临床样本分析
评估VEN+HMA治疗对AML患者肿瘤负荷、造血恢复、淋巴细胞亚群及细胞因子水平的影响。
收集34例初诊AML患者接受VEN+HMA治疗和11例接受HMA单药治疗的临床数据,分析治疗前后骨髓原始细胞比例、MRD、血细胞计数、外周血淋巴细胞亚群比例及12种细胞因子水平,并进行生存分析。
BCL-2 Inhibitor Regulates Number, Function, and Antitumor Immunity of T Cells by Influencing Glycolysis in AML.
研究包含临床样本分析、体外细胞实验、DIA蛋白质组学、动物模型(PBMC人源化AML小鼠模型)等多个独立证据层级,并包含功能验证(如杀伤实验)和机制验证(糖酵解通路分析)。
THP-1和HL-60细胞系 CD4+ T细胞和CD8+ T细胞 PBMC人源化AML小鼠模型(皮下移植瘤和尾静脉注射) 初诊AML患者临床样本
VEN处理浓度和时间:0.05-6.4 μmol/L处理24-72小时 T细胞分选纯度和活化条件:CD3/CD28 activator,IL-2 体内模型构建:THP-1细胞注射数量(1×10^7皮下,5×10^6尾静脉),PBMC注射量 VEN给药方案:50 mg/kg/day,口服,连续7天 T细胞与AML细胞共培养条件:Transwell chamber,0.4 μm孔径
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估VEN+HMA治疗对AML患者肿瘤负荷、造血恢复、淋巴细胞亚群及细胞因子水平的影响。
收集34例初诊AML患者接受VEN+HMA治疗和11例接受HMA单药治疗的临床数据,分析治疗前后骨髓原始细胞比例、MRD、血细胞计数、外周血淋巴细胞亚群比例及12种细胞因子水平,并进行生存分析。
验证VEN对AML细胞系的直接促凋亡作用及敏感性差异。
使用CCK-8法检测VEN对THP-1和HL-60细胞的IC50值,用Calcein-AM/PI染色和流式细胞术检测凋亡,并用Western blot检测凋亡相关蛋白表达。
探究VEN对T细胞数量、凋亡、活化、记忆分化和分泌功能的影响。
从初诊AML患者PBMC中分选CD4+和CD8+ T细胞,用VEN处理后检测细胞活力、凋亡、活化标志物(CD25、CD38、CD69)、记忆亚群(CD45RO/CD45RA)、细胞因子分泌(CBA)及穿孔素/颗粒酶B分泌(ELISA)。
在PBMC人源化AML小鼠模型中验证VEN对T细胞数量、活化、PD-1表达和抗肿瘤免疫反应的影响。
构建皮下移植瘤和尾静脉注射两种AML小鼠模型,分为空白对照、VEN、PBMC、PBMC+VEN四组,检测外周血T细胞亚群、CD34+细胞比例、细胞因子水平、肿瘤体积及ALDOA表达。
探究VEN通过调控T细胞糖酵解来影响其数量、功能和抗肿瘤免疫的分子机制。
使用DIA蛋白质组学分析VEN处理前后T细胞的蛋白表达变化,发现ALDOA上调;随后通过qRT-PCR、Western blot和IHC验证ALDOA表达;检测糖酵解关键酶(HK2、PFKP、PKM2)表达和细胞内丙酮酸含量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PBMC分离 | 淋巴细胞分离液 | Tianjin Hao Yang Hua Ke Biotechnology Co. Ltd. | LTS10771 |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | ThermoFisher Scientific | 70011044 |
| RPMI-1640培养基 | Tianjin Hao Yang Hua Ke Biotechnology Co. Ltd. | HY1640 | |
| 胎牛血清 | ABW | AB-FBS-0060S | |
| L-谷氨酰胺 | Merck Life Sciences Co. Ltd. | G7513 | |
| 链霉素-青霉素 | Merck Life Sciences Co. Ltd. | P4333 | |
| 动物实验 | 维奈克拉 | Selleck | S8048 |
| T细胞分选 | EasySep人CD4阳性分选试剂盒II | StemCell | 18052 |
| EasySep人CD8阳性分选试剂盒II | StemCell | 18053 | |
| T细胞培养 | ImmunoCult-XF T细胞扩增培养基 | StemCell | 10981 |
| T细胞活化 | 人CD3/CD28 T细胞活化剂 | StemCell | 10971 |
| T细胞培养 | 白细胞介素-2 | -- | -- |
| 细胞共培养 | Transwell小室(0.4 μm) | Corning | CLS3412 |
| 细胞活力检测 | CCK-8溶液 | ABMOLE | M4839 |
| 细胞凋亡检测 | 钙黄绿素-AM | Biosharp | -- |
| 碘化丙啶 | Biosharp | -- | |
| 流式分析 | CD45/CD3/CD4/CD8多色抗体 | BD Bioscience | 340491 |
| CD45/CD3/CD16+CD56/CD19多色抗体 | BD Bioscience | 340500 | |
| CD4/CD25/FOXP3多色抗体 | BD Bioscience | 560131 | |
| 溶血素 | BD Bioscience | 349202 | |
| CD45/CD3/CD4/CD8抗体(小鼠) | BD Bioscience | 662965 | |
| CD3抗体 | BD Bioscience | 555342 | |
| CD4抗体 | BD Bioscience | 555346 | |
| CD8抗体 | BD Bioscience | 555635 | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD凋亡试剂盒 | Multi Sciences | AP105 |
| 流式分析 | PD-1抗体 | BD Bioscience | 561273 |
| CD3抗体(活化) | BD Bioscience | 341090 | |
| CD8抗体(活化) | BD Bioscience | 560662 | |
| CD25抗体 | BD Bioscience | 340938 | |
| CD38抗体 | BD Bioscience | 340439 | |
| CD69抗体 | BD Bioscience | 560968 | |
| CD4抗体(亚群) | BD Bioscience | 560649 | |
| CD45RO抗体 | BD Bioscience | 347967 | |
| CD45RA抗体 | BD Bioscience | 347723 | |
| CD45抗体(CD45+/CD34+) | BD Bioscience | 340943 | |
| CD34抗体 | BD Bioscience | 400381 | |
| 细胞因子检测 | 人12种细胞因子检测试剂盒 | Hangzhou Sage Biotechnology Co. | P010100403 |
| ELISA | 穿孔素ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme Linked Biotechnology Co. Ltd. | ml063483 |
| 颗粒酶B ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme Linked Biotechnology Co. Ltd. | ml060098 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche | 04693132001 | |
| Bio-Rad蛋白定量试剂 | Bio-Rad | 23227 | |
| PVDF膜 | GE | 10600023 | |
| QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0252 | |
| BCL-2抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| BCL-xl抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| MCL-1抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| BAX抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| cleaved-caspase3抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| cleaved-caspase7抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| ALDOA抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| HK2抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| PFKP抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| PKM2抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| GAPDH抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| β-tubulin抗体 | Wuhan Sanying Biotechnology Co. Ltd. | -- | |
| 二抗(抗兔) | Beyotime | A0208 | |
| 二抗(抗小鼠) | Beyotime | A0216 | |
| ECL检测试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| qRT-PCR | Servicebio SweScript All-In-One 第一链cDNA合成SuperMix | Servicebio | G3337 |
| 2× SYBR Green qPCR Master Mix (Low ROX) | Servicebio | G3321 | |
| ThermoFisher 7500实时荧光定量PCR系统 | ThermoFisher | -- | |
| 免疫组织化学 | UltraSensitive SP免疫组化试剂盒 | Maixin Biotechnology | -- |
| ALDOA一抗(IHC) | -- | -- | |
| Pannoramic MIDI病理切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- | |
| 仪器 | 酶标仪 | Tecan | -- |
| 倒置荧光显微镜 | Olympus | IX53 | |
| 流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| 流式细胞仪(BECKMAN CytoFLEX) | BECKMAN | -- | |
| 动物实验 | 体内生物发光成像系统 | Biospace Lab | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者纳入标准(2022 ELN指南),VEN+HMA组和HMA组样本量,治疗周期数(至少1周期),MRD检测方法(流式细胞术),淋巴细胞亚群和细胞因子检测时间点 阅读提示:Materials and Methods 2.1 Patient Samples, Results 3.1, Figure 1 |
| VEN对AML细胞杀伤实验 | VEN处理浓度范围(THP-1: 0.05-6.4 μmol/L;HL-60: 2-16 μmol/L),处理时间(24, 48, 72小时),细胞接种密度(5.0×10^4 cells/well),凋亡检测方法(Calcein-AM/PI和Annexin V) 阅读提示:Materials and Methods 2.6, 2.7, 2.8.3, Results 3.1, Figure 2 |
| T细胞分离与培养 | PBMC分离方法(密度梯度离心),T细胞分选试剂盒(EasySep positive selection),T细胞纯度(>95%,流式验证),培养条件(ImmunoCult-XF培养基,CD3/CD28 activator 25 μL/mL,IL-2 30 IU/mL) 阅读提示:Materials and Methods 2.2, 2.5 |
| VEN对T细胞功能实验 | VEN处理浓度(1, 2 μmol/L或10, 20 μmol/L)和处理时间(24小时),检测指标:凋亡(Annexin V),活化标志物(CD25, CD38, CD69),记忆亚群(CD45RO/CD45RA),细胞因子分泌(CBA和ELISA),PD-1表达 阅读提示:Materials and Methods 2.8.4-2.8.6, 2.9, 2.10, Results 3.4-3.8, Figures 5, 6 |
| 共培养实验 | T细胞预处理(VEN 24小时,洗涤2次去除残余药物),共培养体系(Transwell 0.4 μm),T细胞与THP-1细胞比例,共培养时间,杀伤检测(CCK-8,Calcein-AM/PI,流式凋亡) 阅读提示:Materials and Methods 2.5, Results 3.9, Figure 7 |
| 动物实验 | 小鼠品系和年龄(NCG,3-5周龄),细胞注射数量和途径(皮下:1×10^7 THP-1;尾静脉:5×10^6 THP-1),PBMC人源化(5×10^6 PBMC),分组(n=5/组,4组),VEN给药方案(50 mg/kg/day,口服,7天),检测终点(肿瘤体积,外周血CD45+/CD34+,T细胞亚群,细胞因子) 阅读提示:Materials and Methods 2.4, Results 3.1, 3.9, Figures 2, 7 |
| 糖酵解机制研究 | DIA蛋白质组学参数(p<0.05, FC≥1.2或≤1/1.2),qRT-PCR反应条件(2^-ΔΔCt法),Western blot抗体,丙酮酸检测试剂盒(bc2205)及细胞处理 阅读提示:Materials and Methods 2.11-2.15, Results 3.10, Figure 8 |