结构引导的双特异性抗体工程赋予对KP.3.1.1和sarbecoviruses的广泛保护

Structure-guided bispecific antibody engineering confers broad protection against KP.3.1.1 and sarbecoviruses.

作者信息Yunping Ma, Qianying Liu, Palizhati Rehati, Zhaoyong Zhang, Yingdan Wang, Zhimin Liu, Jiali Chen, Xuezhou Bai, Aihua Hao, Yanqun Wang, Yumei Wen, Zhenguo Chen, Lu Lu, Jincun Zhao, Fan Wu, Lei Sun, Jinghe Huang
PMID40948557
期刊iScience
发布时间2025-07-22
DOI10.1016/j.isci.2025.113175

实验完整度

包含体外假病毒中和实验、活病毒中和实验、冷冻电镜结构解析、位点突变验证及小鼠体内预防和治疗实验,证据层级多样,功能与机制验证完整。

主要模型

HEK 293T细胞 Huh-7细胞 K18-hACE2转基因小鼠 BA.2.86刺突三聚体

重点核对

G7-Fc抗体的scFv配置((scFv)2-Fc格式) G7-Fc对KP.2假病毒的中和活性(IC50为0.18 nM) G7-Fc对EG.5活病毒的中和活性 G7-Fc在hACE2转基因小鼠中的预防和治疗效果(i.p. 200 μg/小鼠,i.n. 20 μg/小鼠) A227S/T和Y229N突变对KP.3.1.1中和活性的恢复

摘要

自然学科;生物科学;生物化学;免疫学;微生物学;病毒学;结构生物学

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
scFv序列排列和位置如何影响双特异性抗体(bsAb)的结构和功能,以及能否通过结构引导设计产生广谱中和抗体来应对SARS-CoV-2变体。
核心机制
G7-Fc通过其两个scFv同时结合刺突三聚体上两个不同且保守的表位,诱导刺突三聚体形成顶端对顶端的二聚体,构象锁定在开放状态,阻断RBD与ACE2的相互作用,从而发挥广谱中和作用。
主要证据
冷冻电镜结构显示BA.2.86刺突三聚体与G7-Fc形成三聚体-二聚体复合物;关键残基突变导致中和活性显著降低(30倍至>4237倍);体内实验中,G7-Fc预防和治疗给药均显著降低EG.5感染小鼠的肺病毒载量。
研究意义
该研究为设计针对SARS-CoV-2变体和sarbecoviruses的有效广谱双特异性抗体提供了结构框架,并展示了利用结构信息快速优化抗体以应对新出现变体的可能性。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

BSAb构建与表征

评估不同scFv配置的bsAb与RBD蛋白的结合亲和力。

使用7F3和GW01构建了四种bsAb(G7-Fc, 7G-Fc, G-Fc-7, 7-Fc-G),通过ELISA和BLI测定其与不同变体RBD的结合能力。

2

中和活性测定

评估四种bsAb对多种假病毒和活病毒的中和效力和广度。

使用22种假病毒(包括SARS-CoV, WIV1, RS3367)进行中和实验,并检测对EG.5活病毒的中和能力。

3

结构解析

解析G7-Fc与BA.2.86刺突三聚体复合物的结构,阐明中和机制。

通过负染电镜和冷冻电镜解析了BA.2.86 S三聚体与G7-Fc的复合物结构,包括整体结构和局部精细结构。

4

表位与关键残基突变验证

验证G7-Fc两个scFv结合的关键残基对中和活性的贡献。

对GW01和7F3表位中的关键残基进行单点突变,并测定G7-Fc对这些突变假病毒的中和活性。

5

结构引导的抗体优化

恢复G7-Fc对KP.3.1.1的中和活性。

基于结构分析,在G7-Fc的7F3 scFv中引入A227S/T和Y229N突变,并检测对KP.3.1.1假病毒的中和活性。

6

体内药效评估

评估G7-Fc对EG.5感染的预防和治疗效果。

在K18-hACE2转基因小鼠中,通过腹腔或鼻内给药,在感染前或感染后24小时给予G7-Fc,48小时后检测肺部病毒载量。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
杜尔贝科改良伊格尔培养基----
胎牛血清----
青霉素-链霉素----
Ez trans转染试剂Life-iLabAC04L092
蛋白G琼脂糖珠Smart-LifesciencesSA020200
Ni琼脂糖高性能介质Cytiva17526801
ABTS溶液Thermo Fisher002024
辣根过氧化物酶标记的山羊抗人IgGJackson ImmunoResearch109-035-098
CD19 PE-Cy7抗体BD Biosciences341113
IgA-APC抗体Jackson ImmunoResearch109-135-011
IgM-PE抗体Jackson ImmunoResearch709-116-073
IgD-FITC抗体BD Biosciences562023
PrimeSTAR HS DNA聚合酶TakaraR010A
一步法PCR克隆试剂盒NOVOProteinNR005
AHC传感器Sartorius18-5060
HisTrap HP亲和层析柱GE Healthcare--
Superose 6 increase 10/300凝胶过滤柱GE Healthcare--
TITAN Krios G4透射电镜Thermo Fisher Scientific--
Falcon 4i相机Thermo Fisher Scientific--
Selectris X成像过滤器Thermo Fisher Scientific--
K18-hACE2-2A-CreERT2 C57BL/6J小鼠CyagenC001244
Huh-7细胞PricellaCL-0120
Freestyle 293F细胞Thermo FisherR79007
HEK 293T细胞ATCCCRL-3216

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
双特异性抗体构建
scFv序列排列方式:G7-Fc为GW01 VL-(G4S)3-GW01 VH-(G4S)4-7F3 VL-(G4S)3-7F3 VH-Hinge-CH2-CH3
阅读提示:Methods:Construction of bsAbs
中和试验
细胞系:Huh-7;假病毒孵育时间:12小时;发光检测:48小时后;稀释:5倍系列稀释
阅读提示:Methods:Neutralization assay
冷冻电镜结构解析
复合物形成比例:1:1.3摩尔比;孵育条件:4°C 0.5小时;纯化:凝胶过滤;样品浓度:0.5 mg/mL
阅读提示:Methods:Formation of BA.2.86 S-G7-Fc complex, Cryo-EM sample preparation
体内实验
小鼠品系:K18-hACE2转基因小鼠(5-6周龄雌性);给药剂量:i.p. 200 μg/小鼠,i.n. 20 μg/小鼠;感染剂量:105 FFU EG.5;给药时间:感染前或感染后24小时
阅读提示:Methods:Evaluation of the prophylactic and therapeutic efficacy of G7-Fc in vivo