网络药理学分析
鉴定SJZT的活性成分、潜在靶点及与HN相关的关键靶点和通路。
从TCMSP等数据库获取SJZT活性成分和靶点,与HN靶点取交集,构建网络,进行GO和KEGG富集分析。
Integrated network pharmacology and experimental validation to investigate the therapeutic effects and mechanisms of SJZT on hypertensive nephropathy.
包含网络药理学分析、分子对接、Ang II诱导HN小鼠模型、体外原代肾成纤维细胞实验,并进行了功能验证和机制验证。
Ang II诱导的HN小鼠模型(BALB/c小鼠) 原代小鼠肾成纤维细胞
Ang II渗透压泵给药剂量:1500 ng/kg/min SJZT给药剂量:低剂量7.8 g/kg/天,高剂量15.6 g/kg/天,灌胃给药 小鼠模型周期:28天 体外实验Ang II处理浓度:10 μM SJZT含药血清浓度:15%用于机制实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定SJZT的活性成分、潜在靶点及与HN相关的关键靶点和通路。
从TCMSP等数据库获取SJZT活性成分和靶点,与HN靶点取交集,构建网络,进行GO和KEGG富集分析。
验证核心活性成分与关键靶点PPARγ的结合亲和力。
使用AutoDock Vina进行分子对接,计算结合能。
评估SJZT对Ang II诱导HN小鼠模型的肾损伤和纤维化的改善作用。
建立Ang II诱导HN小鼠模型,给予不同剂量SJZT,检测血压、尿蛋白、Scr、BUN,并进行Masson染色和Western blot检测纤维化指标。
验证SJZT对Ang II诱导的肾成纤维细胞活化的抑制作用。
使用小鼠肾成纤维细胞,Ang II处理,加入SJZT含药血清,检测细胞活力(CCK-8)、α-SMA和Collagen I表达。
验证SJZT是否通过激活自噬抑制成纤维细胞活化。
使用自噬抑制剂CQ,检测LC3II/LC3I、p62水平,观察自噬流(GFP-LC3),并评估细胞活力和蛋白表达变化。
验证SJZT是否通过PPARγ激活自噬。
使用PPARγ抑制剂GW9662,检测PPARγ表达、自噬相关蛋白和纤维化指标,评估细胞活力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 中药制备 | 人参 | Liaoning Chaohong Ginseng Industry Co., Ltd. | 20230407 |
| 白术 | Quzhou Nankong Traditional Chinese Medicine Co., Ltd. | 2307019 | |
| 茯苓 | Quzhou Nankong Traditional Chinese Medicine Co., Ltd. | 23031001 | |
| 甘草 | Quzhou Nankong Traditional Chinese Medicine Co., Ltd. | 20230909 | |
| LC-MS/MS分析 | 超高效液相色谱系统 | Vanquish, Thermo Fisher Scientific | -- |
| C18色谱柱 | Phenomenex Kinetex | -- | |
| Orbitrap Exploris 120质谱仪 | Thermo | -- | |
| 血液生化检测 | 尿素氮试剂盒 | mlbio | ml076479 |
| 肌酐试剂盒 | mlbio | ml037726 | |
| 尿蛋白试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C035-2-1 | |
| Masson染色 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1340 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Procell | PCK010 |
| 胎牛血清 | Procell | 164210-500 | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Procell | PB180120 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012S | |
| α-SMA抗体 | Affinity | AF1032 | |
| LC3抗体 | Affinity | AF5402 | |
| p62抗体 | Affinity | AF5384 | |
| Collagen I抗体 | Affinity | AF7001 | |
| PPARγ抗体 | Affinity | AF6284 | |
| GAPDH抗体 | Affinity | AF7021 | |
| HRP标记二抗 | Boster | BA1054 | |
| ECL化学发光试剂 | Beyotime | P0018 | |
| 蛋白表达分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 细胞实验 | 血管紧张素II | aladdin | A424039 |
| 氯喹 | macklin | C843545 | |
| GW9662 | aladdin | G407990 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | MCE | HY-K0301 |
| 自噬检测 | Ad-mCherry-GFP-LC3B腺病毒 | Beyotime | C3011 |
| DAPI染料 | Yeasen | 40728ES03 | |
| 显微镜观察 | 共聚焦激光荧光显微镜 | Olympus | FV3000 |
| 血压测量 | 无创尾套血压测量系统 | Softron Biotechnology | BP-2010 A |
| 组织学观察 | 显微镜 | Olympus | BX53 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 网络药理学分析 | 活性成分筛选阈值:OB≥30%,DL≥0.18,HL>4;HN靶点数据库来源;拓扑参数筛选标准。 阅读提示:见2.1节,表1、表2 |
| 分子对接 | PPARγ晶体结构PDB ID;活性成分3D结构来源;对接软件版本和参数。 阅读提示:见2.1.6节 |
| Ang II诱导HN小鼠模型 | 小鼠品系、性别、周龄;Ang II渗透压泵剂量;SJZT给药剂量和方式;实验周期。 阅读提示:见2.2.3节 |
| SJZT含药血清制备 | 动物品系、周龄;给药剂量(78 g/kg);给药方案;采血时间。 阅读提示:见2.2.6节 |
| 体外细胞实验 | 细胞类型和来源;Ang II浓度;SJZT含药血清浓度;处理时间;检测指标。 阅读提示:见2.2.7-2.2.10节 |
| Western blot | 蛋白上样量;一抗稀释比例;二抗稀释比例;曝光时间。 阅读提示:见2.2.8节 |