体外抗病毒活性验证
评估依鲁替尼在多种细胞系中对VACV复制的抑制作用。
在HeLa、A549、THP-1、HFF细胞中,分别以3或0.01 pfu/cell感染VACV-WR,同时加入不同浓度依鲁替尼(0.5-20 μM),DMSO作对照;感染后24或48小时收获病毒,通过空斑实验测定滴度,并利用MTT法检测细胞活力。
Ibrutinib inhibits the replication of multiple poxviruses by targeting the Bruton tyrosine kinase.
包含体外多种细胞系实验、体内小鼠模型、机制研究(DNA复制、蛋白质合成、BTK磷酸化与核转位)、基因敲低/过表达及突变体验证。
HeLa细胞 A549细胞 BALB/c小鼠 HFF细胞
依鲁替尼浓度(0.5-20 μM)和MOI(3或0.01 pfu/cell) BTK siRNA敲低(80 nM)和BTK过表达(0.1-1 μg质粒) BTK突变体(Y223F、C481Y、Y551F)影响病毒复制 小鼠感染剂量(2×10^4 pfu VACV-WR)和依鲁替尼给药剂量(0.625-2.5 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估依鲁替尼在多种细胞系中对VACV复制的抑制作用。
在HeLa、A549、THP-1、HFF细胞中,分别以3或0.01 pfu/cell感染VACV-WR,同时加入不同浓度依鲁替尼(0.5-20 μM),DMSO作对照;感染后24或48小时收获病毒,通过空斑实验测定滴度,并利用MTT法检测细胞活力。
检测依鲁替尼对其他DNA病毒和RNA病毒的抑制作用。
使用MPXV、MVA、LSDV、HSV-1和VSV感染相应细胞(HeLa、DF-1、MDBK、Vero),加入不同浓度依鲁替尼,24或48小时后通过空斑实验或TCID50测定病毒滴度,并评估细胞活力。
确定依鲁替尼作用于病毒复制的哪个阶段。
通过时间添加实验、qPCR检测病毒DNA和mRNA、Western blot检测病毒蛋白合成来评估依鲁替尼的影响,并用AraC作为阳性对照。
评估依鲁替尼对VACV感染小鼠的保护作用。
BALB/c小鼠经鼻内感染VACV-WR(2×10^4 pfu),每日给予依鲁替尼(0.625、1.25、2.5 mg/kg)或PBS,监测生存率和体重变化;感染后第5天测定各器官病毒载量,第2天进行肺组织H&E和免疫组化分析。
验证BTK在痘病毒复制中的作用。
通过siRNA敲低或质粒过表达BTK,或使用CRISPR-Cas9敲除BTK,然后感染VACV或MPXV,检测病毒蛋白合成和病毒滴度。
检测VACV感染是否诱导BTK磷酸化,并确定关键位点对促病毒功能的影响。
感染后检测p-BTK水平;将BTK野生型和突变体转染至BTK-KO细胞,检测病毒DNA、病毒产量和蛋白表达。
观察VACV感染是否引起BTK核转位及其机制。
使用共聚焦显微镜和细胞核质分离实验检测BTK的定位,并比较BTK突变体(Y223F、Y551F)的定位差异。
探究依鲁替尼是否通过BTK调节I型干扰素反应。
HFF细胞敲低BTK或过表达BTK,感染WR-ΔE3,检测IFN-α、IFN-β及ISG表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 依鲁替尼 | Selleck | S2680 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Solarbio | -- |
| 胎牛血清 | BI | 04-001-1ACS | |
| 细胞活力 | MTT检测试剂盒 | Solarbio | M1020 |
| 蛋白质印迹 | SDS裂解液 | Beyotime | -- |
| PMSF | Beyotime | -- | |
| FastPAGE预制胶 | Tsingke Biotechnology | -- | |
| Trans-Blot Turbo转印系统 | Bio-Rad | -- | |
| SuperSignal West Dura底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DNA/RNA提取 | QIAamp DNA Blood迷你试剂盒 | Qiagen | 51104 |
| RNA提取 | RNAprep纯细胞/细菌试剂盒 | TIANGEN | DP430 |
| 逆转录 | 第一链cDNA合成SuperMix | TransGen | AE301-03 |
| qPCR | TOROGreen qPCR预混液 | -- | -- |
| 共聚焦显微镜 | ProLong Diamond抗淬灭剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 核质分离 | 核质分离试剂盒 | Beyotime | P0027 |
| 流式细胞术 | Hoechst染料 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外抗病毒实验 | 细胞系、MOI(3或0.01 pfu/cell)、依鲁替尼浓度(0.5-20 μM)、感染时间(24或48 hpi)、病毒滴定方法 阅读提示:Methods: Viral infection and titration; Figure legends 1 |
| 体内实验 | 小鼠品系和性别(7-8周龄雌性BALB/c)、感染剂量(2×10^4 pfu)、依鲁替尼剂量(0.625-2.5 mg/kg)、给药途径(鼻内)、监测时间和终点 阅读提示:Materials and Methods: In vivo anti-VACV-WR activity of ibrutinib; Figure 4 |
| BTK调控实验 | siRNA浓度(80 nM)、过表达质粒剂量(0.1-1 μg)、转染时间(24或48 h)、感染MOI和时长 阅读提示:Materials and Methods: BTK knockdown and overexpression; Figure 5 |
| 机制研究 | 时间点(2,8 hpi)用于DNA和mRNA检测;病毒蛋白检测时间(2或8 hpi);AraC浓度(40 μg/mL) 阅读提示:Results: Ibrutinib targets viral DNA replication; Figure 3 |
| 干扰素反应实验 | 细胞系(HFF)、感染MOI(0.01或3 pfu/cell)、感染时间(0-24 h)、依鲁替尼浓度(10 μM)、siRNA和质粒转染条件 阅读提示:Results: Ibrutinib treatment primes the type I interferon response; Figure 8 |