCK-8、EdU、划痕愈合、Transwell和Western blot检测细胞活力、增殖、迁移、侵袭及EMT标志物表达
验证GLIS2是否通过激活Wnt/β-catenin通路促进GC进展
在GLIS2敲低细胞中添加Wnt/β-catenin激活剂CHIR-99021,通过Western blot检测Wnt/β-catenin通路蛋白表达,并评估细胞功能变化
验证GLIS2是否直接结合BGN启动子并增强其转录
通过GEPIA数据库分析GLIS2与BGN表达相关性;在GLIS2敲低细胞中检测BGN表达;使用ChIP和双荧光素酶报告基因实验验证GLIS2与BGN启动子的结合
确认BGN和Wnt/β-catenin通路在GLIS2下游的作用
在GLIS2敲低细胞中过表达BGN并添加Wnt/β-catenin抑制剂XAV-939,检测Wnt/β-catenin通路蛋白表达及细胞功能变化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | 11,875,093 |
| 青霉素/链霉素 | Biotech | C0222 | |
| 胎牛血清 | Gibco | 10,099,141 | |
| IMDM培养基 | Procell | PM150510 | |
| Ham's F-12培养基 | Procell | PM150810 | |
| GES-1细胞系 | Sunncell | SNL-304 | |
| MKN74细胞系 | Procell | CL-0730 | |
| MKN1细胞系 | Procell | CL-0982 | |
| KATO-III细胞系 | Procell | CL-0372 | |
| AGS细胞系 | Procell | CL-0022 | |
| SNU-16细胞系 | Biotechnology | C6870 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11,668,030 |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | 2,537,156 | |
| 药物处理 | XAV-939 | Selleck | S1180 |
| CHIR-99021 | Selleck | S1263 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Biotech | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | Biotech | P1006 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Biotech | P0011 | |
| ECL显色液 | Biotech | P0018S | |
| GLIS2抗体 | Thermo Fisher | PA5-72849 | |
| E-钙黏蛋白抗体 | CST | #3195 | |
| Claudin-1抗体 | CST | #4933 | |
| ZEB1抗体 | CST | #3396 | |
| Slug抗体 | CST | #9585 | |
| Snail抗体 | CST | #3879 | |
| WNT1抗体 | Abcam | ab15251 | |
| β-catenin抗体 | CST | #9562 | |
| p-β-catenin抗体 | CST | #4176 | |
| c-MYC抗体 | CST | #9402 | |
| Cyclin D1抗体 | CST | #55506 | |
| BGN抗体 | Abcam | ab109369 | |
| HRP偶联的抗兔IgG | CST | #7074 | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | 1,708,195 | |
| RT-qPCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| 逆转录试剂盒 | Takara | RR037A | |
| TB Green试剂盒 | Takara | RR420A | |
| 实时荧光定量PCR仪 | Roche | LightCycler96 | |
| CCK-8 | CCK-8试剂盒 | Biotech | C0039 |
| 酶标仪 | Dynex | MRX II | |
| EdU | Triton X-100 | Biotech | P0096 |
| BeyoClick EdU试剂盒 | Biotech | C0071S | |
| DAPI染色液 | Biotech | C1002 | |
| Transwell | 基质胶 | Biotech | C0372 |
| Transwell小室 | Biotech | FTW061 | |
| 结晶紫 | Biotech | C0121 | |
| ChIP | ChIP试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| GLIS2抗体(ChIP级) | GeneTex | GTX32148 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pmirGLO载体 | Youbia | VT1439 |
| 双荧光素酶报告基因试剂盒 | Biotech | RG027 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 18对胃癌及癌旁组织,患者未接受全身放疗或化疗 阅读提示:Materials and Methods 2.1 |
| 细胞培养 | 细胞系、培养基、血清浓度、培养条件等 阅读提示:Materials and Methods 2.2 |
| 细胞转染和处理 | 质粒转染、药物处理浓度和时间等 阅读提示:Materials and Methods 2.3 |
| Western blot分析 | 抗体稀释比、孵育条件等 阅读提示:Materials and Methods 2.4 |
| RT-qPCR | 引物序列、试剂等 阅读提示:Materials and Methods 2.5 |
| ChIP实验 | 抗体、裂解、超声破碎等条件 阅读提示:Materials and Methods 2.10 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 报告质粒构建、转染、检测等 阅读提示:Materials and Methods 2.11 |