检测KDM6B表达
分析KDM6B在CRC组织和细胞中的表达水平
利用TCGA数据库、组织芯片、7对临床样本和多种人/鼠CRC细胞系,通过RT-qPCR、Western blot、免疫组织化学检测KDM6B表达
KDM6B enhances anti-PD-L1 immunotherapy efficacy by increasing CD8+ T-cell infiltration in colorectal cancer.
包含体外细胞功能实验、皮下异种移植和肝转移小鼠模型、免疫组织化学、流式细胞术、ChIP-qPCR及联合治疗实验,涵盖功能验证和机制验证。
HCT116细胞系 CT26细胞系 MC38细胞系 皮下异种移植小鼠模型
KDM6B过表达对CRC细胞增殖、迁移、侵袭及体内肿瘤生长和肝转移的抑制作用 KDM6B过表达对CD8+ T细胞浸润、迁移和活化的增强作用 KDM6B上调PD-L1和CCL5、CXCL9、CXCL10表达,依赖STAT3信号和去甲基化酶活性 帕立骨化醇与抗PD-L1抗体联合治疗的抗肿瘤效果 体外实验中使用10μM STAT3抑制剂处理24小时的条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分析KDM6B在CRC组织和细胞中的表达水平
利用TCGA数据库、组织芯片、7对临床样本和多种人/鼠CRC细胞系,通过RT-qPCR、Western blot、免疫组织化学检测KDM6B表达
验证KDM6B过表达对CRC细胞恶性表型的影响
在HCT116和CT26细胞中稳定过表达KDM6B,进行CCK8活力测定、集落形成、划痕愈合和Transwell迁移实验,并检测Cyclin D1、E-cadherin、N-cadherin表达
验证KDM6B过表达对体内肿瘤生长和转移的影响
通过皮下注射KDM6B过表达的HCT116或CT26细胞建立移植瘤模型,通过脾内注射HCT116细胞建立肝转移模型,测量肿瘤体积、重量和肝转移灶
评估KDM6B过表达对CD8+ T细胞浸润、迁移和活化的影响
使用TIMER数据库分析相关性,免疫组织化学检测CD8,体外趋化实验和流式细胞术检测CD8+ T细胞迁移和IFN-γ产生,RT-qPCR检测趋化因子受体和效应分子
阐明KDM6B调控PD-L1和趋化因子表达的机制
通过GSEA分析JAK/STAT通路,Western blot检测p-STAT3,使用STAT3抑制剂处理,ChIP-qPCR检测H3K27me3在启动子上的富集
验证KDM6B诱导剂帕立骨化醇与抗PD-L1抗体的协同抗肿瘤作用
体外共培养MC38和CTLL-2细胞,体内建立MC38皮下瘤模型,腹腔注射帕立骨化醇和/或抗PD-L1抗体,测量肿瘤体积、重量、消除率及外周血CD8+ T细胞比例
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| RPMI-1640培养基 | Invitrogen | -- | |
| 刀豆蛋白A | Biosharp | -- | |
| 重组鼠IL-2 | Peprotech | -- | |
| 载体构建 | pLV-EF1α-MCS-IRES-Bsd载体 | Addgene | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | TransScript第一链cDNA合成SuperMix试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| qPCR | Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix | Yeasen Biotech | -- |
| ABI 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems Thermo Fisher | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma | -- |
| Pierce™ BCA蛋白检测试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| 抗KDM6B抗体 | Abcam | ab38113 | |
| β-actin抗体 | Abclonal | AC026 | |
| Cyclin D1抗体 | HUABIO | ET1601-31 | |
| E-cadherin抗体 | ABclonal | A1149 | |
| N-cadherin抗体 | CST | 13116 | |
| PD-L1抗体 | ABclonal | A11273 | |
| pSTAT3抗体 | CST | 9145 | |
| STAT3抗体 | CST | 4904 | |
| ECL化学发光试剂盒 | Millipore | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK8溶液 | Beyotime | -- |
| ELISA | IFN-γ ELISA试剂盒 | TONGWEI | TW8439 |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque分离液 | Solarbio | -- |
| T细胞分选 | CD3+ T细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| T细胞激活 | CD3/CD28抗体包被磁珠 | Miltenyi Biotec | -- |
| T细胞迁移 | Transwell可渗透系统(5 μm聚碳酸酯膜) | Costar | -- |
| 流式细胞术 | Fc封闭剂 | BD | 564219 |
| 抗CD8-PE抗体 | Elabscience | E-AB-F1271D | |
| 抗IFN-γ-APC抗体 | Elabscience | E-AB-F1196E | |
| APC抗小鼠CD45抗体 | Elabscience | E-AB-F1136E | |
| FITC抗小鼠CD3抗体 | Elabscience | E-AB-F1013C | |
| PE抗小鼠CD8抗体 | Elabscience | E-AB-F1104D | |
| PE抗人PD-L1抗体(29E.2A3) | Elabscience | -- | |
| PE抗小鼠PD-L1抗体(10F.9G2) | Elabscience | -- | |
| ChIP | EZ-ChIP试剂盒 | Millipore | 17-371 |
| H3K27me3抗体 | Abcam | ab6002 | |
| 正常小鼠IgG | Abcam | ab190475 | |
| 免疫组化 | SP试剂盒 | ZSGB-BIO | -- |
| 动物实验 | 帕立骨化醇 | -- | -- |
| 抗PD-L1抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基、血清浓度、添加因子浓度 阅读提示:Materials and Methods: Cell lines |
| 载体构建和稳定细胞系 | 载体、转染方法、筛选药物浓度 阅读提示:Materials and Methods: Vector construction and establishment of stable cell lines |
| 体外功能实验 | 细胞接种密度、检测时间点、处理条件 阅读提示:Materials and Methods: Cell viability assay, Wound healing assay, Transwell migration assay |
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、性别、接种细胞数量和部位 阅读提示:Materials and Methods: Animal study |
| 联合治疗 | 给药剂量、频率、途径、细胞系和接种数量 阅读提示:Materials and Methods: Animal study (combination therapy experiment) |